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嗜线虫致病杆菌几丁质酶和几丁质结合蛋白的特性和功能

发布时间:2021-08-29 12:34
  嗜线虫致病杆菌(Xenorhabdus nematophila)属于肠杆菌科(Enterobacteriaceae),是一类与小卷蛾斯氏线虫(Steinernema carpocapsae)互惠共生的革兰氏阴性细菌,具有广谱的杀虫和抑菌活性,其分泌的杀虫毒素以及抑菌活性物质中包括几丁质酶和几丁质结合蛋白。为了明确嗜线虫致病杆菌几丁质酶和几丁质结合蛋白的特性和功能,本研究对其基因组中的几丁质酶基因和几丁质结合蛋白基因进行了生物信息学分析,通过原核表达获得了重组几丁质酶和几丁质结合蛋白,随后测定了重组几丁质酶和几丁质结合蛋白的生理生化特征以及生物活性,最后通过敲除几丁质酶基因Xn-chi60和Xn-chi70来了解这两种几丁质酶与Xn-Tc毒素的关系。现将主要结果总结如下:1.嗜线虫致病杆菌基因组中含有4个几丁质酶基因和1个几丁质结合蛋白基因,其编码的几丁质酶分别属于18家族几丁质酶和20家族几丁质酶。通过对GenBank中嗜线虫致病杆菌基因组进行分析,从中找到了 2个18家族几丁质酶基因 Xn-chi60和Xn-chi70(登录号:KC701470 和 KC701471)、2 个 20家... 

【文章来源】:河北农业大学河北省

【文章页数】:129 页

【学位级别】:博士

【部分图文】:

嗜线虫致病杆菌几丁质酶和几丁质结合蛋白的特性和功能


图2-5?X?-c处基因推导的氨基酸序列??.-euceamnc-c

信号肽,结构域,蛋白质


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示意图,蛋白质,结构域,示意图


?河北农业大学博士学位(毕业)论文???X?-Chi?101蛋白包含4个保守结构域,分别为N端的CHB-HEX结构域,中间区的Glyco-hydro-20b??superfamily结构域和GH20-Sm-chitobiase-like结构域以及C端的CHB-HEX-C结构域。各蛋白??质的结构简图如图2-7所示。???J>j-Chi60?GHIS-chitiliase-lOce?二^??-8j-Cht70?GH18-cliitinase?二^)??*?n-Clii25??Giyco-hydro-20b?superfamily??.?j-CBP?号LPMO-IO?superfamiiy? ̄^>??.&-CIiil01?号CHB-HE^)(^Styco ̄hydro ̄_20b?superfamiiy.?yX^H20-Sm ̄chitob;ase-lik()(^^HB-HEX^Cr^??图2-7各蛋白质结构示意图??Fig.?2-7?Structural?diagram?of?each?protein??2.3.3几丁质酶和几丁质结蛋白的二级结构??通过在线程序PSIpred对办-Chi60、Khi70、X?-Chi〗01、办-Chi25和Xn-CBP五种蛋白??质的二级结构分析,结果表明,X?-Chi60含有19个a螺旋,含有14个p折叠(图2-8)?;?X?-Chi70??含有24个a螺旋和20个p折叠(图2-9)?;?Z?-Chil01含有25个ot螺旋和36个p折叠(图2-10);??X?-Chi25含有8个a螺旋和6个p折叠(图2-丨1?);JT?-CBP含有4个a螺旋和7个p折叠(图2-12)。??

【参考文献】:
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本文编号:3370665

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