白菜类作物逆境相关基因的进化模式及低温春化下的LncRNA分析
发布时间:2021-10-26 06:31
植物生长发育过程中会经历各种胁迫,这严重的影响了植物的正常生长。研究植物逆境相关基因及逆境信号传导的分子机制,具有重要的理论意义和实际应用价值。白菜类作物主要包括,大白菜(Brassica rapa ssp.pekinensis)、不结球白菜(Brassica rapa ssp.chinensis)和芜菁(Brassica rapa ssp.rapa),属于十字花科(Cruciferae)芸薹属(Brassica)植物。大白菜是中国广泛种植的蔬菜之一,在长期的人工驯化选择过程中形成了丰富的种质资源。目前,主要是利用各种组学技术,例如基因组学、蛋白组学和代谢组学等手段,系统研究各种植物外源胁迫信号对植物生长发育的影响和调控。从分子、进化水平和基因功能层面揭示其内在规律,解析其代谢调控和信号传导网络。模式植物拟南芥中逆境相关基因已经研究的比较透彻,关于白菜类作物的研究相对较少。因此对白菜类作物逆境相关基因的系统研究,为栽培和育种提供重要的理论依据。本研究在大白菜基因组中鉴定了抗逆相关基因(MAPK级联基因、CDPK-SnRK、TIFY、BES1)及低温春化相关的LncRNA,利用比较基因组...
【文章来源】:南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:151 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图1-2比较基因组分析芸苔属植物结构(Cheng?etal.,?2012)??(a)根据全基因组序列分析大白菜和甘蓝染色体共线性
?白菜类作物逆境相关基因的进化模式及低温春化下LncRNA的分析???-?I?i?^?e???.<?、?■?I?MAPKK?z严?I?m??h?i?ri?l?7?/?:?k,?E??i■?_|-?\.^?(?/?luilb??b麵??图2-1?MAPK级联基因在大白菜和拟南芥之间的共线性和不同保留程度的分析??(a<)?MAPK、MAPKK、MAPKKK在大白菜和拟南芥之间的共线性基因用线表示在丨0条大白??菜染色体(BrOl-BrlO)和5条拟南芥染色体上(AtOl-At05)。红色的线代表拟南芥和大白菜之??间的共线性基因对,蓝色的线代表大白菜的共线性基因对。(d)?MAPK级联基因在LF、MF〗和??MF2三个亚基因上的保留(e)?MAPK级联基因在大白菜三倍化和分馏后的数目。??Figure?2-1?The?syntenic?MAPK?cascade?genes?between?Brassica?rapa?and?Arabidopsis?thaliana?and??their?different?retentions.??(a-c)MAPK.?MAPKK,?MAPKKK?syntenic?genes?lines?are?shown?among?the?10?B.?rapa??chromosomes(BrOl-BrlO)?and?the?five?A.?Thaliana?chromosomes?(At01-At05).?The?red?lines?represent??the?syntenic?genes?pairs?between?B.?rapa?and?Arabidopsis,?and?the?b
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【参考文献】:
期刊论文
[1]不结球白菜种质资源的研究与利用[J]. 侯喜林,宋小明. 南京农业大学学报. 2012(05)
[2]不结球白菜育种研究新进展[J]. 侯喜林. 南京农业大学学报. 2003(04)
本文编号:3459018
【文章来源】:南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:151 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图1-2比较基因组分析芸苔属植物结构(Cheng?etal.,?2012)??(a)根据全基因组序列分析大白菜和甘蓝染色体共线性
?白菜类作物逆境相关基因的进化模式及低温春化下LncRNA的分析???-?I?i?^?e???.<?、?■?I?MAPKK?z严?I?m??h?i?ri?l?7?/?:?k,?E??i■?_|-?\.^?(?/?luilb??b麵??图2-1?MAPK级联基因在大白菜和拟南芥之间的共线性和不同保留程度的分析??(a<)?MAPK、MAPKK、MAPKKK在大白菜和拟南芥之间的共线性基因用线表示在丨0条大白??菜染色体(BrOl-BrlO)和5条拟南芥染色体上(AtOl-At05)。红色的线代表拟南芥和大白菜之??间的共线性基因对,蓝色的线代表大白菜的共线性基因对。(d)?MAPK级联基因在LF、MF〗和??MF2三个亚基因上的保留(e)?MAPK级联基因在大白菜三倍化和分馏后的数目。??Figure?2-1?The?syntenic?MAPK?cascade?genes?between?Brassica?rapa?and?Arabidopsis?thaliana?and??their?different?retentions.??(a-c)MAPK.?MAPKK,?MAPKKK?syntenic?genes?lines?are?shown?among?the?10?B.?rapa??chromosomes(BrOl-BrlO)?and?the?five?A.?Thaliana?chromosomes?(At01-At05).?The?red?lines?represent??the?syntenic?genes?pairs?between?B.?rapa?and?Arabidopsis,?and?the?b
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【参考文献】:
期刊论文
[1]不结球白菜种质资源的研究与利用[J]. 侯喜林,宋小明. 南京农业大学学报. 2012(05)
[2]不结球白菜育种研究新进展[J]. 侯喜林. 南京农业大学学报. 2003(04)
本文编号:3459018
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