光对海洋放线菌代谢物合成的影响及关键菌株基因组挖掘

发布时间：2021-03-04 16:43

　　由于海洋环境的特殊性,海洋放线菌可能具有独特的代谢特征,其合成的次生代谢物是多种新天然产物和活性物质的重要来源,因此,利用海洋放线菌生产次生代谢物得到了国内外研究者的广泛关注。已知多种环境条件可影响放线菌合成次生代谢物,但是光照的作用到目前为止研究很有限。基于分子网络策略的质谱分析平台GNPS（Global Natural Product Social Molecular Networking）可用于在高效液相质谱检测大量样品后快速筛选到目标产物或排除重复发现的物质,并且有助于发现并鉴定已知化合物的新颖类似物。另一方面,利用基因组挖掘可加速新天然产物的发现,但目前对海洋放线菌基因组挖掘的研究还比较有限。基因组测序技术的快速发展使微生物天然产物的生物合成基因信息更易获得,并深入开发微生物的生物合成潜力,但是利用基因信息快速确定和分离鉴定预测的化合物仍然存在挑战。因此,结合GNPS平台和基因组挖掘技术可有助于加速研究和开发海洋放线菌天然产物的生物合成潜力。本文首先利用高效液相质谱技术结合GNPS分子网络分析平台,研究了光照和黑暗条件下63株海洋放线菌次生代谢物的合成情况。结果表明,光照对放... 

【文章来源】：大连理工大学辽宁省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

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【部分图文】：

GNPS数据比对的原理及过程p71

?大连理工大学博士学位论文???菌和微球菌（Ｍ／ｃｒｏｃｏｃｃｉｗ）１？１。放线菌包含了很广泛的形态，从球菌（例??如微球菌）或杆菌（例如节杆菌〇４ｒ／／？ｒｏＺｗｃ＾ｒ））至片段化菌丝形式（例如诺卡氏菌属??或永久性的高度分化的支链菌丝体（例如链霉菌）。它们同样有着多样化的??生理和代谢特性，如胞外酶和多样化的次生代谢产物１＂１。值得注意的是，许多次级代谢??产物是有效的抗生素这将链霉菌属变为制药工业的主要抗生素生产生物［１（）１】。??

Ｓ由一系列的模块顺次排列组成，大多数ＮＲＰＳ的模块数为４？１０个，但个的，每个组件又由不同的结构域构成。模块的特异结构域具有特定的酶单体结合到新生链肽中。这其中主要包括识别、激活氨基酸的腺苷酰化结ｉｏｎ／Ａ－ｄｏｍａｉｎ），将氨基酸通过硫醋键连接在酶分子的疏基结构域（ｔｈｉｏｌａｔｉｏ通过肽键将氨基酸连接在肽链上的缩合结构域（ｃｏｎｄｅｎｓａｔｉｏｎ／Ｃ－ｄｏｍａｉｎ）。责氧基酸修饰的差相异构化结构域（ｅｐ?ｉｍｅｒａｓｅ／Ｅ－ｄｏｍａｉｎ）、甲基化结ｉｏｎ／Ｍ－ｄｏｍａｉｎ）和负责解离终产物的硫醋结构域（ｔｈｉｏｅｓｔｅｒａｓｅ／Ｔｅ－ｄｏｍａｉｎ）。Ｎ成是Ａ－ＰＣＰ－（Ｃ－ＡＰＣＰ）ｎ－Ｔｅ，其中一些模块附加了定制域。在肽合成的每７）中，Ａ结构域特异性结合其同源底物，并首先通过腺苷酸化活化，然后ＣＰ结构域的４’－磷酸泛酰乙烯基（ＰＰＥ）臂上。当前和以前模块的ＰＣＰ结构合的底物转运到Ｃ结构域的活性位点。Ｃ结构域催化两个底物之间的肽键生长的肽链转移到受体ＰＣＰ结构域时延长生长的肽链。在该缩合反应之后，连接到当前模块的ＰＣＰ结构域的ＰＰＥ臂）携带到下一个模块的Ｃ结构域，的缩合反应中进行转移。这两者都释放了?ＰＣＰ结构域，以参与当前模块内


本文编号：3063551