矩阵设计检测金针菇转化子外源DNA插入位点

发布时间：2023-04-28 05:01

　　插入位点分析对于金针菇功能基因组学的研究极为重要,分析方法常用反向PCR、热不对称交错PCR、Tail-PCR、染色体步移等,存在操作复杂、消耗时间长、特异性较差、效率低等缺点。近年来开始应用基因组重测序的方法,对转化子逐一测序与分析,工作量较大、费用较高。本研究应用矩阵设计,把多个转化子的DNA混合构成样品池,重测序后分析插入位点,M个样品池的测序数据可分析M×(M+1)/2个转化子的插入位点。应用矩阵设计构建6个样品池检测21个转化子,获得21个插入位点,表明这种方法可行、适合大样本分析,如突变体库。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 供试菌株
    1.2 DNA提取与PCR检测
    1.3 矩阵设计样品池
    1.4 基因组重测序
    1.5 插入位点分析
2 结果与分析
    2.1 DNA样品检测与转化子鉴定
    2.2 插入位点分析
    2.3 插入位点PCR验证
3 讨论



本文编号：3803792