低温调控大蒜绿变形成机制研究
发布时间：2021-05-14 23:41
大蒜在加工过程中常常出现绿变,严重影响了产品品质。低温贮藏一段时间的大蒜能够绿变,常温贮藏的大蒜不能绿变。研究表明低温能够诱导大蒜绿变前体S-1-丙烯基-L-半胱氨酸亚砜（1-PeCSO）的形成,然而低温调控大蒜绿变的机制尚不明确。本文在现有研究基础上分析了不同贮藏温度条件下大蒜转录水平及蛋白水平上的差异,分析并验证调控大蒜绿变的关键通路,具体取得的进展如下:1、对不同温度贮藏的大蒜进行表观分析以及转录组测序和蛋白组分析。结果表明,常温贮藏的大蒜不能绿变,低温贮藏的大蒜极易绿变。由不同温度处理的大蒜制成的蒜泥在表观上具有显著差异。不同温度处理的大蒜基因和蛋白表达上也存在显著差异。低温相比于常温处理的大蒜有7308个基因下调,上调基因为7073个,蛋白有468个下调,上调蛋白为393个。2、基于上述差异表达基因和蛋白进行KEGG功能富集,筛选关键的代谢途径。其中涉及到提供能量的代谢通路有糖酵解途径、三羧酸循环以及磷酸戊糖途径;涉及到大蒜绿变前体1-PeCSO形成的谷胱甘肽代谢通路;涉及到中间体吡咯基氨基酸形成的氨基酸代谢通路中有丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢,甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢,半...
【文章来源】：河北工程大学河北省
【文章页数】：87 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第1章 绪论
1.1 研究背景
1.2 大蒜概述
1.3 大蒜绿变
1.4 转录组技术及其应用现状
1.5 蛋白组学技术及其应用现状
1.6 转录组和蛋白组学在大蒜中研究进展
1.7 研究内容及技术路线
第2章 不同温度贮藏的大蒜基因蛋白差异表达分析
2.1 引言
2.2 材料与方法
2.2.1 材料与试剂
2.2.2 仪器与设备
2.2.3 样品处理
2.2.4 大蒜表型鉴定
2.2.5 RNA提取
2.2.6 测序文库和RNA-seq
2.2.7 测序数据质量控制
2.2.8 基因表达量分析
2.2.9 基因功能注释
2.2.10 基因富集分析
2.2.11 蛋白质提取、消化和iTRAQ标记
2.2.12 质谱分析及序列数据库搜索
2.2.13 蛋白功能注释
2.2.14 蛋白功能富集
2.3 结果与讨论
2.3.1 不同温度处理大蒜颜色变化
2.3.2 测序结果质量评估
2.3.3 基于转录组数据样品间关系分析及差异表达
2.3.4 基因GO功能注释
2.3.5 基因KEGG功能富集
2.3.6 蛋白质质控评估
2.3.7 基于蛋白数据样品间关系分析及差异表达
2.3.8 蛋白GO功能注释
2.3.9 蛋白KEGG功能富集
2.4 本章小结
第3章 低温调控大蒜绿变代谢通路分析
3.1 引言
3.2 材料与方法
3.2.1 材料与试剂
3.2.2 差异基因表达
3.2.3 差异蛋白表达
3.3 结果与讨论
3.3.1 能量代谢关键因子差异表达分析
3.3.2 谷胱甘肽代谢关键因子差异表达分析
3.3.3 氨基酸代谢关键因子差异表达分析
3.3.4 激素代谢关键因子差异表达分析
3.4 本章小结
第4章 低温调控大蒜绿变代谢通路验证
4.1 引言
4.2 材料与方法
4.2.1 材料与试剂
4.2.2 仪器与设备
4.2.3 ATP含量
4.2.4 差异基因荧光定量PCR分析
4.2.5 氧化型谷胱甘肽(GSSG)含量
4.2.6 还原型谷胱甘肽(GSH)含量
4.2.7 γ-谷氨酰转肽酶(γ-GT)活性
4.2.8 谷胱甘肽还原酶(GR)活性
