利用DNA组学技术对晋江马起源的研究
发布时间：2021-10-15 23:49
晋江马主产于福建省晋江市及周边地区,是唯一适应东南沿海潮湿、高温气候的中国地方家马品种。晋江马主产区泉州是古代海上丝绸之路的起点,曾与阿拉伯世界贸易频繁,因此有学者推测晋江马是阿拉伯马的后裔。但由于缺乏相关史料记载,目前尚无法断定晋江马的起源,而且近几十年来由于农业机械化的普及,晋江马这个以役用为主的地方马品种目前处于濒危境地。鉴于此,本研究拟从线粒体基因组和核基因组的角度来探究晋江马的起源,同时也为晋江马品种保护和开发利用提供依据。在线粒体遗传研究中,采用了线粒体DNA高变区I和线粒体基因组序列相结合的分析方法;在核基因组研究方面采用了全基因组高密度SNP芯片的分析方法。具体研究如下:线粒体DNA研究方面:（1）晋江马与世界范围内的家马一样呈现母系多样性。线粒体DNA高变区序列的聚类结果形成A-I九大单倍群,晋江马分布在除B单倍群以外的所有单倍群中,且在A5聚类簇中分布最多;（2）基于线粒体DNA高变区序列的FST分析结果表明,跟晋江马遗传关系最为紧密的是百色马、丽江马、腾冲马等西南马类群,其次是北方家马,而阿拉伯马与晋江马之间的遗传分化比较大;（3）基于线粒体DNA高变区序列的扩张...
【文章来源】：中国农业大学北京市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：116 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－１马线粒体ＤＮＡ的Ｄ－ｌｏｏｐ控制区结构图（Ｋａｖａｒ?ｅｔ?ａｌ．?２００８）??－
Ｊ?ＭＵ１０?ｂｖＥＣ３０??ＩＶＢ？??Ｊ？Ｃ３３?〇??图１－２家马６５２个线粒体ＤＮＡ序列的系统发育网络图（Ｊａｎｓｅｎ?ｅｔａｌ，?２００２）??Ｆｉｇｕｒｅ?１－２?Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ?ｎｅｔｗｏｒｋ?ｏｆ?６５２?ｈｏｒｓｅ?ｍｔＤＮＡ?ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ?（Ｊａｎｓｅｎ?ｅｔ?ａｌ，?２００２）??Ｌ＾ｅ?Ｐｌｅｉｓｔｏｃｅｎｅ?Ｃｏｐｐｅｒ?Ａｇｅ?Ｂｒｏｎｚｅ?Ａｇｅ?Ｉｒｏｎ?Ａｇｅ?Ｍｅｄｉｅｖａｌ??］２Ｔｎｒ：．?５Ｔ＾?．?．?，?．?．?．｝ＴＢ：￣?．?．?，?．?．?．＇ＴＢ．（，．?．?－ｉ?．?．?．＇ＴＡ．Ｄ?．?．?■．??Ｎｏｒｔｈ?Ｅａｓｔ?Ｓｉｂ＾ｉａ??ｎ：３?０??（１４）?Ａ??Ｊ??Ｋｌ??Ｃｈｉｎａ，?Ｍｏｎｇｏｌｉａ，?Ｋｏｒｅａ??＂：，Ｓ?ＫＭ?兮?Ｉｆ?ｆ?１?ｏ??ｉ??Ｗｔｔａ?ａｎｄ?Ｓｏｕｔｈ?Ｓｉｂｅｒｉａ．?Ｋａ７ａｋｈｓｕｎ??Ｋ２＊？ｆ??ｆ?忒ｆ??Ｅｕｒｏｐｅ?（Ｉｂｅｒｉａ?ｅｘｃｌｕｄｅｄ）．?Ａｓｉａ?Ｍｉｎｏｒ．?Ａｍｉｅｎｉａ??ｒ，ｉｆ，??ａ?ｊ?ｄｖｏ?ａ＾．Ｊ９＾ａ??Ｄ?Ｇｌ?Ｄ２?Ｉ?Ｘ３ｃｌａ?Ｄ２ｃ?Ｘ２?Ｄ２ａ?Ｆ?Ｋ２
＾?Ｊ??Ｄ２?Ｘ４ｉ??图１－３现代家马的线粒体遗传起源（Ｃｉｅｓｌａｋｅｔａｌ．２０１０）??Ｆｉｇｕｒｅ?１－?３?Ｏｒｉｇｉｎ?ｏｆ?ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ?ｌｉｎｅａｇｅｓ?ｏｆ?ｍｏｄｅｍ?ｈｏｒｓｅｓ?（Ｃｉｅｓｌａｋ?ｅｔ?ａｌ．?２０１０）??
