基于临床病例筛选高尿酸血症相关的肠道菌群

发布时间：2024-02-19 10:00

　　研究目的高尿酸血症(Hyperuricemia,HUA)是一种由嘌呤代谢紊乱、尿酸(Uric acid,UA)产生过多或者尿酸排泄减少等引起的血尿酸水平升高的代谢性疾病。HUA是遗传学、性别、年龄、生活方式和环境等多种因素共同作用的结果,已发展成为仅次于糖尿病的第二大代谢性疾病。目前,对高尿酸血症与肠道菌群的相关性研究的对象多为实验动物,本研究基于临床病例,通过16S rDNA V3+V4区二代测序技术及生物信息分析技术,探索高尿酸血症相关肠道菌群变化。研究方法采集高尿酸血症和非高尿酸血症志愿者的粪便样本,本研究通过运用倾向性评分匹配法对研究中采集到的样本进行1:1匹配并分组,降低混杂因素对实验结果的干扰;对样本的16S rDNA的V3-V4可变区进行PCR扩增,采用Illumina HiSeq2500进行高通量测序;调用DADA2对原始数据进行去噪生成feature表;R edgeR包和bnlearn包筛选差异核心菌群并绘制贝叶斯关系网络,对差异菌群在门、纲、目、科、属各水平进行富集分析,绘制分类树;使用PICRUSt平台对核心菌群进行宏基因组功能预测,STAMP软件对功能预测结果进...

【文章页数】：72 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图３－４：?４８例样本ｒｅａｄｓ数描述??

二、数据质控结果??基于ＩＵｕｍｉｎａ?ＨｉＳｅｑ测序技术对研究参与者的肠道菌群结构进行了解析。经过数据过??滤、合并、去除嵌合体后，４８个样本共获得２?８１３?１０７条ｒｅａｄｓ，平均每个样本含有５８６０６．３９５８??条ｒｅａｄｓ，所有样本中ｒｅａｄｓ数最少的含有２１?２３１....

图３－５?Ｃｈａｏｌ及ｓｈａｎｎｏｎ多样性稀释曲线??

９５７３９?１９５１３９?１９３９６７?１７８９４２?７４４５６??Ｍ９２?１８６８３８?１５３１８４?１５２３６４?１５０８７３?１０１０１９?４５５１３??Ｍ９３?１９５８６１?１５９１６９?１５８２９０?１５７３５６?７６０９９?３５６５２??Ｍ９８?２１３５２０?１７７３....

图３－７?ＡＳＶ分布韦恩图??２０??

由Ｒａｎｋ－ａｂｕｎｄａｎｃｅ曲线所示（图３－６），在水平方向，曲线在横轴上的跨度较大，垂??直方向，曲线越下降平缓，说明物种的丰富度较高，物种分布均匀。??１０°??１?１?１?．?１?１?１???１０＇１?ｒ?－??＾?１〇．？?＿??１〇＊５?？：?－??０?１００?２００....

图３－８：?ＨＵＡ组门水平物种相对丰度柱状图??

平的有５１４７个，注释到属水平的有３７９４个，注释到种水平的有８１个，ＨＵＡ组注释到门水??平的有４５８２个，注释属水平的有３３０７个ＡＳＶ，注释到种水平的有８１个ＡＳＶ。??二、物种组成分析??本研究分别从门、纲、目、科、属水平上对菌群进行鉴定和分析，最终共鉴定丨５个??门，２....

本文编号：3902512