冠心病相关LncRNA关键基因的筛选及验证

发布时间：2022-02-21 03:09

　　第一章RP1-276N6.2、TARID基因遗传变异与中国汉族人群冠心病的关联研究目的:研究RP1-276N6.2基因区域的遗传变异rs611950、rs10499313、rs505000位点以及TARID基因区域的遗传变异rs1966248、rs2327429、rs2327433、rs12190287、rs6569912位点与冠心病发病风险的关系,并探索RP1-276N6.2和TARID基因表达水平与冠心病的潜在关联。方法:本研究采用病例对照研究的方法,严格按照纳入排除标准在医院收集冠心病患者及对照人群的血样、临床检测信息和流行病学资料。本研究共在中国重庆汉族人群中纳入949例冠心病病例和892例对照。采用Taq Man Assay基因分型法对位于RP1-276N6.2基因上的单核苷酸多态性rs611950、rs10499313、rs505000位点和位于TARID基因上的rs1966248、rs2327429、rs2327433、rs12190287、rs6569912位点进行基因分型。采用Haploview软件分析各SNPs之间的连锁关系,采用SHEsis软件进行各SNPs组合的... 

【文章来源】：重庆医科大学重庆市

【文章页数】：111 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

RP1-276N6.2基因上3个SNPs相互连锁程度Fig1.1Linkageequilibriumof5SNPslocatedinRP1-276N6.2gene.

重庆医科大学硕士研究生学位论文27图1.1RP1-276N6.2基因上3个SNPs相互连锁程度Fig1.1Linkageequilibriumof5SNPslocatedinRP1-276N6.2gene.图1.2TARID基因上5个SNPs相互连锁程度Fig1.2Linkageequilibriumof5SNPslocatedinTARIDgene.2.2.2基因分型结果采用TaqManAssaySNP分型法，使用QuantStudio6FlexReal-TimePCRSystem仪器对RP1-276N6.2和TARID基因上的8个SNPs位点进行基因分型。在基因分型散点图中，每一个点代表一个DNA样本，横轴表示VIC荧光，纵轴表示FAM荧光，在AppliedBiosystem公司官方网站

重庆医科大学硕士研究生学位论文28（https://www.thermofisher.com/order/genome-database/snp-genotyping.html）上检索SNP位点来获得VIC和FAM分别对应的等位碱基。这里仅展示rs2327429位点的一次分型结果图，如图2所示，原点附近的黑色正方形为阴性对照，靠近横轴的红点和靠近纵轴的蓝点分别表示等位碱基的两种不同纯合子（CC和TT），对角线处的绿点代表两种等位碱基的杂合子（TC），位于两种基因型间的黑色X代表未分型成功的样本，需要对这些样本重新取DNA进行分型分析。图1.3rs2327429位点TaqmanAssaySNP分型散点图Fig1.3.Scatterplotofrs2327429withTaqmanAssaySNPgenotyping2.2.3Hardy-Weinberg平衡检验结果经卡方检验，位于RP1-276N6.2基因上的rs611950、rs10499313和rs505000位点和TARID基因上的rs1966248、rs2327429、rs2327433、rs12190287以及rs6569912位点的基因型频率分布在对照组和病例组均为偏离Hardy-Weinberg平衡（P>0.05），表明纳入的研究对象为遗传连锁平衡群体，具有很好的群体代表性。结果见表1.3。表1.3基因型频率分布的哈迪-温伯格平衡检验Table1.3Hardy-WeinbergequilibriumtestofthedistributionofgenotypicfrequencyGenesSNPsControlCase

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3636376