嗜线虫致病杆菌几丁质酶和几丁质结合蛋白的特性和功能
发布时间:2021-08-29 12:34
嗜线虫致病杆菌(Xenorhabdus nematophila)属于肠杆菌科(Enterobacteriaceae),是一类与小卷蛾斯氏线虫(Steinernema carpocapsae)互惠共生的革兰氏阴性细菌,具有广谱的杀虫和抑菌活性,其分泌的杀虫毒素以及抑菌活性物质中包括几丁质酶和几丁质结合蛋白。为了明确嗜线虫致病杆菌几丁质酶和几丁质结合蛋白的特性和功能,本研究对其基因组中的几丁质酶基因和几丁质结合蛋白基因进行了生物信息学分析,通过原核表达获得了重组几丁质酶和几丁质结合蛋白,随后测定了重组几丁质酶和几丁质结合蛋白的生理生化特征以及生物活性,最后通过敲除几丁质酶基因Xn-chi60和Xn-chi70来了解这两种几丁质酶与Xn-Tc毒素的关系。现将主要结果总结如下:1.嗜线虫致病杆菌基因组中含有4个几丁质酶基因和1个几丁质结合蛋白基因,其编码的几丁质酶分别属于18家族几丁质酶和20家族几丁质酶。通过对GenBank中嗜线虫致病杆菌基因组进行分析,从中找到了 2个18家族几丁质酶基因 Xn-chi60和Xn-chi70(登录号:KC701470 和 KC701471)、2 个 20家...
【文章来源】:河北农业大学河北省
【文章页数】:129 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
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【参考文献】:
期刊论文
[1]块菌菌根土壤产酸性几丁质酶放线菌Streptomyces omiyaensis SCPW03的筛选及其几丁质酶酶学性质研究[J]. 王田田,马沁沁,苗玉志,周霞. 西南农业学报. 2019(10)
[2]拟康宁木霉Hailin产几丁质酶条件优化及其抑菌能力评价[J]. 罗鑫,于存. 中国植保导刊. 2019(11)
[3]短短芽孢杆菌几丁质酶BBChi4基因的原核表达及抑菌活性研究[J]. 陶小买,曾丽娜,贾化可,张婷婷,任建国,张洁,刘红美. 基因组学与应用生物学. 2019(08)
[4]基因敲除技术在微生物中的应用[J]. 王雪,黄建忠,李力. 微生物学杂志. 2019(04)
[5]川西云杉几丁质酶基因PlCHI的克隆、表达与生物信息学分析[J]. 刘利娟,刘裕峰,杨帅,刘应高. 植物科学学报. 2019(04)
[6]几丁质酶基因的克隆表达及酶学性质[J]. 郑家敏,梁燕辉,朱凡,叶秀云,林娟. 微生物学通报. 2018(05)
[7]CRISPR/Cas9系统介导的地衣芽孢杆菌基因敲除[J]. 李由然,顾正华,张梁,丁重阳,石贵阳. 基因组学与应用生物学. 2017(10)
[8]桑氏链霉菌几丁质酶ChiKJ40基因的克隆表达及其抑菌作用[J]. 张博阳,朱天辉,韩珊,王莹,李姝江,谯天敏. 微生物学通报. 2018(05)
[9]假交替单胞菌遗传操作系统的研究进展[J]. 羊燕燕,裘娟萍,余志良. 发酵科技通讯. 2017(02)
[10]卡那霉素B工程菌的构建及其发酵特性研究[J]. 陈晖,温淑平,洪文荣. 宁夏大学学报(自然科学版). 2017(01)
博士论文
[1]昆虫病原线虫共生菌的分离鉴定及次生代谢产物的研究[D]. 于峰.沈阳农业大学 2018
[2]海洋细菌DL-6几丁质酶和几丁质结合蛋白的生化性质与功能研究[D]. 王晓辉.大连理工大学 2016
[3]Xenorhabdus budapestensis D43菌株杀虫蛋白的分离纯化及致病机理的研究[D]. 杨君.安徽农业大学 2012
[4]苏云金芽孢杆菌几丁质酶特性分析及其基因启动子序列的确定[D]. 刘东.南开大学 2010
硕士论文
[1]霍乱弧菌几丁质酶VC1073、VCA0027与VC1952的功能研究[D]. 刘英.山东大学 2018
[2]发光杆菌SN259菌株次生代谢产物的分离鉴定和抑菌活性研究[D]. 石丹姝.沈阳农业大学 2017
[3]胶状溶杆菌OH17的鉴定及其遗传操作系统的构建与应用[D]. 刘琳琳.南京农业大学 2016
