姜科植物的蛋白遗传多样性研究
发布时间：2021-06-11 17:36
[目的]了解不同姜科植物蛋白水平遗传多样性。[方法]分别采用TCA/丙酮法、Tris-HCl法和试剂盒法提取益智叶片蛋白并进行聚丙烯酰胺电泳（SDS-PAGE）分析,获得最佳蛋白提取方法。采用最佳蛋白提取方法提取7种姜科植物的蛋白并进行SDS-PAGE分析和数据统计,用软件NTSYS对姜科植物进行聚类分析。[结果]试剂盒法为最佳蛋白提取方法,SDS-PAGE结果表明,7种姜科植物中共检出蛋白条带52个,其中共有条带14个和多态性条带38个,平均多态性比率为73.1%。聚类分析结果表明,7种姜科植物可分为4类,聚类结果与姜科植物的种属相关但并非严格一致。[结论]该研究建立了姜科植物的蛋白遗传多样性研究方法,表明姜科植物具有丰富的蛋白遗传多样性,为今后姜科植物的遗传多样性研究提供了理论依据。
【文章来源】：安徽农业科学. 2020,48(14)
【文章页数】：4 页
【部分图文】：
3种不同方法提取益智蛋白的电泳图
7种姜科植物的蛋白经SDS-PAGE电泳分析,结果如图2所示。由图2可见,其分子量均分布在66.2～14.4 kDa。7种姜科植物中共检测出52个迁移率不同的蛋白条带,其中共有条带为14个,多态性条带38个,平均多态性比率为73.1%(表2)。7种姜科植物的蛋白谱带数因材料而异。其中,爪哇白豆蔻分离出的蛋白谱带数最多,共有11条蛋白条带,分别为6条明带和5条暗带;光叶山姜材料分离出的蛋白谱带数最少,只有5条蛋白谱带且均是暗带;草豆蔻和高良姜的蛋白谱带分布非常相似,主要蛋白谱带均有7条,分别为2条明带和5条暗带;益智和砂仁的蛋白谱带均有8条,其差异是益智在97.4 kDa的附近有1条蛋白暗带,砂仁在22.0 kDa附近处有1条蛋白暗带。表 2 7种姜科植物的蛋白条带统计Table 2 The statistical analysis of protein bands in seven species of Zingiberaceae plants 样品名称Sample 条带数Bands//个 多态性条带Polymorphic strip//个 多态性比率Polymorphic ratio//% 光叶山姜Alpinia intermedia 5 3 60.0 阳荷Zingiber striolatum 6 4 66.7 爪哇白豆蔻 Amomum compactum 11 9 81.8 草豆蔻Alpinia katsumadai 7 5 71.4 益智Alpinia oxyphylla 8 6 75.0 高良姜Alpinia officinarum 7 5 71.4 砂仁Amomum longiligular 8 6 75.0 总计Total 52 38 73.1
海南岛姜科资源丰富,探究姜科植物资源的蛋白遗传多样性,阐明不同姜科植物种质资源的亲缘关系,可为姜科植物品种鉴定和保护提供理论依据,进而推动姜科资源更深层的开发利用[18]。该研究通过优化蛋白提取方法,采用SDS-PAGE电泳技术对7种不同的姜科植物蛋白遗传多样性进行了初步研究。结果表明,试剂盒法提取的蛋白效果最佳,姜科植物在蛋白水平上具有丰富的遗传多样性,可作为评价姜科植物遗传多样性的生化标记。蛋白遗传多样性研究是以SDS-PAGE电泳的蛋白条带数、迁移位置、条带颜色深浅作为评价指标,受到蛋白提取方法的影响比较大[19]。为避免这种误差的影响,该研究以益智为材料进行蛋白提取方法的优化。结果表明,试剂盒法提取的蛋白电泳条带更多且清晰,而TCA/丙酮法和Tris-HCl法提取的蛋白电泳条带少且不清晰。BCA蛋白浓度测定结果表明,蛋白浓度依次从大到小为试剂盒法>Tris-HCl法>TCA/丙酮法。因此,选用试剂盒法提取姜科植物蛋白是比较切实可行的方法。
【参考文献】：
期刊论文
[1]砂仁中化学成分及其药理作用的研究进展[J]. 李丽丽,田文仓,刘茵,李永杰,曹晓霞,张伟. 现代生物医学进展. 2018(22)
[2]4种金柑叶片蛋白质提取方法比较分析[J]. 张宇,唐志鹏,秦荣耀,焦丁华,王长江. 西南农业学报. 2018(10)
[3]南药益智SRAP-PCR体系优化及引物筛选[J]. 欧虹雅,韩冬苗,黄兹宝,张明康,周聪聪,高炳淼. 生物技术进展. 2018(04)
[4]基于ITS序列研究南药益智遗传多样性[J]. 郭艺,高炳淼,潘坤,侯杰,李永辉,张俊清. 分子植物育种. 2018(03)
[5]中国姜科野生资源的收集繁育与应用[J]. 熊秉红,禹玉华,李素文,刘春艳,李璟,林泽明,周悦,胡丰. 中国野生植物资源. 2017(05)
[6]紫苏醇溶性种子蛋白遗传多样性分析[J]. 吴珊,舒晓霞,马宗祥. 农业与技术. 2017(10)
[7]基于ISSR标记的海南高良姜种质资源遗传多样性分析[J]. 潘坤,高炳淼,王阿超,张俊清. 分子植物育种. 2016(08)
[8]不同地区板蓝根蛋白SDS-PAGE分析[J]. 杨欣,王秋红,王悦,郭慧,邢娜,匡海学. 中国中医药信息杂志. 2015(07)
