地毯草种质资源的遗传多样性分析

发布时间：2020-07-14 17:03

【摘要】：地毯草[Axonopus compressus (Sw.) Beauv.],别名：大叶油草,属禾本科(Gramineae)地毯草属(Axonopus)多年生草本植物,起源于热带南美洲,属暖季型草坪草。其中地毯草属约有40个种,我国有地毯草和近缘地毯草2个种。主要分布在热带和亚热带等气候温暖湿润地区。目前对地毯草的研究还主要局限在种质调查、形态学特征和生理特性的研究上,对地毯草种质遗传多样性研究很少见报道。因此,本研究目的是采用形态学标记和分子标记对来自国内外的64份地毯草种质的遗传多样性和遗传关系进行分析,结合形态学标记和生境分布特点,为地毯草种质的遗传特性提供更全面理论参考,也为筛选优质抗逆的新品系提供基础。主要结果有以下几点： 1、地毯草种质资源形态多样性研究 64份地毯草种质的形态多样性变异仅节间长、穗柄长和花序直径达到显著(P0.05),其他指标皆达到极显著(P0.01),表明地毯草的外部形态在不同品系间具有多样性。各指标的变异系数范围为20.79%-338.64%,其中节间长的变异系数最大为338.64%,匍匐茎节间叶片长的变异系数最小为20.79%,所有指标变异系数平均为111.17%。从所测各指标间相关性可以看出,大部分指标都呈现显著(P0.05)或极显著差异(P0.01)。 2、地毯草种质ISSR标记的遗传多样性分析 25条ISSR引物共扩增出208条清晰谱带,大小在300-1500bp之间,其中多态性条带有196条,多态性比率为94.23%,25个引物扩增条带数在4-15条之间,平均每个引物8.32条,遗传相似系数是0.46-0.99。 3、地毯草种质SRAP标记的遗传多样性分析 27对SRAP引物共扩增出691条条带,其中多态性条带668条,多态性比率为96.67%,扩增条带的片段大小为200-1500bp,扩增的总条带数在16-35条之间,平均每对引物有25.6条带,遗传相似系数是0.52-0.82。 4、地毯草种质微卫星标记的开发地毯草微卫星标记的开发采用罗氏454测序法与FIASCO磁珠富集相结合的方法,从53193个序列中挑选9735个(占18.3%)含SSRs的序列,其中适于引物设计的有1942个(占3.65%)。为了测试引物的扩增效率,随机选了100对微卫星序列进行引物设计并保存这些序列在基因库中(KM110835-KM110934)。这100对引物中有66对由于扩增产物与SSR标记的特征不符,不能被用作SSR的引物,剩余34对用于24份材料的扩增测试,仅有14对引物扩增位点表现出多态性等位基因扩增位点的范围从2(Ac019, Ac021, Ac094)-6(Ac087)个,平均3.5个；Shannon指数范围0.169(Ac067)-0.650(Ac091),平均0.393；Nei’s指数范围0.108(Ac067)-0.457(Ac091),平均0.271。 5、地毯草种质SSR标记的遗传多样性分析 14对SSR引物共扩增出49条谱带,其中48条为多态性条带,多态性比率为97.96%,平均每个引物对扩增3.5条带,扩增条带分子片段在100-400bp之间。遗传形似系数是0.24-0.98,聚类分析可以聚为3类,出现交叉遗传的现象。 6、三种标记(ISSR+SSR+SRAP)的综合分析 ISSR和SSR标记Mantel检测的相似系数矩阵的相关系数为0.8367,表明结果匹配良好,而SRAP和ISSR、SRAP和SSR检测的相似系数矩阵的相关系数分别为0.7541和0.7253,匹配性较差,聚类结果可以分为3类,其中SSR与ISSR的聚类结果有很多相似处,但SSR多态性比率高于ISSR标记。
【学位授予单位】：海南大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：S688.4

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