烟草蛋白酶NtClpR2基因的克

发布时间：2024-12-19 03:33

　　 在植物体内Clp蛋白酶可水解叶绿体内错误折叠和非正常状态的蛋白或多肽维持细胞内环境的稳态。本研究克隆了烟草ClpR2蛋白酶基因,并对其基因和编码的蛋白序列进行了分析。结果表明:该基因编码序列全长890 bp,由9个外显子剪接组成,编码由289个氨基酸残基构成的亲水性碱性蛋白结合而成,理论等电点为9.31。该基因的启动子区域含有多种顺势作用元件,显示其表达模式和功能的复杂性。该基因所编码的蛋白二级结构包括α螺旋、β转角、无规卷曲和延伸链,其亚细胞定位于叶绿体,但是不含明显的转运肽。初步功能分析表明,过表达NtClpR2的烟草植株叶绿素含量低于野生型,整个植株也明显变得矮小。上述发现表明NtClpR2在叶绿素合成中起到负向调节作用,为进一步研究其功能提供了帮助。

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【部分图文】：

图1 烟草总RNA和Nt ClpR2基因的扩增

将氨基酸序列上传至ExPASyProtParamtool对其氨基酸组成进行分析。结果表明：ClpR2蛋白的相对分子质量为32.22368kD，理论等电点(pI)为9.31，总平均亲水性为-0.398。该蛋白有非极性氨基酸140个，极性氨基酸149个，其中酸性氨基酸30个，....

图2 NtClpR2基因全长CDS序列及对应的氨基酸序列

图1烟草总RNA和NtClpR2基因的扩增图3NtClpR2基因结构和启动子元件分析

图3 NtClpR2基因结构和启动子元件分析

图2NtClpR2基因全长CDS序列及对应的氨基酸序列1.4NtClpR2蛋白的信号肽预测和亚细胞定位

图4 Nt ClpR2的理化性质与跨膜分析

利用InterPro软件分析NtClpR2蛋白的保守结构域，该蛋白含有一个典型的CLP＿Protease结构域，位于第96～255位氨基酸，约占该蛋白的55%，该蛋白属于ClpP超家族，其中第176～255位为活性氨基酸残基位点。将NtClpR2与另外12种常见植物利用MEGA....

本文编号：4017590