[4]嗜线虫致病杆菌几丁质酶基因原核表达及生物活性研究[D]. 王永娟.河北农业大学 2015
[5]产几丁质酶菌株的筛选与酶学性质研究[D]. 张圆.东北农业大学 2015
[6]维氏气单胞菌B565几丁质降解酶的性质及其协同作用研究[D]. 霍凤敏.中国农业科学院 2014
[7]荧光发光杆菌TT01菌株pirAB基因的克隆表达及杀虫谱研究[D]. 孙建宇.中山大学 2012
[8]谷氨酸棒状杆菌基因敲除系统的构建[D]. 谭延振.江南大学 2012
[9]稻瘟病菌几丁质结合蛋白基因的功能研究[D]. 林雄杰.福建农林大学 2008
[10]几丁质酶产生菌的筛选鉴定及几丁质裂解酶基因的克隆与表达[D]. 郑秀丽.四川农业大学 2006
本文编号:3370665
【文章来源】:河北农业大学河北省
【文章页数】:129 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图2-5?X?-c处基因推导的氨基酸序列??.-euceamnc-c
?i???(????t???C*scoro?■'??1.〇?S-scoro????.??Y-score????〇.B广广一A??l〇<?zzW?:??0.2?'?、、?、??a。iiiii川??M8IKKSLLLM3LTTFW?I?PI:?I8?8A?E8NSHMOYI?OSPPSRA?LLC8T?RI?81NKNCQPI?MYEPQ8V?EOPKOF?f??0?10?20?30?40?SO?60?70??Position??图2_6各蛋白质信号肽预测结果??Fig.?2-6?Prediction?results?of?signal?peptide?in?proteins??A:?AVChi60;?B:?AVChi70;?C:?AVChilOl;?D:?AVChi25;?E:?AVCBP??通过?NCBI?Conserved?Domain?Search?工具分别对?A>z-Chi60、A>?-Chi70、Jft-ChilOl?w\>?-Chi25??和办-CBP五种蛋白质的保守结构域进行分析,发现AVChi60只包含一个GHI8-chitinase-like??superfamily结构域;AVChi70只包含一个GH丨8-chitinase结构域;A>?-Chi25仅包含一个??Glyco-hydro-20b?superfamily?结构域;AVCBP?仅含有一个?LPMO-10?superfamily?结构域;??19??
?河北农业大学博士学位(毕业)论文???X?-Chi?101蛋白包含4个保守结构域,分别为N端的CHB-HEX结构域,中间区的Glyco-hydro-20b??superfamily结构域和GH20-Sm-chitobiase-like结构域以及C端的CHB-HEX-C结构域。各蛋白??质的结构简图如图2-7所示。???J>j-Chi60?GHIS-chitiliase-lOce?二^??-8j-Cht70?GH18-cliitinase?二^)??*?n-Clii25??Giyco-hydro-20b?superfamily??.?j-CBP?号LPMO-IO?superfamiiy? ̄^>??.&-CIiil01?号CHB-HE^)(^Styco ̄hydro ̄_20b?superfamiiy.?yX^H20-Sm ̄chitob;ase-lik()(^^HB-HEX^Cr^??图2-7各蛋白质结构示意图??Fig.?2-7?Structural?diagram?of?each?protein??2.3.3几丁质酶和几丁质结蛋白的二级结构??通过在线程序PSIpred对办-Chi60、Khi70、X?-Chi〗01、办-Chi25和Xn-CBP五种蛋白??质的二级结构分析,结果表明,X?-Chi60含有19个a螺旋,含有14个p折叠(图2-8)?;?X?-Chi70??含有24个a螺旋和20个p折叠(图2-9)?;?Z?-Chil01含有25个ot螺旋和36个p折叠(图2-10);??X?-Chi25含有8个a螺旋和6个p折叠(图2-丨1?);JT?-CBP含有4个a螺旋和7个p折叠(图2-12)。??
