铁倍蚜属线粒体基因组全序列及系统发育关系

发布时间：2023-01-26 08:09

　　铁倍蚜属Kaburagia属于昆虫纲Insecta半翅目Hemiptera蚜科Aphididae绵蚜亚科Eriosomatinae五节根蚜族Fordini蚜虫,是五倍子蚜类群的一个属,包括4个亚种。铁倍蚜属为异寄主全周期型昆虫,其第一和第二寄主植物分别为盐肤木属和苔藓类部分植物。在第一寄主植物上寄生形成的虫瘿为五倍子的一种,特称为肚倍,广泛用于诸多领域,具有重要的经济价值。铁倍蚜属蚜虫形成的倍子形态变异较大,其亚种的分类主要是根据其第一寄主植物和形成的倍子形状确定的,对其不同亚种之间的遗传变异和系统发育关系方面的研究尚未见系统的研究报道。动物线粒体基因组通常是一个闭合环状的DNA分子,因其具有母系遗传、进化速率快、无重组现象等特点,已经作为很好的分子标记被广泛用于研究物种之间的系统发育和进化关系,这也极大的推动了物种系统发育基因组学的发展,而铁倍蚜属蚜虫的相关报道还比较少。本研究基于二代高通量测序技术测定了铁倍蚜属不同亚种10个样本的线粒体全基因组序列,详细分析了基因组序列信息和遗传变异;与公共数据库（GenBank）中相关序列进行比较,分析序列组成和结构变异,探讨线粒体基因组在倍蚜亚... 

【文章页数】：84 页

【学位级别】：硕士

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中文摘要
ABSTRACT
第一章 引言
    1.1 铁倍蚜属概述
        1.1.1 铁倍蚜属生物学特点
        1.1.2 铁倍蚜属价值
        1.1.3 铁倍蚜属系统分类
    1.2 线粒体基因组基本特征
        1.2.1 线粒体基因组结构组成
        1.2.2 线粒体基因组的特性
        1.2.3 线粒体DNA在系统发育分析中的应用
    1.3 本研究目的意义
第二章 材料与方法
    2.1 实验材料
    2.2 实验试剂和仪器
        2.2.1 实验试剂
        2.2.2 实验仪器
    2.3 实验方法
        2.3.1 基因组DNA提取
        2.3.2 序列测定
    2.4 数据分析方法
        2.4.1 线粒体基因组序列拼接和注释
        2.4.2 铁倍蚜属线粒体基因组组成结构分析
        2.4.3 铁倍蚜属与近缘属种线粒体基因组比较分析
        2.4.4 系统发育树构建
        2.4.5 共线性分析
第三章 铁倍蚜属线粒体基因组特征分析
    3.1 线粒体基因组测序、拼接及注释结果
    3.2 线粒体基因组基本特征
        3.2.1 蛋白质编码基因
        3.2.2 RNA
        3.2.3 非编码区
    3.3 密码子偏好性分析
    3.4 讨论
第四章 铁倍蚜属与近缘物种系统发育关系
    4.1 线粒体基因组比较分析
        4.1.1 组成成分
        4.1.2 基因碱基成分
        4.1.3 蛋白质编码基因
        4.1.4 非编码区
    4.2 系统发育关系分析
    4.3 铁倍蚜属与近缘属种线粒体基因组共线性分析
    4.4 讨论
总结与展望
参考文献
攻读学位期间取得的研究成果
致谢
个人简历及联系方式


【参考文献】：
期刊论文
[1]铁倍蚜属枣铁亚种mtDNA COI基因序列遗传分化[J]. 李京隆,任竹梅.  山西农业科学. 2016(04)
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[3]五倍子的研究近况[J]. 朴春梅.  中国民间疗法. 2005(02)
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[5]北美的五倍子[J]. 李勇民.  贵州农学院学报. 1994(01)
[6]倍蚜寄主植物名录[J]. 夏定久,李志国.  林业科技通讯. 1993(11)
[7]枣铁倍蚜（Kaburagia ensigallis）无翅孤雌侨蚜的发现及其经济意义[J]. 田泽君,隆孝雄,谢树明,陈祥林.  西南农业学报. 1992(02)
[8]五倍子与苔藓植物[J]. 罗健馨,吴鹏程,徐希成.  植物杂志. 1984(06)
[9]中国青肤杨五倍子蚜虫的研究[J]. 向和.  昆虫分类学报. 1980(04)
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本文编号：3732340