牡丹高密度遗传图谱构建及重要性状QTL分析

发布时间：2021-09-03 00:48

　　牡丹（Paeonia Sect. Moutan）,属于芍药科（Paeoniaceae）芍药属（Paeonia）牡丹组植物,是中国的传统名花,其育种是牡丹产业可持续发展的基本保障。开展分子生物学研究,探索表型性状的遗传调控机制,是促使牡丹育种从传统杂交育种逐步向现代分子育种转变的重要基础。本研究以‘凤丹白’M24和中原牡丹‘红乔’杂交获得的F1群体为作图材料,采用SLAF-seq （Specific-locus amplified fragment sequencing）简化基因组测序技术和简单重复序列（Simple sequence repeat, SSR）分子标记技术,构建了第一张牡丹高密度遗传连锁图谱,继而开展了牡丹重要表型性状的数量性状位点（Quantitative trait loci, QTLs）定位研究,主要研究结果如下：（1）利用19对SSR引物,对牡丹3个杂交组合进行了遗传多态性分析,结果显示：‘凤丹白’M24ב红乔’杂交组合亲本间DNA水平的多态性最高,19对SSR引物共检测到27个多态性位点,亲本间遗传距离为0.7070；进一步分析了该杂交组合F1分离群体的遗传结... 

【文章来源】：北京林业大学北京市 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：138 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图３－５不同分离类型的ＳＬＡＦ标记数量??Ｆｉｇ．?３－５?Ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ＳＬＡＦ?ｍａｒｋｅｒ?ｆｏｒ?ｅｉｇｈｔ?ｓｅｇｒｅｇａｔｉｏｎ?ｐａｔｔｅｒｎｓ??

个?ＳＮＰ＆ＩｎＤｅｌ?标记和?７２?个?ＳＳＲ?标记，分别占?８８．４２％，１．４３％，?４．４４％和?５．７１％。５?个连??锁群中均包含这４类标记，例如ＬＧ２连锁群上，这４类标记所占的比例为别为８９．２３％，??２．０５％，?３．０８％和５．６４％，各连锁群上标记类型的分布情况见表３－６和图３－９。??分析ＳＬＡＦ标记上的ＳＮＰ位点，包括１１１５个ＳＮＰ－ｏｎｌｙ标记和５６个ＳＮＰ＆ＩｎＤｅｌ标??记，结果显示：１１７１标记共有２５１８个ＳＮＰ位点，中有６５６个标记含有２个或２个以上??的ＳＮＰ位点。进一步分析这些ＳＮＰ位点显示：转换类型（ｔｒａｎｓｉｔｉｏｎｔｙｐｅ）的位点占多数??（６７．７１％），包括Ｒ（Ａ／Ｇ）和Ｙ（Ｃ／Ｔ）两种类型，分别占３３．７６和３３．９６％；颠换类型??（ｔｒａｎｓｖｅｒｓｉｏｎｔｙｐｅ）的位点占少数（３２．２９。／。），包括?Ｍ（Ａ／Ｃ），Ｗ（Ａ／Ｔ），?Ｓ（Ｃ／Ｇ），和?Ｋ??（Ｇ／Ｔ）四种类型（表３－７）。??３．２．８．２偏分离分析??卡方检测ＣＰ＜０．０５）结果表明，牡丹遗传图谱上１２６１个分子标记中，有３２２个偏??．?分离标记，占总数的２５．５４％。偏分离标记在５个连锁群上均有分布，但所占比例各不相??同（表３－８）。ＬＧ５连锁群上偏分离标记所占比例最高，达到４１．７９％，明显高于其他连??锁群。ＬＧ１连锁群上偏分离标记所占比例最低

紫色系（Ｐｕｒｐｌｅ?ｇｒｏｕｐ）和红紫色系（Ｒｅｄｄｉｓｈ?ｐｕｒｐｌｅ?ｇｒｏｕｐ）（见附录?ＩＩ）。??对４个色系的Ｚ、ａ＊．?参数进行分析显示，４个色系的参数分布规律明显，可以??将不同色系明显地区分开来（图４－５）。值由高到低分别是白色系、紫粉色系、红紫色??系和紫色系；值由高到低是红紫色系、紫色系、紫粉色系和白色系；而６＊值由高到低??的顺序与Ｚ＊值相同。此外，白色系和紫粉色系的Ｚ＊、《＊、ｂ＊ｍ，分布较为集中，而且??两色系值的分布范围能明显区分开来；紫色系和红紫色系的Ｚ＊、ａ＊．?６＊值分布有重叠范??围，其中红紫色系的￡＊、ａ＊、６＊值分布范围比紫色系更广。??ｔｏ－??－??．??：?－ｒ?４０．??－?？：?Ｔ?Ｉ??？?ＴＯ－?????？??’???ｔｉ?Ｉ?１?１?ｓ?２０．????＂■?，。？?＇＝＾＝１?丄?ｉ??５０．?０－??Ｉ?Ｉ?Ｉ?ｒ＇?“?■?“?‘??Ａ?ｎ?ｒ?ｎ?ａ?ｂ?ｔ：?ｉ＞??Ｓｉ??０－?Ｊ??Ｔ??ｒ—＾??－ｓ．?Ｊ?Ｔ?丨??？?．１０．??＂■?ｎｒ??？２０．??Ｉ?Ｉ?Ｉ?ｒ?■■?■■??Ａ?ａ?（？?ｎ??注：Ａ：白色系；Ｂ：紫粉色系；Ｃ：紫色系；Ｄ：红紫色系??Ｎｏｔｅ：?Ａ：?Ｗｈｉｔｅ?ｇｒｏｕｐ；?Ｂ：?Ｐｕｒｐｌｉｓｈ?ｐｉｎｋ?ｇｒｏｕｐ；?Ｃ：?Ｐｕｒｐｌｅ?ｇｒｏｕｐ；?Ｄ：?Ｒｅｄｄｉｓｈ?ｐｕｒｐｌｅ?ｇｒｏｕｐ．??图４－５作图群体４个色系ｉ＊、ａ＊


本文编号：3380063