上海市环境污水监测埃可病毒11型基因特征和循环动态

发布时间：2021-07-02 18:09

　　目的探讨基于上海市环境污水监测中埃可病毒11型（echovirus 11, Echo11）的基因特征和循环动态变化。方法本研究对上海市2012—2019年环境污水监测获得的Echo11分离株进行了VP1区核酸扩增和序列测定,结合上海市急性弛缓性麻痹（acute flaccid paralysis, AFP）监测系统和健康儿童肠道病毒监测中Echo11分离株以及Echo11参考株进行序列同源性分析和系统发生学分析。结果上海市3个监测系统来源Echo11分离株共有156株,其中2012—2019年环境污水共分离到136株,其流行高峰主要集中在夏秋季。上海市不同来源Echo11分离株进化速度较快,有40.3%存在第54位氨基酸位点突变。上海市不同来源Echo11共有5个基因亚型传播链,即A1、A2、C1、C3和D5基因亚型。2012年,环境污水、AFP病例和健康儿童之间存在A1基因亚型Echo11共循环现象。2012—2015年的优势传播链为A1基因亚型,从2016年开始,优势传播链逐渐变为D5基因亚型。结论环境污水监测真实反映人类肠道病毒（human enterovirus, HEV）的循... 

【文章来源】：中华实验和临床病毒学杂志. 2020,34(03)CSCD

【文章页数】：6 页

【参考文献】：
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硕士论文
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本文编号：3260964