玉木耳转录组测序及褐变相关基因的挖掘

发布时间：2023-11-11 14:26

　　为了从分子水平研究玉木耳褐变的机理,对褐变和未褐变的玉木耳子实体进行了转录组测序分析,共筛选到5915个差异基因,其中有924个Unigene上调表达,有4991个Unigene下调表达。通过基因本体(Gene Ontology, GO)富集分析发现,差异基因显著富集于细胞及代谢过程、单一有机体、细胞和细胞组分、细胞器和大分子复合体、结合作用和催化活性。KEGG代谢通路富集分析表明,富集程度比较显著的通路包括翻译通路、信号转导途径、内分泌系统、折叠排序及退化、运输和分解代谢通路。挑选与组织褐变相关的差异基因进行qRT-PCR表达模式验证,获得的结果与表达谱分析结果一致。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 总RNA的提取、cDNA文库构建及转录组测序
    1.3 序列组装
    1.4 基因注释
    1.5 差异表达基因分析
    1.6 qRT-PCR验证测序结果
2 结果与分析
    2.1 转录组测序数据组装及统计
    2.2 转录组Unigene的功能注释
    2.3 Unigene的功能注释和分类
    2.4 差异表达基因KEGG富集分析
    2.5 转录组的实时荧光定量PCR验证
3 讨论



本文编号：3862721