长链非编码RNA MALAT1在胃癌中的临床意义及其功能研究

发布时间：2024-02-24 09:15

　　目的基于GTEx、TCGA、GEO等公共数据库明确MALAT1基因在胃癌中的表达情况,探讨MALAT1在胃癌中的临床意义,并探索干扰其表达水平后对胃癌细胞株BGC-823的增殖、侵袭、迁移及EMT进程的影响。方法基于TCGA及GTEx数据库探索MALAT1在206例正常胃黏膜组织样本和375例胃癌组织样本中的表达差异,明确胃癌组织中MALAT1的表达水平与患者临床病例资料的关系。筛选差异基因并进行GO分析及KEGG富集分析。应用MEM数据库筛选MALAT1共表达基因,并对其进行GO分析及KEGG富集分析。应用GEO数据库及Kaplan-Meier Plotter在线分析工具分析MALAT1的表达水平与胃癌患者OS的关系。应用RT-PCR技术检测人胃癌细胞株MGC80-3、HGC-27、SGC-7901、BGC-823及人胃黏膜上皮细胞株GES-1的MALAT1表达水平。将人胃癌BGC-823细胞分为si-MALAT1组和阴性对照组即si-NC组。同时构建MALAT1 siRNA和阴性对照siRNA,分别转染至两组BGC-823细胞中,干扰MALAT1基因的表达。应用RT-PCR技术明确...

【文章页数】：80 页

【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
缩略词表
前言
一、基于公共数据库探索MALAT1在胃癌及正常胃黏膜组织中的表达水平及临床意义
    1.目的
    2.实验材料
    3.实验方法
        3.1 GTEx数据库
        3.2 合并数据
        3.3 差异基因提取
        3.4 MALAT1表达水平及其与患者临床病例资料的关系
        3.5 差异基因的GO分析和KEGG富集分析
        3.6 MALAT1共表达基因的筛选及其GO分析和KEGG富集分析
        3.7 MALAT1表达水平与患者预后的关系
    4.结果
        4.1 MALAT1在人体正常组织的表达水平及分布
        4.2 差异基因筛选
        4.3 胃癌中MALAT1的差异表达水平
        4.4 MALAT1与胃癌患者临床病例资料的关系
        4.5 差异基因GO分析及KEGG分析
        4.6 MALAT1的共表达分析
        4.7 MALAT1生存分析
    5.小结
二、抑制MALAT1的表达水平对BGC-823细胞的影响及机制研究
    1.目的
    2.实验材料
        2.1 主要试剂
        2.2 仪器设备
        2.3 试剂配制
    3.实验方法
        3.1 细胞复苏
        3.2 细胞培养
        3.3 细胞换液
        3.4 细胞传代
        3.5 细胞收集及冻存
        3.6 细胞转染
        3.7 细胞总RNA的提取
        3.8 RNA溶液的含量及浓度测定
        3.9 MALAT1cDNA第一链合成
        3.10 Real Time PCR
        3.11 CCK-8 细胞增殖实验
        3.12 细胞迁移实验
        3.13 细胞侵袭实验
        3.14 蛋白质免疫印迹检测
    4.实验结果
        4.1 RT-PCR检测MALAT1在各胃癌细胞株中的表达水平及各si-MALAT1的转染效率
        4.2 CCK-8实验检测细胞增殖能力
        4.3 Transwell实验检测细胞的侵袭/迁移能力
        4.4 Western Blot实验检测细胞中EMT相关蛋白的表达水平
    5.小结
三、讨论
结论
参考文献
综述
    参考文献
致谢
在学期间研究成果



本文编号：3908765