【参考文献】：
期刊论文
[1]基因组选择技术在农业动物育种中的应用[J]. 谈成,边成,杨达,李宁,吴珍芳,胡晓湘. 遗传. 2017(11)
[2]茶马古道与盐运古道、丝绸之路的关系——基于词与物的古道类型学研究[J]. 陈保亚. 思想战线. 2016(06)
[3]穿越历史与地理的“河西走廊”[J]. 郭军凯. 地理教育. 2016(05)
[4]历史上福建港口的茶贸之路[J]. 郑廼辉,高香凤,江铃. 福建茶叶. 2015(06)
[5]明代海防与《孙子兵法》[J]. 熊剑平. 滨州学院学报. 2015(05)
[6]楚国八百年兴衰史给长江工程职业技术学院发展的启示[J]. 王俊. 长江工程职业技术学院学报. 2014(03)
[7]利用微卫星多态性鉴别不同马品种试验[J]. 李智军,刘武军,祁居中,孟军,刘佳,耿明,姚新奎. 新疆农业科学. 2013(09)
[8]利用微卫星标记研究贵州矮马和伊犁马的遗传多样性[J]. 雷红梅,王嘉福,田松军,王荣明,黄勇,冉雪琴. 中国畜牧兽医. 2013(08)
[9]福建闽[J]. 晓然. 中国工会财会. 2013(01)
[10]茶马古道与百越古道[J]. 蓝韶昱. 百色学院学报. 2012(01)
博士论文
[1]基于高密度SNP芯片的香猪产仔数性状基因筛选和鉴定[D]. 谢健.贵州大学 2016
[2]利用mtDNA和Y染色体的遗传变异对中国家马驯化的研究[D]. 杨云周.中国农业大学 2015
[3]楚国疆域变迁之研究[D]. 赵炳清.复旦大学 2013
[4]中国主要地方马群体遗传多样性及系统进化研究[D]. 凌英会.中国农业科学院 2010
[5]中国西南马遗传资源特征研究[D]. 孙玉江.内蒙古农业大学 2008
[6]宋代广东经济发展研究[D]. 郎国华.暨南大学 2004
硕士论文
[1]宋代福建与两广地区人地关系比较研究[D]. 王丽歌.河北大学 2011
[2]明清时期福建水师的研究[D]. 周健.福建师范大学 2010
[3]家养双峰驼线粒体DNA序列多态性与起源研究[D]. 程佳.西北农林科技大学 2009
[4]新疆哈萨克马、伊犁马及杂种马遗传多样性的微卫星分析[D]. 李红.新疆农业大学 2008
本文编号：3438830
【文章来源】：中国农业大学北京市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：116 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－１马线粒体ＤＮＡ的Ｄ－ｌｏｏｐ控制区结构图（Ｋａｖａｒ?ｅｔ?ａｌ．?２００８）??－
Ｊ?ＭＵ１０?ｂｖＥＣ３０??ＩＶＢ？??Ｊ？Ｃ３３?〇??图１－２家马６５２个线粒体ＤＮＡ序列的系统发育网络图（Ｊａｎｓｅｎ?ｅｔａｌ，?２００２）??Ｆｉｇｕｒｅ?１－２?Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ?ｎｅｔｗｏｒｋ?ｏｆ?６５２?ｈｏｒｓｅ?ｍｔＤＮＡ?ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ?（Ｊａｎｓｅｎ?ｅｔ?ａｌ，?２００２）??Ｌ＾ｅ?Ｐｌｅｉｓｔｏｃｅｎｅ?Ｃｏｐｐｅｒ?Ａｇｅ?Ｂｒｏｎｚｅ?Ａｇｅ?Ｉｒｏｎ?Ａｇｅ?Ｍｅｄｉｅｖａｌ??］２Ｔｎｒ：．?５Ｔ＾?．?．?，?．?．?．｝ＴＢ：￣?．?．?，?．?．?．＇ＴＢ．（，．?．?