小麦赤霉病菌Rab互作溶酶体蛋白对DON毒素生物合成的影响
【学位授予单位】:河南工业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2019
【分类号】:S435.121.45;TQ455;TS201.6
【图文】:
2 材料与方法 实验材料.1 供试菌株禾谷镰刀菌野生型(PH-1)菌株由许金荣博士赠予。大肠杆菌菌株 DH5α, AH109 由福建农林大学功能基因组学研究中心王宗华研究员惠赠。.2 致病性鉴定材料小麦种子(郑麦矮抗 58 号)从河南省农业科学院购买,西红柿由郑州市高小麦麦穗在郑州高新区采摘。.3 质粒载体pKNT-RP27-GFP、pGBKT7、pGADT7 载体,由福建农林大学功能基因组学赠,本实验室保存,质粒图谱如图 1 所示。
名为 FgRILP,其 ORF 全长为 3742bp,cDNA 为 3579bp,编码含有 1192 个氨基酸的蛋白。利用 NCBI 上的 CDD 功能对 FgRILP 蛋白进行保守域分析(图 2),发现 FgRILP具有多个保守域,在 175-273aa 区间有一个 NST1 保守域,NST1 属盐耐受调节因子,推测该基因在盐胁迫下具有调控作用;在 568-691aa 区间有一个 TolA_full 的保守域结构,TolA 将自身的内膜复合体与 TolQ 和 TolR 偶联到 TolB 和 Oprl 的外膜复合体(又称 PAl),Tol-PAl 复合物是维持外膜完整性所必需的,推测该保守域与物质转运和致病性相关;在 577-807aa 区间有一个 MIP-T3(Microtubule-binding protein)蛋白,其 N末端区域是微管结合结构域并且是保守的,C 末端 100 个残基也很保守,构成了与TRAF3 结合的卷曲螺旋区。在 709-1018aa 区间存在 Atrophin-1 蛋白保守域,该蛋白在动物中是进行性神经退行性疾病基因(Dentatorubral-pallidoluysian atrophy gene-DRPLA)的蛋白产物,其中 CAG(谷氨酰胺)重复序列与致病性相关,该保守域在真菌中的功能未知。
运用 softberry 在线软件中的 protein localization 分析显示,该基因编码的蛋白定位在细胞质(图 4)。XP 003042199.1 hypothetical protein NECHADRAFT 81283 Nectria haematococca mpVI 77-13-4KKP05144.1 hypothetical protein THAR02 02739 Trichoderma harzianumXP 013947360.1 hypothetical protein TRIATDRAFT 171742 partial Trichoderma atroviride IMI 20KFG80470.1 stress response protein nst1 Metarhizium anisopliaePOR33676.1 Stress response protein NST1 Tolypocladium paradoxumPNY25131.1 Stress response protein NST1 Tolypocladium capitatum100100870.05注:禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum)、黄色镰孢菌(Fusarium culmorum)、长柄镰刀菌(Fusariulangsethiae)、黎孢镰刀菌(Fusarium pose)、燕麦镰孢菌(Fusarium avenaceum)、尖孢镰刀菌(Fusariuoxysporum)、血链球菌(Nectria haematococca)、串珠镰刀菌(Fusariμm verticillioides)、层生镰刀菌(Fusariuproliferatum)、水稻恶苗病菌(Fusarium fujikμroi)、哈茨木霉(Trichoderma harzianum)、绿僵菌(Metarhiziuanisopliae)、绿色木霉(Trichoderma viride)、头状虫草(Tolypocladium capitatum)、大团囊虫草(Tolypocladiuparadoxum)。图 3 FgRILP 系统发育树FIg. 3 Phylogenetic tree of FgRILP
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本文编号:2771718
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