THAP8基因的表达调控及其对肺癌细胞生物学行为的影响
发布时间:2021-06-28 20:17
研究背景:THAP(Thanatos-Associated protein)蛋白家族,因其N端共有一个在进化上高度保守的THAP锌指结构域而得名。许多THAP蛋白家族成员作为转录因子发挥作用,参与细胞的增殖、凋亡、血管生成等过程。THAP8是THAP家族的一个新成员,其表达和功能尚不清楚。本文主要研究THAP8基因的表达、调控及其功能。研究方法:通过TCGA数据库和Oncomine数据库的分析,发现THAP8在癌组织中的表达高于正常组织,然后利用荧光定量PCR分析了22对肺癌和癌旁组织中的THAP8的表达。利用Western blotting检测分析THAP8蛋白在人类正常肺细胞系Beas-2B和几种肺癌细胞系中的THAP8蛋白表达水平。利用过JASPAR软件分析,发现THAP8基因启动子区含有4个缺氧反应元件(HRE),然后利用荧光素酶实验和Co Cl2诱导缺氧实验,分析缺氧诱导因子α(HIF1α)对THAP表达的调控作用。利用慢病毒系统干扰THAP8基因的表达,采用MTT细胞增殖实验、划痕实验、克隆形成实验、侵袭实验等分析了THAP8基因沉默对肺癌细胞生物学行为的影响。研究结果:1...
【文章来源】:湖南师范大学湖南省 211工程院校
【文章页数】:53 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
人THAP蛋白家族成员结构模式图
硕士学位论文22图3-1THAP8在肺癌组织中的表达高于正常肺组织(A、B)利用TCGA数据库(A)及Oncomine数据库(B)分析了在肺癌组织和正常组织中THAP8基因的表达差异;(C)取22对临床样本分析,荧光定量PCR数据显示THAP8基因mRNA水平表达在肺癌组织和癌旁组织中存在明显的差异性,用GraphPad软件分析并计算具有显著性差异,N:正常组织,C:癌组织;(D)采用β-actin作为内参蛋白,重复三次用蛋白质印记技术检测了各肺细胞系中(95-D、Beas-2B、A549、H358、H446、H1437和H460)THAP8在蛋白水平表达的差异;(E)用GraphPad软件分析三次蛋白质印记实验结果,做灰度统计分析。
硕士学位论文24图3-2HIF1α调控THAP8基因的表达(A)表示THAP8基因启动子的部分序列,下划线标示的即是HRE位点;(B)HIF1α对THAP8转录水平的调控,在Hek293细胞转染质粒,24小时后进行荧光素酶检测分析;(C)用CoCl2诱导Beas-2B细胞缺氧,从而诱导HIF1α的表达,WB检测THAP8的蛋白表达变化,用β-actin作为内参蛋白。3.3干扰THAP8对肺癌细胞的增殖、克隆形成、迁移和侵袭的影响3.3.1干扰THAP8细胞系的构建为了更进一步研究THAP8在肺癌中生物学的功能,我们首先构建了THAP8shRNA的表达载体,并包装成慢病毒颗粒。共设计了四个靶位点(THAP8基因干扰位点如表3-1所示),首先在95-D细胞中检验干扰效果,由于购买的THAP8干扰慢病毒带有红色荧光标记,因此可在感染72小时后在荧光显微镜观察感染效率的高低,从而采用适当的嘌呤霉素浓度培养筛选阳性细胞,最终获得THAP8低表达的稳定细株,经过反复的检测与分析,最终发现HSH004706-32-LVRH1MP和HSH004706-33-LVRH1MP这两个慢病毒的干扰效果最佳(图3-3A),因此在后文中采用这两个慢病毒对THAP8进行干扰(分别命名为sh-1和sh-2)。在分析了各种肺癌细胞系中THAP8基因的表达情况后,我们选取了THAP8
【参考文献】:
期刊论文
[1]HIF1α和Beclin1在成年牦牛脑组织中的表达与分布[J]. 拜占春,崔燕,余四九,马俊兴,何俊峰,张倩. 农业生物技术学报. 2019(10)
[2]Hypoxia inducible factor(HIF) in the tumor microenvironment:friend or foe?[J]. Yanqing Huang,Daniel Lin,Cullen M.Taniguchi. Science China(Life Sciences). 2017(10)
本文编号:3254984
【文章来源】:湖南师范大学湖南省 211工程院校
【文章页数】:53 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
人THAP蛋白家族成员结构模式图
硕士学位论文22图3-1THAP8在肺癌组织中的表达高于正常肺组织(A、B)利用TCGA数据库(A)及Oncomine数据库(B)分析了在肺癌组织和正常组织中THAP8基因的表达差异;(C)取22对临床样本分析,荧光定量PCR数据显示THAP8基因mRNA水平表达在肺癌组织和癌旁组织中存在明显的差异性,用GraphPad软件分析并计算具有显著性差异,N:正常组织,C:癌组织;(D)采用β-actin作为内参蛋白,重复三次用蛋白质印记技术检测了各肺细胞系中(95-D、Beas-2B、A549、H358、H446、H1437和H460)THAP8在蛋白水平表达的差异;(E)用GraphPad软件分析三次蛋白质印记实验结果,做灰度统计分析。
硕士学位论文24图3-2HIF1α调控THAP8基因的表达(A)表示THAP8基因启动子的部分序列,下划线标示的即是HRE位点;(B)HIF1α对THAP8转录水平的调控,在Hek293细胞转染质粒,24小时后进行荧光素酶检测分析;(C)用CoCl2诱导Beas-2B细胞缺氧,从而诱导HIF1α的表达,WB检测THAP8的蛋白表达变化,用β-actin作为内参蛋白。3.3干扰THAP8对肺癌细胞的增殖、克隆形成、迁移和侵袭的影响3.3.1干扰THAP8细胞系的构建为了更进一步研究THAP8在肺癌中生物学的功能,我们首先构建了THAP8shRNA的表达载体,并包装成慢病毒颗粒。共设计了四个靶位点(THAP8基因干扰位点如表3-1所示),首先在95-D细胞中检验干扰效果,由于购买的THAP8干扰慢病毒带有红色荧光标记,因此可在感染72小时后在荧光显微镜观察感染效率的高低,从而采用适当的嘌呤霉素浓度培养筛选阳性细胞,最终获得THAP8低表达的稳定细株,经过反复的检测与分析,最终发现HSH004706-32-LVRH1MP和HSH004706-33-LVRH1MP这两个慢病毒的干扰效果最佳(图3-3A),因此在后文中采用这两个慢病毒对THAP8进行干扰(分别命名为sh-1和sh-2)。在分析了各种肺癌细胞系中THAP8基因的表达情况后,我们选取了THAP8
【参考文献】:
期刊论文
[1]HIF1α和Beclin1在成年牦牛脑组织中的表达与分布[J]. 拜占春,崔燕,余四九,马俊兴,何俊峰,张倩. 农业生物技术学报. 2019(10)
[2]Hypoxia inducible factor(HIF) in the tumor microenvironment:friend or foe?[J]. Yanqing Huang,Daniel Lin,Cullen M.Taniguchi. Science China(Life Sciences). 2017(10)
本文编号:3254984
本文链接:https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/mpalunwen/3254984.html
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