4.2.9 谷胱甘肽S-转移酶(GST)活性
4.2.10 葡萄糖-6-磷酸-1-脱氢酶(G6PDH)活性
4.2.11 6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(6-PGDH)活性
4.2.12 胞浆异柠檬酸脱氢酶(ICDHc)活性
4.2.13 氨基酸含量测定
4.3 结果与讨论
4.3.1 代谢途径中能量代谢验证分析
4.3.2 代谢途径中谷胱甘肽代谢验证分析
4.3.3 代谢途径中氨基酸代谢验证分析
4.4 本章小结
结论与展望
致谢
参考文献
作者简介
本文编号：3186542
【文章来源】：河北工程大学河北省
【文章页数】：87 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第1章 绪论
1.1 研究背景
1.2 大蒜概述
1.3 大蒜绿变
1.4 转录组技术及其应用现状
1.5 蛋白组学技术及其应用现状
1.6 转录组和蛋白组学在大蒜中研究进展
1.7 研究内容及技术路线
第2章 不同温度贮藏的大蒜基因蛋白差异表达分析
2.1 引言
2.2 材料与方法
2.2.1 材料与试剂
2.2.2 仪器与设备
2.2.3 样品处理
2.2.4 大蒜表型鉴定
2.2.5 RNA提取
2.2.6 测序文库和RNA-seq
2.2.7 测序数据质量控制
2.2.8 基因表达量分析
2.2.9 基因功能注释
2.2.10 基因富集分析
2.2.11 蛋白质提取、消化和iTRAQ标记
2.2.12 质谱分析及序列数据库搜索
2.2.13 蛋白功能注释
2.2.14 蛋白功能富集
2.3 结果与讨论
2.3.1 不同温度处理大蒜颜色变化
2.3.2 测序结果质量评估
2.3.3 基于转录组数据样品间关系分析及差异表达
2.3.4 基因GO功能注释
2.3.5 基因KEGG功能富集
2.3.6 蛋白质质控评估
2.3.7 基于蛋白数据样品间关系分析及差异表达
2.3.8 蛋白GO功能注释
2.3.9 蛋白KEGG功能富集
2.4 本章小结
第3章 低温调控大蒜绿变代谢通路分析
3.1 引言
3.2 材料与方法
3.2.1 材料与试剂
3.2.2 差异基因表达
3.2.3 差异蛋白表达
3.3 结果与讨论
3.3.1 能量代谢关键因子差异表达分析
3.3.2 谷胱甘肽代谢关键因子差异表达分析
3.3.3 氨基酸代谢关键因子差异表达分析
3.3.4 激素代谢关键因子差异表达分析
3.4 本章小结
第4章 低温调控大蒜绿变代谢通路验证
4.1 引言
4.2 材料与方法
4.2.1 材料与试剂
4.2.2 仪器与设备
4.2.3 ATP含量
4.2.4 差异基因荧光定量PCR分析
4.2.5 氧化型谷胱甘肽(GSSG)含量
4.2.6 还原型谷胱甘肽(GSH)含量
4.2.7 γ-谷氨酰转肽酶(γ-GT)活性
4.2.8 谷胱甘肽还原酶(GR)活性
4.2.9 谷胱甘肽S-转移酶(GST)活性
4.2.10 葡萄糖-6-磷酸-1-脱氢酶(G6PDH)活性
4.2.11 6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(6-PGDH)活性
4.2.12 胞浆异柠檬酸脱氢酶(ICDHc)活性
4.2.13 氨基酸含量测定
4.3 结果与讨论
4.3.1 代谢途径中能量代谢验证分析
4.3.2 代谢途径中谷胱甘肽代谢验证分析
4.3.3 代谢途径中氨基酸代谢验证分析
4.4 本章小结
结论与展望
致谢
参考文献
作者简介
本文编号：3186542
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