长链非编码RNA在狂犬病病毒感染中的作用研究
发布时间:2021-07-11 12:19
狂犬病的世界范围传播及野生动物的感染给公共卫生带来极大威胁。在亚洲、非洲、南美洲等地区,狂犬病的发病案例仍有较高频率的存在,给人们的生命、财产带来损失。狂犬病是一种人兽共患病,人感染发病后致死率接近100%,并且目前尚无相关可以治疗狂犬病的药物。因此,有必要深入探究狂犬病病毒的复制、感染及其致病机制。lncRNA指包含大于200个核苷酸的不编码蛋白质的RNA序列。越来越多的证据表明,lncRNA参与细胞生长,发育,分化,自噬和凋亡的过程,并调控转录、转录后和表观遗传水平的基因表达。lncRNAs也涉及多种疾病和免疫应答,lncRNA的差异表达与病原体感染有关。目前,在应对流感病毒(IAV)、人类免疫缺陷病毒(HIV)、单纯疱疹病毒(HSV)、登革病毒(DENV)、汉坦病毒(Hantavirus)等病毒性病原体感染时的相关宿主lncRNA功能已被研究;在流感病毒、艾滋病毒以及结核分枝杆菌等多种病原感染致病机制的研究中,鉴定出了部分调控病原微生物感染的功能性lncRNA。一些病毒感染的lncRNA表达谱正在被解析和研究。近些年来,lncRNA的相关研究为深入探索病原微生物的致病机制提供了基...
【文章来源】:南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:135 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图2-1狂犬病病毒CVS-11感染SK-N-SH??Figure?2-1.?RABV-infection?of?SK-N-SH?cells??(A)利用单克隆抗体进行IFA鉴定RABV感染的SK-N-SH细胞;(B)?SK-N-SH细胞RABV感染动力学
?长链非编码RNA在狂犬病病毒感染中的作用研宄???情况,图2-4表明,本实验中的芯片数据对称型较好。??散点图(矩阵图):单荧光芯片的原始数据经过标准化处理,转化为log以2为??底的对数后,在一个二维直角坐标系平面中,绘制散点图2-5。芯片数据的散点图常??用于评估两组数据总体分布集中趋势。图中的红色对角线表示倍数变化,X轴和Y轴??代表了样本内的标准化信号值,结果表明芯片数据总体分布集中趋势符合预期。芯片??原始数据上传至NCBIGEO数据库(NO.GSE119636)。??表2-2实验结果评估(CV值)??Table?2-2?Evaluation?of?experimental?results?(CV?value)??编号?芯片号?Sample?ID?焚光标记?CV?(%)?Result??1?10012-4?JSL-N1?cy3?5^97?pass??2?10013-1?JSL-N2?cy3?9.11?pass??3?10013-2?JSL-N3?cy3?9.24?pass??4?10013-3?JSL-T1?cy3?11.12?pass??5?10013-4?JSL-T2?cy3?8.26?pass??6?10014-1?JSL-T3?cy3?8.67?pass??■■■??III??图2-2芯片杂交扫描图??Figure?2-2?Scans?of?chip?hybridization??6张芯片杂交信号均匀,表明杂交结果可靠??The?hybridization?signal?of?6?chips?were?uniform,?indicat
?第二章狂犬病病毒感染SK-N-SH细胞的IncRNA表达谱研宄???!li?ill?M??M-M?^?-11???..??■>?^-I<??s??图2-3线厢图??Figure?2-3?Box-whisker?plot??本实验用线盒图表示芯片数据的离散度,本实验芯片数据具有良好的对称性??The?wire?box?diagram?is?used?to?show?the?dispersion?of?chip?data?in?the?experimental?project,?and?the?chip?data?in?this??experiment?has?a?good?symmetry??yq?1?a-ji?In?1??|?53?|??I??!? ̄*?? ̄ ̄"■?I1771? ̄rr ̄z^r;; ̄??丨'■w^fr\??網咖__丨,關??图2-4.芯片散点图??Figure?2-4?Scatter?plot?of?microarray??散点图通常用来评价两组数据总体分布的集中趋势。图中的红色对角线表示多个变化,x轴和y轴表示样本中的??归一化信号值??Scatter?plots?are?often?used?to?evaluate?the?central?tendency?of?the?overall?distribution?of?two?sets?of?data.?The?red??diagonals?in?the?figure?represent?multiple?changes,?and?the?X-axis?and?Y-axis?represent?normalized
【参考文献】:
期刊论文
