新疆褐牛肉用功能基因筛选及基于转录组和全基因组的群体选育进程分析
发布时间:2021-04-26 12:36
新疆褐牛是以新疆本地哈萨克牛为母本,先后与瑞士褐牛、阿拉塔乌牛以及科斯特罗姆牛进行杂交,经长期选育而成的乳肉兼用型牛。经过多年改良,其肉、乳产量得以有效提高。目前,新疆褐牛和哈萨克牛是新疆肉牛生产的主要品种。本研究以新疆褐牛和哈萨克牛种用群体为研究对象,首先对两个品种的屠宰性状、胴体性状、营养成分、食用品质进行了对比分析;接着,通过转录组测序比较了两个品种牛背最长肌转录组差异,挖掘差异表达基因和潜在影响肉质的生物学通路;最后,通过基因组重测序技术明确了到目前阶段为止新疆褐牛选育过程中受人为选择的基因,并利用转录组及基因组测序结果联合分析的方法明确了新疆褐牛选育过程中有关肉质性状的分子改良进展,主要结果如下:1、新疆褐牛与哈萨克牛群体间屠宰及胴体性状、肉质性状对比分析发现,新疆褐牛产肉性能、体表脂肪沉积、胴体指标优于哈萨克牛;新疆褐牛部位肉剪切力值、蒸煮损失等肉质性状好于哈萨克牛。2、RNA高通量测序表明,哈萨克牛与新疆褐牛背最长肌存在673个差异表达基因,其中在哈萨克牛中高表达的共286个,在新疆褐牛高表达的共387个。其中,(1)ABLIM2、ACTB、ARPC1A、DNAAF1、C...
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:209 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
中文摘要
abstract
英文缩略词表
前言
第一篇 文献综述
第1章 新疆褐牛遗传改良进展
1.1 无序杂交的改良阶段(20世纪初-1949年)
1.2 有序导入的选育阶段(1950年至1976年)
1.3 品种形成的登记阶段(1977-1986年)
1.4 选育提高的扩群阶段(1987-2006年)
1.5 专用品系的培育阶段(2007年至今)
第2章 高通量测序技术在牛生产中的应用
2.1 转录组测序技术在牛业生产与研究中的应用
2.2 全基因组测序技术在牛业生产与研究中的应用
第二篇 研究内容
第1章 新疆褐牛产肉能力及肉品质综合评价
1.1 实验材料
1.2 实验方法
1.3 结果与分析
1.4 讨论
1.5 小结
第2章 新疆褐牛与哈萨克牛背最长肌差异表达基因研究
2.1 实验材料
2.2 实验方法
2.3 结果与分析
2.4 讨论
2.5 小结
第3章 新疆褐牛与哈萨克牛不同部位肉功能基因差异表达研究
3.1 实验材料
3.2 实验方法
3.3 结果与分析
3.4 讨论
3.5 小结
第4章 新疆褐牛和哈萨克牛全基因组测序
4.1 材料与方法
4.2 结果与分析
4.3 讨论
4.4 小结
第5章 利用基因组及转录组测序技术分析新疆褐牛选育进程
5.1 材料与方法
5.2 结果与分析
5.3 讨论
5.4 小结
结论
参考文献
附表
导师简介
作者简介
攻读博士期间取得的科研成果
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]Proteomic analysis reveals dysregulated cell signaling in ejaculated spermatozoa from infertile men[J]. Luna Samanta,Rakesh Sharma,Zhihong Cui,Ashok Agarwal. Asian Journal of Andrology. 2019(02)
[2]Contactins in the central nervous system: role in health and disease[J]. Madhurima Chatterjee,Detlev Schild,Charlotte E.Teunissen. Neural Regeneration Research. 2019(02)
[3]新疆褐牛导入安格斯基因后生产性能研究[J]. 李娜,崔繁荣,闫向民,张金山,李红波,叶治兵,杜玮,袁理星,张杨. 中国牛业科学. 2018(05)
[4]不同月龄去势对新疆褐牛公牛增重及产肉性能的影响[J]. 闫向民,耿娟,安尧汶,李红波,张金山,张杨. 黑龙江畜牧兽医. 2018(13)
[5]新疆褐牛基因外显子多态性及其与SCS和泌乳性状关联性分析[J]. 刘丽元,周靖航,张梦华,李金霞,方季青,谭世新,王爱芳,黄锡霞,王雅春. 中国农业科学. 2017(13)
[6]新疆褐牛和美新褐牛F1不同泌乳月产奶量差异研究[J]. 热沙来提·托乎塔尤甫,吐尔逊江·吾木尔艾力,马军,道吾然·托力干. 新疆畜牧业. 2017(03)
[7]新疆褐牛Leptin基因外显子Ⅱ E2JW多态性与体尺性状的相关性研究[J]. 萨吉代姆·麦麦提,李娜,王金泉,李红波,冯亮,张金山,闫向民,周振勇,张杨,姚刚. 家畜生态学报. 2017(01)
[8]不同肉用品种牛与新疆褐牛最佳杂交组合筛选试验[J]. 全灵,范守民,策仁道尔吉,纳进程. 畜牧与饲料科学. 2016(05)
[9]不同月龄新疆褐牛阉牛胴体性状及肉品质比较研究[J]. 闫向民,张金山,李红波,李娜,杜玮,周振勇,张杨. 中国畜牧兽医. 2015(11)
[10]新疆褐牛公牛与阉牛产肉性能和肉品质比较研究[J]. 闫向民,李娜,张金山,周振勇,李红波,杜玮,邵伟. 中国牛业科学. 2015(06)
博士论文
