葡萄IQD家族的分析及VvSUN基因的功能验证

发布时间：2024-12-01 07:47

　　葡萄(Vitis Vniera)是葡萄科(Vitaceae)葡萄属(Vitis)落叶果树。在我国广泛种植,具有较高的营养价值,也深受消费者喜爱。随着消费水平的提高,一些常规品种已不能满足消费者的需求,人们开始追求新奇、特殊的高品质果实。果实形状作为重要的外观品质,也越来越受到消费者和生产者的关注,同样也赋予了果形分子研究以意义。SUN基因是番茄中控制果形的主效QTL位点,该基因的突变品种呈椭圆形。SUN基因属于IQD基因家族一员,IQD蛋白是一类钙调素结合蛋白,在拟南芥、水稻、番茄等植物中均有报道。该家族成员众多,在多种植物中均有表达,推测其具有广泛功能。本研究对葡萄IQD基因家族进行了全面的鉴定和生物信息学分析,并挑选VvSUN(VvIQD7)基因,从葡萄品种'天山'中克隆得到可能与果形相关的该基因,并将该基因转化番茄进行功能初步验证。主要研究结果如下:1.对葡萄IQD基因家族进行全面的鉴定并进行生物信息学分析,以期为该家族基因的功能研究奠定基础。本研究共鉴定出16个IQD基因,命名为VvIQDs,不均匀地分布在19条染色体中的10条上,编码137-634个氨基酸,等电点在9.63-1...

【文章页数】：83 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２－１?Ｆｖ／０Ｄ基因的染色体定位??Ｆｉｇ．?２－１?Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ＶｖＩＱＤ?ｇｅｎｅｓ??

２．２?Ｆｖ／以＾基因染色体定位??染色体定位结果（表２－１）表明，１６条ＦＶ／０Ｚ）基因共位于１０条染色体上。用??Ｍａｐｌｎｓｐｅｃｔ软件绘制基因在染色体上的物理位置，如图２－１。其中和作／＾＞４，??Ｆｖ／以）７和和Ｋｖ／０Ｄ／５的物理位置较近，位于同一条??染色体上。Ｆｖ....

图２－２?ＶｖｌＱＤ蛋白的保守结构域的氨基酸序列??Ｆｉｇ．?２－２?Ａｍｉｎｏ?ａｃｉｄ?ｓｅｑｕｅｎｃｅ?ｃｏｎｓｅｒ?

２．４?ＶｖＩＱＤｓ蛋白保守结构域分析??利用ＣｌｕｓｔａｌＸ软件对１６条ＶｖｌＱＤ蛋白序列进行比对，根据ＩＱ６７结构域特点，??查找到ＩＱ６７保守结构域（图２－２）。结果显示，ＩＱ６７结构域较保守。第一个和第：个，??第二个和第三个ＩＱ基序分别间隔１１、１５个氨基酸。第一个和第....

图2-3脚IQD基因的系统进化和基因结构分析

使用邻接算法（Ｎｅｉｇｈｂｏｒ－Ｊｏｉｎｉｎｇ），根据ＶｖＩＱＤ全长氨基酸序列进行比对分析，构??建葡萄ＩＱＤｓ系统进化树（图２－３）。根据拟南芥１ＱＤ蛋白家族分类，可将ＶｖＩＱＤ家族??蛋白分为四大类Ｉ－ＩＶ。其中ＩＩＩ类包含的基因较少，只含有２个基因，说明该分支内??基因进化....

图３－１?Ｋｖ．ｗ／Ｖ基因扩增结果??Ｍ：?ＤＮＡ２０００?ｍａｒｋｅｒ；丨：ＦｖＳＷＶ基因片段扩增产物??

２结果与分析??２．１葡萄ＫｖＳＯＴＶ基因的克隆??以‘天山’葡萄花期为材料，扩增出一条１０００?ｂｐ左右的片段（图３－１）。测序并在??ＮＣＢＩ上比对分析表明，该片段包含完整的开放阅读框，长度为１２７８?ｂｐ（图３－２）。起??始密码子为ＡＴＧ，终止密码子为ＴＧＡ。??ｒｎａｍ....

本文编号：4013781