葡萄无核性状SSR标记的验证及葡萄乙烯释放量全基因组关联分析

发布时间：2023-04-10 23:00

　　无核葡萄因其食用方便,深受消费者的青睐。人们对无核葡萄形成的原因做了大量的研究,但是葡萄无核的遗传机理还不清楚。本文通过利用已经开发的无核相关的4个SSR分子标记P1_VvAGLL11、P2_VvAGLL11、P3_VvAGLL11和VMC7F2在90份鲜食葡萄品种中进行验证,旨在找到葡萄无核性状检验通用率高的分子标记,来辅助无核品种的选育,提高育种效率。乙烯在葡萄果实成熟中起着重要的作用,对葡萄贮藏中果粒的脱落和穗轴的褐化也起着一定的调控作用。为了解葡萄的果粒和穗轴的乙烯释放规律,发掘与葡萄果粒和穗轴乙烯释放量性状相关的优异等位变异。本研究以62个自然群体葡萄品种为材料,利用全基因组关联分析(GWAS)的方法以79对SSR引物对该自然群体的进行分析,寻找与葡萄乙烯释放相关的分子标记。本研究的主要结果如下:1.在用四个无核SSR分子标记进行验证发现,VMC7F2在验证群体中并没有差异。而P1_VvAGLL11、P2_VvAGLL11、P3_VvAGLL11三个标记经过...

【文章页数】：57 页

【学位级别】：硕士

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致谢
缩略词 Abbreviation
摘要
第一章 文献综述
    1 葡萄的起源与发展
    2 无核葡萄研究
        2.1 无核葡萄概况
        2.2 无核葡萄形成机理与遗传机制
    3 乙烯的研究进展
        3.1 乙烯对植物的作用和影响
        3.2 乙烯的生物合成过程
        3.3 葡萄中乙烯的研究进展
    4 关联分析
        4.1 关联分析的原理和方法
        4.2 关联分析的研究策略与优点
    5 本研究的目的和技术路线
        5.1 研究目的
        5.2 技术路线
第二章 葡萄无核性状的SSR标记验证
    1 引言
    2 材料与方法
        2.1 试验材料
        2.2 试验方法
            2.2.1 植物组织DNA提取
            2.2.2 PCR反应体系的建立
            2.2.3 PCR反应条件
            2.2.4 聚丙烯凝胶的制备与电泳
            2.2.5 SSR分子数据统计
            2.2.6 SSR分子标记数据分析
    3 验证结果与分析
        3.1 SSR标记P1_VvAGLL11扩增结果的统计分析
        3.2 SSR标记P2_VvAGLL11扩增结果的统计分析
        3.3 SSR标记P3_VvAGLL11扩增结果的统计分析
        3.4 SSR标记VMC7F2扩增结果的统计分析
        3.5 群体遗传多样性分析
    4 讨论与结论
        4.1 讨论
        4.2 结论
第三章 葡萄乙烯释放量全基因组关联分析
    1 引言
    2 材料与方法
        2.1 试验材料
        2.2 试验方法
            2.2.1 乙烯释放速率的测定分析(GC法)
            2.2.2 叶片组织基因组DNA提取与检测
            2.2.3 PCR反应体系建立
            2.2.4 聚丙烯酰胺凝胶的制备与电泳
            2.2.5 分子标记数据统计与分析
            2.2.6 群体结构分析
            2.2.7 连锁不平衡(LD)分析
            2.2.8 利用GLM进行关联分析
            2.2.9 利用MLM进行关联分析
    3 结果与分析
        3.1 果粒乙烯释放速率测定结果分析
        3.2 穗梗乙烯释放速率测定结果分析
        3.3 SSR引物的多态性筛选
        3.4 SSR引物的遗传多样性及群体分析
            3.4.1 分子数据统计与分析
            3.4.2 群体结构分析
        3.5 关联分析
            3.5.1 连锁不平衡分析
            3.5.2 不同模型的比较
        3.6 关联分析结果分析
        3.7 VVIN70扩增序列验证
    4 讨论与结论
        4.1 讨论
        4.2 结论
参考文献
附表1 引物信息
英文摘要



本文编号：3788886