云南佤族、白族、傣族Y-SNP与Y-STR多态性研究与法医学意义

发布时间：2018-05-04 10:17

  本文选题：Y-SNP + Y-STR　； 参考：《昆明医学院》2011年硕士论文

【摘要】：[目的] Y染色体非重组区DNA多态呈父系遗传,在法医学混合斑分析、父系亲权鉴定及男性嫌疑人的案件排查中发挥重要作用。其单核苷酸多态具有种族、地理特异性,根据现场遗留男性个体生物学检材的特点来推测其种族地理来源可为侦查破案提供线索。本课题利用云南独特的少数民族遗传资源,选择了佤族、白族和傣族三个祖裔来源不同的民族进行具有东亚特异性的7个Y-SNP位点和Y filer试剂盒17个Y-STR基因座基因分型检测。获取了上述三个民族Y-SNP、STR两种遗传标记的基础数据分布特点,初步探讨了Y-STR与Y-SNP分型之间存在的关联性,及根据Y-SNP单倍群、Y-STR单倍型的特点来推测其种族来源的可行性,为更多民族群体利用Y染色体DNA多态研究及其在法医学领域中的应用提供一研究方法。 [方法]采集云南佤族(100例)、白族(146例)和傣族(158例)共404例无关男性健康个体的静脉血各5mL。采用酚-氯仿有机法提取核基因组DNA。用巢式PCR和PCR产物直接测序法进行7个Y-SNP分型检测；用Y filer试剂盒进行17个Y-STR基因座的复合扩增检测。应用Arlequin 3.5、Network4.5.1.6等软件进行数据统计分析。 [结果]所检测的7个Y-SNP,佤族在O3-M122、O2-M95、K*-M9、C-M130和F*-M89单倍群中有频率分布,无O1-M119和P*-M45分型；白族中7个Y-SNP单倍群均有分布；傣族除P*-M45外有其余6种单倍群分布。其中,O3-M122在佤族、白族和傣族中分别占56.0%、47.3%和31.0%；02-M95分别占15.0%、15.8%和39.9%；K*-M9分别占24.0%、13.0%和5.7%；C-M130分别占3.0%、10.2%和5.7%。17个Y-STR基因座构成的单倍型在佤族、白族和傣族中分别检出72种、115种和140种单倍型；三个民族之间无共有的单倍型：三个民族的Y-STR单倍型多样性分别为0.9875±0.0046、0.9957±0.0015和0.9981±0.0010。 佤族17个Y-STR基因座在各Y-SNP单倍群内均有高频率的等位基因分布,除DYS389Ⅱ和DYS19外,其余15个基因座的等位基因频率分布在03-M122和02-M95之间明显不同；DYS389 I, DYS19、DYS393、YGATAH4和DYS438中高频率等位基因在03-M122、02-M95和K*-M9单倍群之间的分布不同；03-M122的特征单倍型是15-12-23-29-15-15-12,17-12-10-11-22-13-13(14/12)-15-9-19,02-M95的特征单倍型是16-13-25-29-16-15-15,19-14-11-12-20-14-11-14-10-18。白族各Y-SNP单倍群内的等位基因频率分布比较均匀。傣族DYS389 I、DYS389 II、DYS19、DYS439、DYS392、DYS437、DYS438和DYS448高频率等位基因分布在03-M122和03-M95间不同,DYS390、DYS393和DYS635的等位基因在03-M122、03-M95和O1-M119单倍群之间分布不同。 同一Y-SNP单倍群的Y-STR单倍型Network网络图显示,佤族在03-M122、02-M95和K*-M9三个单倍群的网络图中均具有非常接近的单倍型并形成starcluster形状；白族在03-M122图中除部分单倍型位于中央外,单倍型之间差异比较大,02-M95网络图中具有一个小、star cluster形状；傣族在03-M122网络图中大部分的单倍型个体聚在一起,具有star cluster形状,且和部分白族个体的很接近,而在02-M95网络图中则各单倍型较分散,具有高度的单倍型多样性和分支多样性。 [结论]本课题研究获取了云南佤族、白族和傣族三个少数民族Y-SNP和Y-STR的群体遗传学基础数据,初步掌握了三个民族的父系遗传特点以及民族间的遗传差异。佤族的父系遗传结构单一,较好的保持了其父系遗传特征,其Y-STR等位基因频率分布与Y-SNP单倍群有相关性,在法医学案件检验中可利用其Y-STR特征单倍型及特异等位基因来推测其Y-SNP单倍群。而白族和傣族的父系遗传结构在多样性中存在着基因交流。
[Abstract]:Based on the characteristics of Y - SNP and Y - STR loci in Yunnan Province , this paper discusses the relationship between Y - STR and Y - SNP typing , and provides a research method for the application of Y - SNP haplotype and Y - STR haplotype in the field of forensic medicine .

Methods A total of 404 unrelated male healthy individuals were collected from the Wa nationality ( 100 cases ) , Bai nationality ( 146 cases ) and Dai nationality ( 158 cases ) in Yunnan Province .
The multiplex amplification of 17 Y - STR loci was performed with Y filer kit . The data were analyzed by Arlequin 3.5 , Network4.5 . 1.6 and other software .

The results showed that the seven Y - SNP and Wa were frequency - distributed among O3 - M122 , O2 - M95 , K * - m9 , C - M130 and F * - M89 single fold , and there were no O1 - M119 and P * - M45 typing ;
There was a distribution of 7 Y - SNP haplotype groups in Bai people .
Among the Dai people , there are the remaining six single - fold distributions except P * - M45 . Among them , the O3 - M122 accounts for 56.0 % , 47.3 % and 31.0 % in Wa , Bai and Dai .
02 - M95 accounted for 15.0 % , 15.8 % and 39.9 % , respectively .
K * - 9 9 accounted for 24 . 0 % , 13.0 % and 5.7 % , respectively .
C - M130 accounted for 3.0 % , 10.2 % and 5.7 % , respectively . There were 72 species , 115 species and 140 haplotype in Wa , Bai and Dai , respectively .
There was no common haplotype among the three peoples : the haplotype diversity of Y - STR haplotype was 0.998 75 卤 0.0046 , 0.9957 卤 0.0015 and 0.9981 卤 0.0010 , respectively .

The distribution of allele frequencies of 17 Y - STR loci in each Y - SNP haplotype was significantly different between 03 - M122 and 02 - M95 except DYS389 鈪，

本文编号：1842656