[9]南药益智AFLP-PCR体系的建立与优化[J]. 高炳淼,潘坤,田建平,唐天乐,魏娜,张俊清. 生物技术. 2015(03)
[10]贵州6个白刺花种群种子贮藏蛋白的遗传多样性[J]. 马林,王普昶,姚红艳,赵丽丽,陈超,卢立娜. 贵州农业科学. 2015(03)
本文编号：3224982
【文章来源】：安徽农业科学. 2020,48(14)
【文章页数】：4 页
【部分图文】：
3种不同方法提取益智蛋白的电泳图
7种姜科植物的蛋白经SDS-PAGE电泳分析,结果如图2所示。由图2可见,其分子量均分布在66.2～14.4 kDa。7种姜科植物中共检测出52个迁移率不同的蛋白条带,其中共有条带为14个,多态性条带38个,平均多态性比率为73.1%(表2)。7种姜科植物的蛋白谱带数因材料而异。其中,爪哇白豆蔻分离出的蛋白谱带数最多,共有11条蛋白条带,分别为6条明带和5条暗带;光叶山姜材料分离出的蛋白谱带数最少,只有5条蛋白谱带且均是暗带;草豆蔻和高良姜的蛋白谱带分布非常相似,主要蛋白谱带均有7条,分别为2条明带和5条暗带;益智和砂仁的蛋白谱带均有8条,其差异是益智在97.4 kDa的附近有1条蛋白暗带,砂仁在22.0 kDa附近处有1条蛋白暗带。表 2 7种姜科植物的蛋白条带统计Table 2 The statistical analysis of protein bands in seven species of Zingiberaceae plants 样品名称Sample 条带数Bands//个 多态性条带Polymorphic strip//个 多态性比率Polymorphic ratio//% 光叶山姜Alpinia intermedia 5 3 60.0 阳荷Zingiber striolatum 6 4 66.7 爪哇白豆蔻 Amomum compactum 11 9 81.8 草豆蔻Alpinia katsumadai 7 5 71.4 益智Alpinia oxyphylla 8 6 75.0 高良姜Alpinia officinarum 7 5 71.4 砂仁Amomum longiligular 8 6 75.0 总计Total 52 38 73.1
海南岛姜科资源丰富,探究姜科植物资源的蛋白遗传多样性,阐明不同姜科植物种质资源的亲缘关系,可为姜科植物品种鉴定和保护提供理论依据,进而推动姜科资源更深层的开发利用[18]。该研究通过优化蛋白提取方法,采用SDS-PAGE电泳技术对7种不同的姜科植物蛋白遗传多样性进行了初步研究。结果表明,试剂盒法提取的蛋白效果最佳,姜科植物在蛋白水平上具有丰富的遗传多样性,可作为评价姜科植物遗传多样性的生化标记。蛋白遗传多样性研究是以SDS-PAGE电泳的蛋白条带数、迁移位置、条带颜色深浅作为评价指标,受到蛋白提取方法的影响比较大[19]。为避免这种误差的影响,该研究以益智为材料进行蛋白提取方法的优化。结果表明,试剂盒法提取的蛋白电泳条带更多且清晰,而TCA/丙酮法和Tris-HCl法提取的蛋白电泳条带少且不清晰。BCA蛋白浓度测定结果表明,蛋白浓度依次从大到小为试剂盒法>Tris-HCl法>TCA/丙酮法。因此,选用试剂盒法提取姜科植物蛋白是比较切实可行的方法。
【参考文献】：
期刊论文
[1]砂仁中化学成分及其药理作用的研究进展[J]. 李丽丽,田文仓,刘茵,李永杰,曹晓霞,张伟. 现代生物医学进展. 2018(22)
[2]4种金柑叶片蛋白质提取方法比较分析[J]. 张宇,唐志鹏,秦荣耀,焦丁华,王长江. 西南农业学报. 2018(10)
[3]南药益智SRAP-PCR体系优化及引物筛选[J]. 欧虹雅,韩冬苗,黄兹宝,张明康,周聪聪,高炳淼. 生物技术进展. 2018(04)
[4]基于ITS序列研究南药益智遗传多样性[J]. 郭艺,高炳淼,潘坤,侯杰,李永辉,张俊清. 分子植物育种. 2018(03)
[5]中国姜科野生资源的收集繁育与应用[J]. 熊秉红,禹玉华,李素文,刘春艳,李璟,林泽明,周悦,胡丰. 中国野生植物资源. 2017(05)
[6]紫苏醇溶性种子蛋白遗传多样性分析[J]. 吴珊,舒晓霞,马宗祥. 农业与技术. 2017(10)
[7]基于ISSR标记的海南高良姜种质资源遗传多样性分析[J]. 潘坤,高炳淼,王阿超,张俊清. 分子植物育种. 2016(08)
[8]不同地区板蓝根蛋白SDS-PAGE分析[J]. 杨欣,王秋红,王悦,郭慧,邢娜,匡海学. 中国中医药信息杂志. 2015(07)
[9]南药益智AFLP-PCR体系的建立与优化[J]. 高炳淼,潘坤,田建平,唐天乐,魏娜,张俊清. 生物技术. 2015(03)
[10]贵州6个白刺花种群种子贮藏蛋白的遗传多样性[J]. 马林,王普昶,姚红艳,赵丽丽,陈超,卢立娜. 贵州农业科学. 2015(03)
本文编号：3224982
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