竹亚科的系统发育与叶绿体基因组进化

发布时间：2018-01-22 21:22

  本文关键词： 竹亚科 系统发育 AFLP 叶绿体基因组 分子进化　出处：《福建农林大学》2016年博士论文　论文类型：学位论文

【摘要】：竹亚科(Bambusoideae)为禾本科(Poaceae)中唯一具有木质化茎结构的类群,全世界近1.500种,是重要的森林物种和经济植物。由于分类鉴定多依赖于具有过渡性的营养形态特征,分类学上仍存在较大争议。分子系统学研究中所使用的竹亚科种类和基因数目不断增加,亚科内各类群的系统演化关系逐渐明晰,然而关于属级以上分类单元的系统学研究依然不完整,一些属下的种间相互关系亦未有详细全面的研究。利用DNA序列进行系统发育分析已较为普遍,但在竹亚科的叶绿体分子进化方面尚未有深入的研究报道。本研究扩大了对竹亚科植物种类和分子数据的取样量,重建了竹亚科属级以上分类阶元的系统发育关系,并尝试将种系特异的分子标记手段运用到属下种间的系统关系研究中。此外,通过增加新世界木本竹的叶绿体基因组数据,并结合前人的工作基础初步探讨了竹亚科叶绿体基因组的分子演化特征。主要研究结果如下：1.竹亚科属级以上系统发育关系基于大数据(241个竹种)和大矩阵(23个叶绿体序列)的最大似然和贝叶斯分析表明,竹亚科内划分的三大支系(草本竹Olyreae、热带木本竹Bambuseae和温带木本竹Arundinarieae)均为良好的单系群。木本竹为并系群,其中热带分布的木本竹与同为热带分布的草本竹聚为一支,组成温带木本竹的姐妹群。草本竹内部的三个亚族分别是单系,Buergersiochloinae亚族是其它2个亚族(Olyrinae和Parianinae)的姐妹群。热带木本竹根据地理分布分为新、旧世界两支。新世界分支内的三个亚族是单系,Guaduinae与Arthrostylidiinae亲缘关系较近。旧世界竹群内,Melocanninae亚族较早分化出来,在系统树上位于基部位置,其后分出Hickeliinae亚族。Racemobambosinae亚族的种类嵌套在Bambusinae亚族内,从而不支持Bambusinae亚族的单系性质。温带竹群内部共分辨出9个分支,分支间的关系依然不清晰。同时增加基因序列和物种数对提高系统树深处节点的支持率显著,但末端分枝由于引入大量的近缘序列而使拓扑结构不稳定。2.{Ｖ袷，

本文编号：1455760