胭脂鱼人工养殖群体遗传多样性研究
发布时间:2024-06-29 08:09
胭脂鱼(Myxocyprinus asiaticus)隶属于鲤形目、亚口鱼科、胭脂鱼属,为国家Ⅱ级重点保护动物,是亚口鱼科分布于我国的单型属物种,分布于长江和闽江水系。近年来,由于过度捕捞、水域污染、水利工程建设等人为因素的影响,其资源量急剧下降。闽江水系已经很难发现胭脂鱼的踪迹。为了增加其在长江流域中的资源量,人工增殖放流是其中一个有效的方法。胭脂鱼人工养殖群体的遗传多样性是检测评估胭脂鱼子代遗传品质的重要指标,也是胭脂鱼资源保护的重要环节。本研究利用线粒体DNA、微卫星以及MHC分子标记对泸州(LZ)、眉山(MS)、万州(WZ)和宜宾(YB)四个胭脂鱼人工养殖群体进行遗传多样性评估,为胭脂鱼的资源保护和科学管理提供依据。主要研究内容和结果如下:1、基于线粒体DNA分子标记的胭脂鱼遗传多样性分析。基于线粒体DNA(D-loop+Cyt b)获得总长度为2994bp核苷酸序列。在164尾胭脂鱼线粒体序列中检测出87个变异位点和83个简约信息位点。同时定义了18个单倍型。单倍型多样性(h)的变化范围为0.486-0.835,核苷酸多样性(π)的变化范围为0.01052-0.01587。在...
【文章页数】:98 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
本文编号:3997411
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图2-1基于线粒体CCR构建的4个胭脂鱼养殖群体单倍型NJ树
Hap81Hap94Hap101Hap111CytbHap17171028Hap2557Hap382Hap412Hap51Hap695Hap73124Hap831Hap911Hap....
图2-2基于CR构建的4个胭脂鱼养殖群体单倍型NJ树
图2-2基于CR构建的4个胭脂鱼养殖群体单倍型NJ树ure2-2ThehaplotypeNJtreeoffourM.asiaticusbreedingpopulationbasedo
图2-3基于Cytb构建的4个胭脂鱼养殖群体单倍型NJ树
图2-3基于Cytb构建的4个胭脂鱼养殖群体单倍型NJ树ThehaplotypeNJtreeoffourM.asiaticusbreedingpopulationba简约网络图个数据集分别构建了单倍型分布简约网络图(图2-4,图
图2-4基于CCR在4个胭脂鱼养殖群体的单倍型简约网络图
西南大学博士学位论文数据集,共定义了18个单倍型。H_1为主型单倍型,围绕S、LZ的独有单倍型。щ在这18个单倍型中独有单倍型的独有单倍型的频率最高。图中出现的红色节点,代表还存在(图2-4)。基于控制区单倍型的网络图可以看出H_1单倍布,щ所占比例较大。并щ....
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