肠道微生态影响兰州熊蜂蜂王生殖机理研究
【文章页数】:98 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图1.1技术路线
1.6.3技术路线1.6.4研究意义
图2.1联合6种基因利用贝叶斯法和最大似然法构建熊蜂属的系统发育树(“BG”种类采自我国,BG054为兰州熊蜂;后面有黑点表明在之前的进化树中没有的种;右边为各亚属名称;LF:长脸型;SF:短脸型;进化树的顶部是外群)
我们利用采集的26个熊蜂种,参考Cameron(2007)研究中的183个熊蜂种以及10个外群种为研究对象,总共209个熊蜂种类,38个亚属。通过联合2种线粒体基因(COI和16SrRNA)和4种核基因(Argk、Opsin、EF-1α和PEPCK)序列,利用贝叶斯分析法和最....
图3.2三组蜂王肠道菌样本中共有和特有的OTU分布情况(UQ:未交配蜂王;MQ:交配蜂王;OQ:产卵蜂王)
原始数据经过去除引物序列、PEreads拼接、过滤掉低质量的序列以及去除嵌合体后,最后我们从86个蜂王肠道样本中总共得到2,107,642条EffectiveTags,平均每个样本中的EffectiveTags为24,507±961(Mean±SE),单个样品中的Effec....
图3.3不同生理状态蜂王肠道样本之间的PCoA分析(Oviposition queen:产卵蜂王;Mated queen:交配蜂王;Unmated queen:未交配蜂王)
β多样性分析是针对不同样品之间的分析,在物种注释结果和OTU丰富度信息的基础上,通过计算Bray-curtis距离来反映出不同样品间微生物群落的结构差异。同时基于这种计算的距离矩阵,通过主坐标分析(PCoA)进一步发现并挖掘样品间微生物群落结构的差异(图3.3),其中图中不同颜色....
本文编号:4022930
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