利用转录组和蛋白质组测序筛选绵羊多羔基因的研究

发布时间：2021-10-15 04:41

　　产羔数是一个受微效多基因控制的数量性状,很难通过传统的育种手段来快速提高。因此,寻找与绵羊产羔数性状相关的基因和分子标记一直都是育种学家关注的热点。近年来,随着生物技术的发展,转录组分析、基因组重测序、蛋白质组学以及代谢组等各种组学技术已经成为挖掘绵羊多羔基因的重要工具。目前,关于绵羊产羔数性状的研究主要集中在垂体、卵巢和睾丸,然而有关绵羊子宫与产羔数相关的研究报道甚少。因此,在本研究中以FecB++基因型（无FecB突变）小尾寒羊母羊为研究对象,首先利用子宫RNA-Seq和子宫蛋白质组学技术筛选与绵羊多羔性状相关的差异表达的mRNA和差异表达的蛋白质;其次利用MassARRAY技术对筛选的候选基因进行质谱分型并与小尾寒羊产羔数关联分析,以期为解析绵羊多羔性状的分子机制提供理论基础。主要研究结果如下:1.绵羊子宫转录组学研究通过对卵泡期和黄体期的FecB++基因型单、多羔小尾寒羊的子宫组织进行RNA-Seq后,在卵泡期,与单羔组（MG）相比,多羔组（PG）中有166个差异表达的mRNA,其中33个上调、133个下调;473个差异表达的lncRNA,其中242个上调、231个下调;147... 

【文章来源】：甘肃农业大学甘肃省

【文章页数】：123 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

LncRNA基因特征和表达分析

甘肃农业大学2020届博士学位论文26图2-2对差异表达的mRNA和差异表达的lncRNA的靶基因进行GO富集分析Fig.2-2GOenrichmentanalysisofdifferentiallyexpressedmRNAsandtargetgenesofdifferentiallyexpressedlncRNAs（A）卵泡期的差异表达的mRNA的GO分析；（B）黄体期的差异表达的mRNA的GO分析；（C）卵泡期的差异表达的lncRNA的靶基因的GO分析；（D）黄体期的差异表达的lncRNA的靶基因的GO分析(A)ThedifferentiallyexpressedmRNAsGOenrichmentanalysisinthefollicularphase;(B)ThedifferentiallyexpressedmRNAsGOenrichmentanalysisinthelutealphase;(C)ThedifferentiallyexpressedlncRNAstargetgenesGOenrichmentanalysisinthefollicularphase;(D)ThedifferentiallyexpressedlncRNAstargetgenesGOenrichmentanalysisinthelutealphase.

利用转录组和蛋白质组测序筛选绵羊多羔基因的研究27图2-3差异表达mRNA和lncRNA的KEGG富集分析Fig.2-3KEGGpathwayanalysisofdifferentiallyexpressedmRNAsandlncRNAs（A）卵泡期差异表达mRNA的KEGG富集分析；（B）黄体期差异表达mRNA的KEGG富集分析；（C）卵泡期差异表达lncRNA的KEGG富集分析；（D）黄体期差异表达lncRNA的KEGG富集分析。(A)KEGGenrichmentpathwaysfordifferentiallyexpressedmRNAsarepresentedinthefollicularphase;(B)KEGGenrichmentpathwaysfordifferentiallyexpressedmRNAsarepresentedinthelutealphase;(C)KEGGenrichmentpathwaysfordifferentiallyexpressedlncRNAsarepresentedinthefollicularphase;(D)KEGGenrichmentpathwaysfordifferentiallyexpressedlncRNAsarepresentedinthelutealphase.

【参考文献】：
期刊论文
[1]Analyses of circRNA profiling during the development from pre-receptive to receptive phases in the goat endometrium[J]. Yuxuan Song,Lei Zhang,Xiaorui Liu,Mengxiao Niu,Jiuzeng Cui,Sicheng Che,Yuexia Liu,Xiaopeng An,Binyun Cao.  Journal of Animal Science and Biotechnology. 2019(03)
[2]6群不同品种（系）绵羊BMPR-IB基因多态性及与产羔数的关系研究[J]. 陈勇,雒秋江,李登忠,张亚军,杨风云,杨菊清,朱文渊.  新疆农业大学学报. 2008(02)
[3]5个绵羊群体的BMPR-IB基因多态性分析[J]. 王公金,窦德宇,花卫华,聂晓伟,储国良,徐晓波,赵伟,刘亚柏.  江苏农业学报. 2007(05)

博士论文
[1]利用转录组测序和蛋白质组学分析筛选绵羊多羔候选基因的研究[D]. 汤继顺.中国农业科学院 2019
[2]FecB基因影响小尾寒羊繁殖力的分子机制研究[D]. 郭晓飞.中国农业大学 2018

硕士论文
[1]MGST1基因调控鸡胚肝细胞的分子机制研究[D]. 施肇源.合肥工业大学 2019



本文编号：3437440