β-乳球蛋白与川陈皮素相互作用机制研究
【学位授予单位】:华中农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2019
【分类号】:TS201.21
【图文】:
考虑到结合过程中蛋白质结合位点的构象改变,此模型只能用于解存在微小构象改变的蛋白质-配体结合模式。“锁钥模型”和“诱导契合中的蛋白质构象看作独立且稳定,而忽略了大多数蛋白质构象在本进而,“构象选择(Conformation selection)”理论被提出(Tobi et al 200种模型,“构象选择”理论考虑到蛋白质自身的灵活性,其假定蛋白状态下并不是独立的、稳定的,而是以各种不同构象存在达到平衡件下,配体可以选择与其最匹配的蛋白质构象结合,最终蛋白质构能与配体结合的蛋白质构象转移。换句话说,也就是未结合配体的朝着能与配体结合构象转变的。其后的研究中,关于分子识别认识也不断深入。研究发现蛋白质与二者间的互补性高,主要包括能量及空间结构相关互补。基于“构象们可以得知:蛋白质与配体分子形成复合物的过程中,会导致二者化性质的改变。因此,从分子水平上探究蛋白质与配体间的相互作白质功能、设计基于蛋白质结构的营养、药物载体可起到一定的参考
提供了理论基础。分子动力学模拟软件有 AMBER(Case et al 2005, Pearlman et aBrooks et al 2009)、GROMOS(Christen et al 2005)以及 NAMD(Ph子动力学模拟相关的结构一般基于分子对接得到。在此操作中定条件的盒子中,加入平衡离子进行中和处理保持电中性;然术优化体系结构,接着在一定温度下模拟分析分子动力特征同接着在算法分析基础上,确定出蛋白的构象变化情况,同时对。球蛋白球蛋白的结构
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本文编号:2723775
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