农药相关数据库的信息整合及稳定G—四链的农药小分子类似物发掘

发布时间：2021-10-07 11:54

　　数据库的发展极大地促进了科学研究,整合特定研究领域多种数据库的信息,获得全面的信息,便于在研究中做出科学的决策。在过去的40年里,人们建立了几十个与农药相关的开放访问数据库,这些数据库收集了农药的活性、毒性、作用机制和环境风险等信息。但,这些数据分散在不同的农药数据库中,而且数据内容重叠且格式不一,不利于创新农药的研究。系统地分析现有开放访问农药数据库中的内容,提取有用信息,并将其整合,有助于在农药研发的过程中做出正确的决策。本研究收集和梳理了现有的开放访问农药数据库中的具体内容,并根据现代农药研究需要的具体信息,将多个农药数据库中的内容整合到一站式的农药信息资源网站Pesticide Information Center（PIC,weilab.hzau.edu.cn）中,为用户提供全面、非冗余的农药信息资源。基于小分子结构的相似性,PIC可用于预测新农药分子的可能的靶点。并且,基于PIC中的农药分子与G-四链体配体分子的相似性,本研究发现了具有抗肿瘤活性的、靶向G-四链体的农药小分子类似物。本论文的主要研究如下:1.梳理和整理了25个农药相关的开放访问数据库中的内容,并将这些数据归属... 

【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：84 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

农药研究的创新和优化过程(Lamberthetal2013)

图 1.2 农药研发的三个阶段和时间轴Fig. 1.2 Three stages and timelines for pesticide development2.2 开放访问农药数据库在农药研发过程中的作用在 2.1 中介绍的每一个农药研发阶段，都会产生海量的数据和信息，这些数有利于在农药研发的过程中做出决策，具有非常重要的参考价值。开放访问的农数据库则存储了这些数据，并允许用户免费地读取、复制、下载、打印或在其它律允许范围内使用(Williams 2008)，在靶标选择、先导识别、先导优化和候选化合选择等方面发挥着重要作用(Gaulton et al 2010)。在合理的农药分子设计初期，分析与病虫害相关的基因组信息，了解涉及到蛋白序列和核酸序列的信息，确定与病虫害相关的靶标，并分析靶标分子的结构

农药相关数据库的信息整合及稳定 G-四链体的农药小分子类似物发掘医药的相似性子与医药分子结构相似性以及其作用靶点的相似一词在公众的心目中往往是剧毒、高污染的代名词。然而部分新型农药具有较高的选择性，因此在安全性方面得到药具有很多相似的特征，包括结构、物理化学性质和靶点on et al 2011, Jampilek 2016)。科研人员在生物活性测试时合物具有农药活性，反之亦然。农药分子和医药分子在结药分子中最常见的 20 种化学侧链与医药分子的相同。图农药分子和医药分子。

【参考文献】：
硕士论文
[1]分子对接程序重构G-四链体—配体小分子复合物的能力评价[D]. 侯海涛.华中农业大学 2018



本文编号：3421994