【参考文献】:
期刊论文
[1]块菌菌根土壤产酸性几丁质酶放线菌Streptomyces omiyaensis SCPW03的筛选及其几丁质酶酶学性质研究[J]. 王田田,马沁沁,苗玉志,周霞. 西南农业学报. 2019(10)
[2]拟康宁木霉Hailin产几丁质酶条件优化及其抑菌能力评价[J]. 罗鑫,于存. 中国植保导刊. 2019(11)
[3]短短芽孢杆菌几丁质酶BBChi4基因的原核表达及抑菌活性研究[J]. 陶小买,曾丽娜,贾化可,张婷婷,任建国,张洁,刘红美. 基因组学与应用生物学. 2019(08)
[4]基因敲除技术在微生物中的应用[J]. 王雪,黄建忠,李力. 微生物学杂志. 2019(04)
[5]川西云杉几丁质酶基因PlCHI的克隆、表达与生物信息学分析[J]. 刘利娟,刘裕峰,杨帅,刘应高. 植物科学学报. 2019(04)
[6]几丁质酶基因的克隆表达及酶学性质[J]. 郑家敏,梁燕辉,朱凡,叶秀云,林娟. 微生物学通报. 2018(05)
[7]CRISPR/Cas9系统介导的地衣芽孢杆菌基因敲除[J]. 李由然,顾正华,张梁,丁重阳,石贵阳. 基因组学与应用生物学. 2017(10)
[8]桑氏链霉菌几丁质酶ChiKJ40基因的克隆表达及其抑菌作用[J]. 张博阳,朱天辉,韩珊,王莹,李姝江,谯天敏. 微生物学通报. 2018(05)
[9]假交替单胞菌遗传操作系统的研究进展[J]. 羊燕燕,裘娟萍,余志良. 发酵科技通讯. 2017(02)
[10]卡那霉素B工程菌的构建及其发酵特性研究[J]. 陈晖,温淑平,洪文荣. 宁夏大学学报(自然科学版). 2017(01)
博士论文
[1]昆虫病原线虫共生菌的分离鉴定及次生代谢产物的研究[D]. 于峰.沈阳农业大学 2018
[2]海洋细菌DL-6几丁质酶和几丁质结合蛋白的生化性质与功能研究[D]. 王晓辉.大连理工大学 2016
[3]Xenorhabdus budapestensis D43菌株杀虫蛋白的分离纯化及致病机理的研究[D]. 杨君.安徽农业大学 2012
[4]苏云金芽孢杆菌几丁质酶特性分析及其基因启动子序列的确定[D]. 刘东.南开大学 2010
硕士论文
[1]霍乱弧菌几丁质酶VC1073、VCA0027与VC1952的功能研究[D]. 刘英.山东大学 2018
[2]发光杆菌SN259菌株次生代谢产物的分离鉴定和抑菌活性研究[D]. 石丹姝.沈阳农业大学 2017
[3]胶状溶杆菌OH17的鉴定及其遗传操作系统的构建与应用[D]. 刘琳琳.南京农业大学 2016
[4]嗜线虫致病杆菌几丁质酶基因原核表达及生物活性研究[D]. 王永娟.河北农业大学 2015
[5]产几丁质酶菌株的筛选与酶学性质研究[D]. 张圆.东北农业大学 2015
[6]维氏气单胞菌B565几丁质降解酶的性质及其协同作用研究[D]. 霍凤敏.中国农业科学院 2014
[7]荧光发光杆菌TT01菌株pirAB基因的克隆表达及杀虫谱研究[D]. 孙建宇.中山大学 2012
[8]谷氨酸棒状杆菌基因敲除系统的构建[D]. 谭延振.江南大学 2012
[9]稻瘟病菌几丁质结合蛋白基因的功能研究[D]. 林雄杰.福建农林大学 2008
[10]几丁质酶产生菌的筛选鉴定及几丁质裂解酶基因的克隆与表达[D]. 郑秀丽.四川农业大学 2006
本文编号:3370665
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