[1]Tumor suppressor p53 functions as an essential antiviral molecule against Japanese encephalitis virus[J]. Xufang Deng,Jianchao Wei,Zixue Shi,Wenjun Yan,Zhuanchang Wu,Donghua Shao,Beibei Li,Ke Liu,Xiaodu Wang,Yafeng Qiu,Zhiyong Ma. Journal of Genetics and Genomics. 2016(12)
本文编号:3278083
【文章来源】:南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:135 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图2-1狂犬病病毒CVS-11感染SK-N-SH??Figure?2-1.?RABV-infection?of?SK-N-SH?cells??(A)利用单克隆抗体进行IFA鉴定RABV感染的SK-N-SH细胞;(B)?SK-N-SH细胞RABV感染动力学
?长链非编码RNA在狂犬病病毒感染中的作用研宄???情况,图2-4表明,本实验中的芯片数据对称型较好。??散点图(矩阵图):单荧光芯片的原始数据经过标准化处理,转化为log以2为??底的对数后,在一个二维直角坐标系平面中,绘制散点图2-5。芯片数据的散点图常??用于评估两组数据总体分布集中趋势。图中的红色对角线表示倍数变化,X轴和Y轴??代表了样本内的标准化信号值,结果表明芯片数据总体分布集中趋势符合预期。芯片??原始数据上传至NCBIGEO数据库(NO.GSE119636)。??表2-2实验结果评估(CV值)??Table?2-2?Evaluation?of?experimental?results?(CV?value)??编号?芯片号?Sample?ID?焚光标记?CV?(%)?Result??1?10012-4?JSL-N1?cy3?5^97?pass??2?10013-1?JSL-N2?cy3?9.11?pass??3?10013-2?JSL-N3?cy3?9.24?pass??4?10013-3?JSL-T1?cy3?11.12?pass??5?10013-4?JSL-T2?cy3?8.26?pass??6?10014-1?JSL-T3?cy3?8.67?pass??■■■??III??图2-2芯片杂交扫描图??Figure?2-2?Scans?of?chip?hybridization??6张芯片杂交信号均匀,表明杂交结果可靠??The?hybridization?signal?of?6?chips?were?uniform,?indicat
?第二章狂犬病病毒感染SK-N-SH细胞的IncRNA表达谱研宄???!li?ill?M??M-M?^?-11???..??■>?^-I<??s??图2-3线厢图??Figure?2-3?Box-whisker?plot??本实验用线盒图表示芯片数据的离散度,本实验芯片数据具有良好的对称性??The?wire?box?diagram?is?used?to?show?the?dispersion?of?chip?data?in?the?experimental?project,?and?the?chip?data?in?this??experiment?has?a?good?symmetry??yq?1?a-ji?In?1??|?53?|??I??!? ̄*?? ̄ ̄"■?I1771? ̄rr ̄z^r;; ̄??丨'■w^fr\??網咖__丨,關??图2-4.芯片散点图??Figure?2-4?Scatter?plot?of?microarray??散点图通常用来评价两组数据总体分布的集中趋势。图中的红色对角线表示多个变化,x轴和y轴表示样本中的??归一化信号值??Scatter?plots?are?often?used?to?evaluate?the?central?tendency?of?the?overall?distribution?of?two?sets?of?data.?The?red??diagonals?in?the?figure?represent?multiple?changes,?and?the?X-axis?and?Y-axis?represent?normalized
【参考文献】:
期刊论文
[1]Tumor suppressor p53 functions as an essential antiviral molecule against Japanese encephalitis virus[J]. Xufang Deng,Jianchao Wei,Zixue Shi,Wenjun Yan,Zhuanchang Wu,Donghua Shao,Beibei Li,Ke Liu,Xiaodu Wang,Yafeng Qiu,Zhiyong Ma. Journal of Genetics and Genomics. 2016(12)
本文编号:3278083
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