生姜中辛辣化合物激活TRPV1的结构机制研究
【学位单位】:青岛大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2019
【中图分类】:TS201.2
【部分图文】:
图 1.辣椒素和生姜辛辣化合物的结构比较A. 辣椒素结合口袋的放大视图,显示辣椒素-TRPV1 相互作用的结构模型。辣椒素分子用粉红色来表示,颈部和头部形成氢键的基团分别以红色和橙色显示。TRPV1 以米色显示,辣椒素与两个残基,T551 和 E571 形成氢键,分别以红色和橙色突出显示。 B. 辣椒素、6-姜烯醇、6 姜酚和姜酮的化学结构。所有四种化合物都具有香草基部分并且在结构上相似,不同之处在于颈部和尾部侧链。
图 1.辣椒素和生姜辛辣化合物的结构比较辣椒素结合口袋的放大视图,显示辣椒素-TRPV1 相互作用的结构模型。辣椒素分子色来表示,颈部和头部形成氢键的基团分别以红色和橙色显示。TRPV1 以米色显示,与两个残基,T551 和 E571 形成氢键,分别以红色和橙色突出显示。 B. 辣椒素、6-6 姜酚和姜酮的化学结构。所有四种化合物都具有香草基部分并且在结构上相似,在于颈部和尾部侧链。
. 生姜化合物与辣椒素结合口袋结合为了研究生姜化合物激活 mTRPV1 的结构机制,我们首先测试了生否与辣椒素一样竞争相同的配体结合口袋,辣椒素的的位置已在低温电子密度图中被清楚地识别出[8,9]。以此为目的,我们测试了生姜化TRPV1 是否可以被辣椒平竞争性拮抗,辣椒平是一种已知的 TRPV其可与辣椒素竞争相同的配体结合位点,这一点在低温冷冻电镜中已使用活细胞钙成像,我们证实了三种生姜化合物对 mTRPV1 通道的以被辣椒平有效拮抗(图 3)。前期研究表明,辣椒平的结合部分是由551 残基的氢键介导的[37]。类似的相互作用也有助于辣椒素与颈部区结合[11,12],其在生姜化合物中是保守的。我们接下来的实验结果进551 和另一种形成氢键的残基 E571 对于生姜化合物激活 TRPV1 是至基于生姜化合物和辣椒素之间的结构相似性,我们进行了一系列功能特异性配体-宿主相互作用。
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