核桃谱系地理学和转录组学遗传标记开发研究

发布时间：2024-01-27 14:08

　　核桃Uuglans regia)为胡桃属植物中的模式种,分布范围广泛,栽培历史悠久且具有很高的食用和药用价值。长期以来核桃复杂的遗传背景与重要的价值是学者关注的焦点。目前,对核桃植物进行研究的报道主要集中在形态学、解剖学、胚胎学、细胞学和孢粉学等方面。应用分子标记技术对胡桃属植物进行研究的报道也仅限于个别种的少数群体或个体,采用的分子遗传标记也大多是通用引物,其多态性及所含的遗传信息都比较有限。因而通过分子标记手段对核桃全国不同地理群体的遗传多样性进行研究以及开发出更多遗传信息丰富的标记的研究是有必要的。本研究一方面通过DNA测序技术,利用单亲遗传细胞质分子标记及双亲遗传的核DNA片段进行核桃谱系地理学探讨；另一方面基于Illumina HiSeqTM高通量测序平台,对核桃的叶片、花芽、雌花及雄花四种器官进行转录组测序,获得4.98 G数据,随后利用生物信息学方法对数据进行了重头组装、拼接、注释及相关生物信息学分析,并利用核桃不同Unigene中微卫星序列开发易扩增、多态性好的EST-SSR引物。通过上述两方面的研究分析,为核桃群体进化历史、遗传标记及其种质资源的开发利用和保护提供理论...

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【学位级别】：硕士

图２－１０基于ＩＴＳ的ＭＰ輯与单倍型网络分布困??ＦｉｔｌＯ?Ｒｅｓｕｌｔｓ?ｏｆ?ＭＰ?ｔｒｅｅＡａｎｄ?ＮｅｔｗｏｒｋＢ）?ｂａｓｅｄ?ｏｎ?ＩＴＳ?ｄａｔａｓｅｔ??

图２－：ｌ?１基于／化Ｄ５Ｍ

图１３Ｂ），单倍型Ｈ５、Ｈ７?（橘黄色）为核桃群体的??

图２－１４?基于（Ａ）与（Ｂ）的ＭＬ衍??Ｆｉｇ２－１４?Ｃｏｎｓｔｒｕ化ｄ?ｏｆ?ＭＬ／ＮＪ?ｔｒｅｅ?ｂａｓｅｄ?ｏｎ?／化Ｚ＞＊５６《０?（Ａ）?ａｎｄ?１５Ｒ－８?（Ｂ）?ｄａｔａｓｅｔ??

本文编号：3887109