－ｉ?．?．?．＇ＴＡ．Ｄ?．?．?■．??Ｎｏｒｔｈ?Ｅａｓｔ?Ｓｉｂ＾ｉａ??ｎ：３?０??（１４）?Ａ??Ｊ??Ｋｌ??Ｃｈｉｎａ，?Ｍｏｎｇｏｌｉａ，?Ｋｏｒｅａ??＂：，Ｓ?ＫＭ?兮?Ｉｆ?ｆ?１?ｏ??ｉ??Ｗｔｔａ?ａｎｄ?Ｓｏｕｔｈ?Ｓｉｂｅｒｉａ．?Ｋａ７ａｋｈｓｕｎ??Ｋ２＊？ｆ??ｆ?忒ｆ??Ｅｕｒｏｐｅ?（Ｉｂｅｒｉａ?ｅｘｃｌｕｄｅｄ）．?Ａｓｉａ?Ｍｉｎｏｒ．?Ａｍｉｅｎｉａ??ｒ，ｉｆ，??ａ?ｊ?ｄｖｏ?ａ＾．Ｊ９＾ａ??Ｄ?Ｇｌ?Ｄ２?Ｉ?Ｘ３ｃｌａ?Ｄ２ｃ?Ｘ２?Ｄ２ａ?Ｆ?Ｋ２
＾?Ｊ??Ｄ２?Ｘ４ｉ??图１－３现代家马的线粒体遗传起源（Ｃｉｅｓｌａｋｅｔａｌ．２０１０）??Ｆｉｇｕｒｅ?１－?３?Ｏｒｉｇｉｎ?ｏｆ?ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ?ｌｉｎｅａｇｅｓ?ｏｆ?ｍｏｄｅｍ?ｈｏｒｓｅｓ?（Ｃｉｅｓｌａｋ?ｅｔ?ａｌ．?２０１０）??
【参考文献】：
期刊论文
[1]基因组选择技术在农业动物育种中的应用[J]. 谈成,边成,杨达,李宁,吴珍芳,胡晓湘. 遗传. 2017(11)
[2]茶马古道与盐运古道、丝绸之路的关系——基于词与物的古道类型学研究[J]. 陈保亚. 思想战线. 2016(06)
[3]穿越历史与地理的“河西走廊”[J]. 郭军凯. 地理教育. 2016(05)
[4]历史上福建港口的茶贸之路[J]. 郑廼辉,高香凤,江铃. 福建茶叶. 2015(06)
[5]明代海防与《孙子兵法》[J]. 熊剑平. 滨州学院学报. 2015(05)
[6]楚国八百年兴衰史给长江工程职业技术学院发展的启示[J]. 王俊. 长江工程职业技术学院学报. 2014(03)
[7]利用微卫星多态性鉴别不同马品种试验[J]. 李智军,刘武军,祁居中,孟军,刘佳,耿明,姚新奎. 新疆农业科学. 2013(09)
[8]利用微卫星标记研究贵州矮马和伊犁马的遗传多样性[J]. 雷红梅,王嘉福,田松军,王荣明,黄勇,冉雪琴. 中国畜牧兽医. 2013(08)
[9]福建闽[J]. 晓然. 中国工会财会. 2013(01)
[10]茶马古道与百越古道[J]. 蓝韶昱. 百色学院学报. 2012(01)
博士论文
[1]基于高密度SNP芯片的香猪产仔数性状基因筛选和鉴定[D]. 谢健.贵州大学 2016
[2]利用mtDNA和Y染色体的遗传变异对中国家马驯化的研究[D]. 杨云周.中国农业大学 2015
[3]楚国疆域变迁之研究[D]. 赵炳清.复旦大学 2013
[4]中国主要地方马群体遗传多样性及系统进化研究[D]. 凌英会.中国农业科学院 2010
[5]中国西南马遗传资源特征研究[D]. 孙玉江.内蒙古农业大学 2008
[6]宋代广东经济发展研究[D]. 郎国华.暨南大学 2004
硕士论文
[1]宋代福建与两广地区人地关系比较研究[D]. 王丽歌.河北大学 2011
[2]明清时期福建水师的研究[D]. 周健.福建师范大学 2010
[3]家养双峰驼线粒体DNA序列多态性与起源研究[D]. 程佳.西北农林科技大学 2009
[4]新疆哈萨克马、伊犁马及杂种马遗传多样性的微卫星分析[D]. 李红.新疆农业大学 2008
本文编号：3438830
本文链接：https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/nykjbs/3438830.html
