枣高密度遗传连锁图谱构建与农艺性状QTL定位
发布时间:2023-05-30 20:27
枣(Ziziphus jujuba Mill.)是我国特有传统经济林果,枣产业是支撑我国乡村振兴和农民脱贫的重要产业。然而,随着枣产区的西移,鲜食枣特色明显,产业稳步发展,急需新格局下的品种支撑。而枣主要通过农家选优和实生选育进行品种培育,为了更好地突破枣树杂交育种的理论和技术,本研究以品质为目标,以优质鲜食品种‘冬枣’为母本和干鲜兼用品种‘金丝4号’为父本,进行人工控制自然杂交,利用SSR分子标记,构建F1代杂交群体,采用GBS(Genotyping-by-Sequencing)简化基因组测序技术开发SNP(Single Nucleotide Polymorphism)分子标记,依据‘冬枣’和‘骏枣’全基因组测序数据,构建枣高密度遗传连锁图谱,评价群体枣树叶片、针刺和果实等重要性状表型,鉴定其相关的数量性状位点(Quantitative Trait Loci,QTL),分析群体果实重要性状遗传变异规律,通过主成分分析筛选优株,为枣品种遗传改良提供理论基础。取得的主要结论如下:1. 人工控制自然杂交,获得201株‘冬枣’实生后代,采用多态性信息含量PIC值较高(&...
【文章页数】:133 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 遗传图谱概述
1.1.1 遗传图谱构建原理
1.1.2 枣遗传图谱构建方法
1.2 枣高密度遗传连锁图谱构建研究
1.3 枣树性状QTL定位研究
1.3.1 QTL定位原理
1.3.2 枣树QTL定位研究情况
1.4 本研究的目的和意义
1.4.1 目的意义
1.4.2 主要研究内容
1.4.3 技术路线
第二章 ‘冬枣’与‘金丝4号’杂交群体构建
2.1 材料与方法
2.1.1 试验材料
2.1.2 试验方法
2.2 研究结果
2.2.1 引物筛选
2.2.2 杂交后代的鉴别
2.3 讨论
2.3.1 引物筛选
2.3.2 亲本选择
2.4 小结
第三章 基于SNP标记的枣高密度遗传连锁图谱构建
3.1 材料和方法
3.1.1 试验材料
3.1.2 试验方法
3.2 结果与分析
3.2.1 测序数据质量评估
3.2.2 数据比对
3.2.3 SNP检测与基因分型
3.2.4 构建连锁图谱
3.2.5 共线性分析
3.3 讨论
3.3.1 标记开发
3.3.2 图谱构建
3.4 小结
第四章 枣农艺性状QTL定位
4.1 材料和方法
4.1.1 试验材料
4.1.2 表型指标测定
4.1.3 QTL定位
4.1.4 数据统计与绘图
4.2 结果与分析
4.2.1 农艺性状分析
4.2.2 QTL分析
4.3 讨论
4.3.1 QTL定位准确性
4.3.2 叶片和针刺性状QTL定位
4.3.3 果实性状QTL定位
4.4 小结
第五章 枣杂交子代果实性状综合评价及优株筛选
5.1 材料方法
5.1.1 性状调查
5.1.2 仪器设备
5.1.3 测试方法
5.1.4 统计分析
5.2 结果与分析
5.2.1 群体结果期
5.2.2 果实形状的变异分析
5.2.3 果实性状的遗传参数估计
5.2.4 果实品质性状的相关性分析
5.2.5 果实品质性状的主成分分析
5.3 讨论
5.3.1 果实遗传分析
5.3.2 群体评价方法
5.4 小结
第六章 结论
6.1 结论
6.2 主要创新点
附录
参考文献
致谢
个人简历
本文编号:3824981
【文章页数】:133 页
【学位级别】:博士
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摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 遗传图谱概述
1.1.1 遗传图谱构建原理
1.1.2 枣遗传图谱构建方法
1.2 枣高密度遗传连锁图谱构建研究
1.3 枣树性状QTL定位研究
1.3.1 QTL定位原理
1.3.2 枣树QTL定位研究情况
1.4 本研究的目的和意义
1.4.1 目的意义
1.4.2 主要研究内容
1.4.3 技术路线
第二章 ‘冬枣’与‘金丝4号’杂交群体构建
2.1 材料与方法
2.1.1 试验材料
2.1.2 试验方法
2.2 研究结果
2.2.1 引物筛选
2.2.2 杂交后代的鉴别
2.3 讨论
2.3.1 引物筛选
2.3.2 亲本选择
2.4 小结
第三章 基于SNP标记的枣高密度遗传连锁图谱构建
3.1 材料和方法
3.1.1 试验材料
3.1.2 试验方法
3.2 结果与分析
3.2.1 测序数据质量评估
3.2.2 数据比对
3.2.3 SNP检测与基因分型
3.2.4 构建连锁图谱
3.2.5 共线性分析
3.3 讨论
3.3.1 标记开发
3.3.2 图谱构建
3.4 小结
第四章 枣农艺性状QTL定位
4.1 材料和方法
4.1.1 试验材料
4.1.2 表型指标测定
4.1.3 QTL定位
4.1.4 数据统计与绘图
4.2 结果与分析
4.2.1 农艺性状分析
4.2.2 QTL分析
4.3 讨论
4.3.1 QTL定位准确性
4.3.2 叶片和针刺性状QTL定位
4.3.3 果实性状QTL定位
4.4 小结
第五章 枣杂交子代果实性状综合评价及优株筛选
5.1 材料方法
5.1.1 性状调查
5.1.2 仪器设备
5.1.3 测试方法
5.1.4 统计分析
5.2 结果与分析
5.2.1 群体结果期
5.2.2 果实形状的变异分析
5.2.3 果实性状的遗传参数估计
5.2.4 果实品质性状的相关性分析
5.2.5 果实品质性状的主成分分析
5.3 讨论
5.3.1 果实遗传分析
5.3.2 群体评价方法
5.4 小结
第六章 结论
6.1 结论
6.2 主要创新点
附录
参考文献
致谢
个人简历
本文编号:3824981
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