基于RNA-seq测序技术揭示黄曲霉对槲皮素的应答机制
本文选题：黄曲霉 + 黄曲霉毒素 ； 参考：《中国农业科学院》2017年博士后论文
【摘要】：黄曲霉(Aspergillus flavus)是一种遍布全世界的腐生真菌,能产生黄曲霉毒素(aflatoxin,AF)。AF是一组具有致癌性、肝脏毒性和免疫抑制效应的真菌毒素,严重威胁人类健康和粮食安全,每年给世界农业经济造成巨大的损失。槲皮素不仅能够抑制黄曲霉菌的生长,同时能够抑制黄曲霉毒素的合成。本研究基于RNA-seq技术分析槲皮素抑制黄曲霉生长及其毒素合成的可能机制,得到以下结论:第一,槲皮素能够抑制黄曲霉生长及毒素的合成。第二,采用RNA-seq技术分析槲皮素处理前后黄曲霉基因mRNA水平的影响。RNA-seq结果显示,黄曲霉样品表达转录本注释得到的基因有11308个,对所有能够比对上基因组的基因按|log2(fold change)|1,Probability0.8的条件筛选,共有665个差异表达基因。其中,槲皮素处理组黄曲霉表达上调的基因有340个,表达下调的基因有325个。差异表达基因GO和KEGG分析结果显示,差异基因主要富集到structural constituent of ribosome 和 structural molecule activity。第三,槲皮素抑制黄曲霉生长,主要与AFLA_083110和AFLA_044790两个与孢子发育相关的基因有关。第四,槲皮素抑制黄曲霉AF合成,主要调控了 aflS基因,但afrs在AF生物合成中的确切作用目前尚不清楚。
[Abstract]:Aspergillus flavus is a worldwide saprophytic fungus that produces aflatoxinus aflatoxin.AF is a group of fungal toxins with carcinogenic, hepatic and immunosuppressive effects that pose a serious threat to human health and food security.Every year to the world agricultural economy caused huge losses.Quercetin can not only inhibit the growth of Aspergillus flavus, but also inhibit the synthesis of aflatoxin.The possible mechanism of quercetin inhibiting the growth and toxin synthesis of Aspergillus flavus was analyzed based on RNA-seq. The following conclusions were obtained: firstly, quercetin could inhibit the growth of Aspergillus flavus and the synthesis of toxin.Secondly, the effect of quercetin treatment on the mRNA level of aflatoxin gene was analyzed by RNA-seq. RNA-seq results showed that there were 11308 genes expressed in Aspergillus flavus samples.A total of 665 differentially expressed genes were screened for all genes that could be compared to the upper genome by using the log2(fold change 1 / Probability0.8 condition.In quercetin treated group, 340 genes were up-regulated and 325 genes were down-regulated.The results of differential expression gene go and KEGG analysis showed that the differentially expressed genes were mainly enriched in structural constituent of ribosome and structural molecule activity.Third, quercetin inhibits the growth of Aspergillus flavus, mainly related to AFLA_083110 and AFLA_044790 genes related to spore development.Fourth, quercetin inhibits AF biosynthesis of Aspergillus flavus and regulates the aflS gene, but the exact role of afrs in AF biosynthesis is unclear.
【学位授予单位】：中国农业科学院
【学位级别】：博士后
【学位授予年份】：2017
【分类号】：Q936
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，本文编号：1737552
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