酥瓜种质资源遗传多样性分析
发布时间:2023-05-30 20:38
酥瓜(Cucumis melo var.conomon Group)是葫芦科甜瓜属甜瓜种薄皮甜瓜的一个变种,品种丰富、性状差异大,具有独特“酥脆”风味。酥瓜种植主要集中在江淮平原,少量分布于其他地区。为了明确酥瓜品种之间的亲缘关系,选育优良品种,有必要对酥瓜种质资源进行分类定位、系统分析。本研究从我国江淮流域收集到104份酥瓜种质,通过运用RAPD、ISSR和SSR三种分子标记方法对其进行聚类分析,以明确种质间的亲缘关系。主要研究结果如下:(1)以改良的CTAB法提取酥瓜基因组DNA,建立了适合酥瓜RAPD-PCR反应体系:在25μL反应体系中,含有引物0.8μmol/L、dNTPs 0.3μmol/L、Taq DNA聚合酶1 U、Mg2+0.5 mmol/L、DNA模板30 ng。酥瓜ISSR-PCR反应体系:在20μL反应体系中,含有引物0.2μmol/L、dNTPs 0.3 mmol/L、Taq DNA聚合酶1.2 U、Mg2+1.0 mmol/L、DNA模板70 ng、10×Buffer 2.0μL。酥瓜SSR-PCR反应体系:在20...
【文章页数】:61 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
致谢
摘要
Abstract
1 文献综述
1.1 遗传多样性的概念及研究意义
1.1.1 遗传多样性的概念
1.1.2 遗传多样性的意义
1.2 遗传多样性的研究方法
1.2.1 形态学标记
1.2.2 细胞学标记
1.2.3 生化标记
1.2.4 分子标记
1.3 不同分子标记在甜瓜遗传育种研究中的应用
2 引言
3 酥瓜基因组DNA提取及RAPD分子标记反应体系的建立
3.1 材料与方法
3.1.1 试验材料与试剂
3.1.2 基因组DNA提取
3.1.3 RAPD-PCR反应体系的正交试验
3.1.4 退火温度的确定
3.1.5 优化扩增体系的验证
3.2 结果与分析
3.2.1 基因组DNA提取
3.2.2 正交试验
3.2.3 退火温度的优化
3.2.4 最佳反应体系和退火温度的验证
3.3 讨论
4 酥瓜ISSR-PCR反应体系建立与优化
4.1 材料与方法
4.1.1 试验材料和试剂
4.1.2 基因组DNA的提取
4.1.3 PCR扩增与正交试验
4.1.4 退火温度的确定
4.1.5 ISSR-PCR优化扩增体系的验证
4.2 结果与分析
4.2.1 ISSR-PCR扩增结果分析
4.2.2 极差分析
4.2.3 不同退火温度对ISSR扩增的影响
4.2.4 最佳反应体系和退火温度的验证
4.3 讨论
5 酥瓜SSR-PCR分子标记反应体系的建立
5.1 材料与方法
5.1.1 试验材料和试剂
5.1.2 基因组DNA的提取
5.1.3 PCR扩增与正交试验
5.1.4 聚丙烯酰氨凝胶电泳
5.1.5 退火温度的确定
5.1.6 SSR-PCR优化扩增体系的验证
5.2 结果与分析
5.2.1 SSR-PCR扩增结果分析
5.2.2 极差分析
5.2.3 不同退火温度对SSR扩增的影响
5.2.4 最佳反应体系和退火温度的验证
5.3 讨论
6 基于分析分子标记的酥瓜种质资源遗传多样性
6.1 材料和方法
6.1.1 试验材料和基因组DNA的提取
6.1.2 RAPD、ISSR和SSR扩增
6.1.3 数据分析
6.2 结果与分析
6.2.1 RAPD、ISSR和SSR多态性分析
6.2.2 聚类分析
6.2.3 主成分分析
6.3 讨论
7 全文结论
参考文献
个人简介
攻读硕士学位期间发表学术论文及申请专利
附表
本文编号:3824998
【文章页数】:61 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
致谢
摘要
Abstract
1 文献综述
1.1 遗传多样性的概念及研究意义
1.1.1 遗传多样性的概念
1.1.2 遗传多样性的意义
1.2 遗传多样性的研究方法
1.2.1 形态学标记
1.2.2 细胞学标记
1.2.3 生化标记
1.2.4 分子标记
1.3 不同分子标记在甜瓜遗传育种研究中的应用
2 引言
3 酥瓜基因组DNA提取及RAPD分子标记反应体系的建立
3.1 材料与方法
3.1.1 试验材料与试剂
3.1.2 基因组DNA提取
3.1.3 RAPD-PCR反应体系的正交试验
3.1.4 退火温度的确定
3.1.5 优化扩增体系的验证
3.2 结果与分析
3.2.1 基因组DNA提取
3.2.2 正交试验
3.2.3 退火温度的优化
3.2.4 最佳反应体系和退火温度的验证
3.3 讨论
4 酥瓜ISSR-PCR反应体系建立与优化
4.1 材料与方法
4.1.1 试验材料和试剂
4.1.2 基因组DNA的提取
4.1.3 PCR扩增与正交试验
4.1.4 退火温度的确定
4.1.5 ISSR-PCR优化扩增体系的验证
4.2 结果与分析
4.2.1 ISSR-PCR扩增结果分析
4.2.2 极差分析
4.2.3 不同退火温度对ISSR扩增的影响
4.2.4 最佳反应体系和退火温度的验证
4.3 讨论
5 酥瓜SSR-PCR分子标记反应体系的建立
5.1 材料与方法
5.1.1 试验材料和试剂
5.1.2 基因组DNA的提取
5.1.3 PCR扩增与正交试验
5.1.4 聚丙烯酰氨凝胶电泳
5.1.5 退火温度的确定
5.1.6 SSR-PCR优化扩增体系的验证
5.2 结果与分析
5.2.1 SSR-PCR扩增结果分析
5.2.2 极差分析
5.2.3 不同退火温度对SSR扩增的影响
5.2.4 最佳反应体系和退火温度的验证
5.3 讨论
6 基于分析分子标记的酥瓜种质资源遗传多样性
6.1 材料和方法
6.1.1 试验材料和基因组DNA的提取
6.1.2 RAPD、ISSR和SSR扩增
6.1.3 数据分析
6.2 结果与分析
6.2.1 RAPD、ISSR和SSR多态性分析
6.2.2 聚类分析
6.2.3 主成分分析
6.3 讨论
7 全文结论
参考文献
个人简介
攻读硕士学位期间发表学术论文及申请专利
附表
本文编号:3824998
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