[1]miRNA、mRNA调控新疆褐牛和哈萨克牛肉质成脂性状分子机制研究[D]. 李娜.甘肃农业大学 2019
[2]广西巴马小型猪全基因组测序及分析研究[D]. 张笠.广西大学 2019
[3]全基因组测序揭示牛属物种的进化关系和适应性基因渗透[D]. 王胜.中国农业大学 2018
硕士论文
[1]利用全基因组测序技术筛选影响鸭羽色、喙色及蹼色的候选基因及其关联验证[D]. 余维立.华中农业大学 2019
本文编号:3161423
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:209 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
中文摘要
abstract
英文缩略词表
前言
第一篇 文献综述
第1章 新疆褐牛遗传改良进展
1.1 无序杂交的改良阶段(20世纪初-1949年)
1.2 有序导入的选育阶段(1950年至1976年)
1.3 品种形成的登记阶段(1977-1986年)
1.4 选育提高的扩群阶段(1987-2006年)
1.5 专用品系的培育阶段(2007年至今)
第2章 高通量测序技术在牛生产中的应用
2.1 转录组测序技术在牛业生产与研究中的应用
2.2 全基因组测序技术在牛业生产与研究中的应用
第二篇 研究内容
第1章 新疆褐牛产肉能力及肉品质综合评价
1.1 实验材料
1.2 实验方法
1.3 结果与分析
1.4 讨论
1.5 小结
第2章 新疆褐牛与哈萨克牛背最长肌差异表达基因研究
2.1 实验材料
2.2 实验方法
2.3 结果与分析
2.4 讨论
2.5 小结
第3章 新疆褐牛与哈萨克牛不同部位肉功能基因差异表达研究
3.1 实验材料
3.2 实验方法
3.3 结果与分析
3.4 讨论
3.5 小结
第4章 新疆褐牛和哈萨克牛全基因组测序
4.1 材料与方法
4.2 结果与分析
4.3 讨论
4.4 小结
第5章 利用基因组及转录组测序技术分析新疆褐牛选育进程
5.1 材料与方法
5.2 结果与分析
5.3 讨论
5.4 小结
结论
参考文献
附表
导师简介
作者简介
攻读博士期间取得的科研成果
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]Proteomic analysis reveals dysregulated cell signaling in ejaculated spermatozoa from infertile men[J]. Luna Samanta,Rakesh Sharma,Zhihong Cui,Ashok Agarwal. Asian Journal of Andrology. 2019(02)
[2]Contactins in the central nervous system: role in health and disease[J]. Madhurima Chatterjee,Detlev Schild,Charlotte E.Teunissen. Neural Regeneration Research. 2019(02)
[3]新疆褐牛导入安格斯基因后生产性能研究[J]. 李娜,崔繁荣,闫向民,张金山,李红波,叶治兵,杜玮,袁理星,张杨. 中国牛业科学. 2018(05)
[4]不同月龄去势对新疆褐牛公牛增重及产肉性能的影响[J]. 闫向民,耿娟,安尧汶,李红波,张金山,张杨. 黑龙江畜牧兽医. 2018(13)
[5]新疆褐牛基因外显子多态性及其与SCS和泌乳性状关联性分析[J]. 刘丽元,周靖航,张梦华,李金霞,方季青,谭世新,王爱芳,黄锡霞,王雅春. 中国农业科学. 2017(13)
[6]新疆褐牛和美新褐牛F1不同泌乳月产奶量差异研究[J]. 热沙来提·托乎塔尤甫,吐尔逊江·吾木尔艾力,马军,道吾然·托力干. 新疆畜牧业. 2017(03)
[7]新疆褐牛Leptin基因外显子Ⅱ E2JW多态性与体尺性状的相关性研究[J]. 萨吉代姆·麦麦提,李娜,王金泉,李红波,冯亮,张金山,闫向民,周振勇,张杨,姚刚. 家畜生态学报. 2017(01)
[8]不同肉用品种牛与新疆褐牛最佳杂交组合筛选试验[J]. 全灵,范守民,策仁道尔吉,纳进程. 畜牧与饲料科学. 2016(05)
[9]不同月龄新疆褐牛阉牛胴体性状及肉品质比较研究[J]. 闫向民,张金山,李红波,李娜,杜玮,周振勇,张杨. 中国畜牧兽医. 2015(11)
[10]新疆褐牛公牛与阉牛产肉性能和肉品质比较研究[J]. 闫向民,李娜,张金山,周振勇,李红波,杜玮,邵伟. 中国牛业科学. 2015(06)
博士论文
[1]miRNA、mRNA调控新疆褐牛和哈萨克牛肉质成脂性状分子机制研究[D]. 李娜.甘肃农业大学 2019
[2]广西巴马小型猪全基因组测序及分析研究[D]. 张笠.广西大学 2019
[3]全基因组测序揭示牛属物种的进化关系和适应性基因渗透[D]. 王胜.中国农业大学 2018
硕士论文
[1]利用全基因组测序技术筛选影响鸭羽色、喙色及蹼色的候选基因及其关联验证[D]. 余维立.华中农业大学 2019
本文编号:3161423
本文链接:https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/nykjbs/3161423.html
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