DNA甲基化应用于药物过敏性猝死法医学诊断的探索研究

发布时间：2021-10-02 06:53

　　目的:药物过敏性猝死的法医学诊断是法医病理学界的一大难题,寻找精准、客观的实验室诊断指标是法医病理学者目前亟待解决的问题。通过研究分析药物过敏死者与免疫正常人之间的DNA甲基化差异,寻找药物过敏相关DNA甲基化差异位点、为药物过敏性猝死的法医学鉴定提供精准、客观的实验室诊断指标。方法:1.免疫正常人（6例）和药物过敏性猝死者（18例）,使用Illumina Methylation EPIC芯片检测全血DNA甲基化。2.芯片数据分析:R语言ChAMP包进行甲基化DMP、DMR差异分析、基因注释和基因关联分析;R语言R-topGO、R-KOBAS软件包进行GO及KEGG功能富集分析。3.基于基因组关联分析、GO及KEGG功能富集分析的基础上,进一步进行药物过敏相关DNA甲基化位点（区域）功能的研究。4.基于DMP、DMR差异分析和基因关联分析,进行选药物过敏性猝死DNA甲基化诊断指标的筛选。结果:1.HLA-DMA、HLA-DMB、HLA-DOB、HLA-DPA1、HLA-DPB1基因的甲基化水平与药物过敏猝死显著关联;2.头孢菌素类药物所致过敏性猝死与趋化因子CCL5基因启动子区域的DN... 

【文章来源】：山西医科大学山西省

【文章页数】：49 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

所有样本的CpG分布图

山西医科大学硕士学位论文8图2.所有样本的探针密度图此次样本检测共使用三张EPIC芯片，使用SVD分析评估，发现三次检测存在批次效应；使用champ.runCombat()函数去除批次效应，结果见图3。去除批次效应后SVD分析p值不显著，批次效应消除。图3.SVD分析图注：左为去除批次效应前，右为去除批次效应后

山西医科大学硕士学位论文8图2.所有样本的探针密度图此次样本检测共使用三张EPIC芯片，使用SVD分析评估，发现三次检测存在批次效应；使用champ.runCombat()函数去除批次效应，结果见图3。去除批次效应后SVD分析p值不显著，批次效应消除。图3.SVD分析图注：左为去除批次效应前，右为去除批次效应后

【参考文献】：
期刊论文
[1]宝塔红在过敏性猝死尸检中的应用初探[J]. 谭晓辉,陈娜,罗宝英,曾嘉敏,李佳,王慧君.  中国法医学杂志. 2018(03)
[2]Mast cell tryptase and carboxypeptidase A expression in body fluid and gastrointestinal tract associated with drug-related fatal anaphylaxis[J]. Xiang-Jie Guo,Ying-Yuan Wang,Hao-Yue Zhang,Qian-Qian Jin,Cai-Rong Gao.  World Journal of Gastroenterology. 2015(47)



本文编号：3418178