菠菜表型三维点云数据分析与形态品质指标遗传多样性研究
发布时间：2020-12-03 01:00
菠菜(Spinacia oleracea L.)是一种可四季栽种的重要经济作物,适应能力强,在全世界都有广泛播种,这使其种质资源具有丰富的遗传多样性。在植物遗传多样性的研究过程中,形态学标记是常用的一种标记,然而传统依靠人工实测的表型数据既费事费工又容易产生人为误差,而通过植物可视化技术建立的模型能更为有效地提取表型数据。本试验根据实测与三维建模参数提取的生理与形态性指标研究,对665份国内外菠菜资源进行了遗传多样性分析,旨在为菠菜系统分类与品种改良育种提供理论依据。主要研究结果如下:1.21个生理与形态性状间平均多样性指数为1.65,蛋白质的多样性指数最高为2.18,叶片圆度最低为0.76,之间相差1.43。其中蛋白质,可溶性草酸,投影面积,硝态氮与维生素C等的多样性指数偏高,说明其遗传多样性更为丰富。国内资源的平均遗传多样性指数1.56,低于国外资源的1.69;中国资源的各项表型性状指标平均遗传多样性指数为1.56,中东资源的各项表型性状指标平均遗传多样性指数最低为1.39,而欧洲资源的平均遗传多样性指数最高为1.69,这说明国内外菠菜种质资源遗传变异较大。2.使用形态学标记将66...
【文章来源】：上海师范大学上海市
【文章页数】：60 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
基于表型性状数据的菠菜种质资源26种来源地Bray-Curtis遗传距离UPGMA聚类图
第3章结果与分析上海师范大学硕士学位论文38图3.4基于表型性状数据的菠菜种质资源5种来源地Bray-Curtis遗传距离UPGMA聚类图Fig3.4DendrogramofgeographicalgroupsofspinachusingUPGMAbasedonBray-Curtisgeneticdistance3.4.2菠菜种质资源表型性状主成分分析使用Past4.01软件以国内外菠菜种质资源为一个混合群体的主成分数据进行665份菠菜种质资源协方差矩阵主成分聚类分析作图（表3.9，图3.5），结果表明第一成分的贡献率为99.99%，第二成分的贡献率为0.01%，两者总共占比100%。同时也探测到国内外种质资源的两大基因库并未产生明显分化。第1主最主要特征正向向量由投影面积决定；第2主成分特征正向向量主要为投影周长，其特征向量值为0.99。由贡献率特征值的大小可知投影面积即叶片大小是造成菠菜种质资源多样性差异的主要因素，应被视为在菠菜育种中指导亲本选择与种质评价的重要表型指标。
上海师范大学硕士学位论文第3章结果与分析39表3.9基于665份国内外菠菜种质资源性状间协方差矩阵绘制的主成分分析（PCA）图Table3.9Principalcomponentanalysisof665spinachgermplasmaccessionsbasedonvariance-covariancematrix性状PC1PC2可溶性草酸4E-08-3E-06总草酸2E-09-4E-06蛋白质-3E-08-3E-05维生素C6E-08-7E-06硝态氮-1E-062E-04投影面积1E+00-7E-04投影周长7E-041E+00圆度6E-085E-06紧凑性-4E-054E-03凸包顶点数3E-052E-03叶长5E-063E-04叶宽5E-063E-04株高3E-06-9E-05株幅2E-05-2E-04单株重3E-05-1E-04叶形-3E-08-4E-05贡献率%99.990.01图3.5基于665份国内外菠菜种质资源性状间协方差矩阵绘制的主成分分析（PCA）图Fig3.5Principalcomponentanalysisof665spinachgermplasmaccessionsbasedonvariance-covariancematrix3.5菠菜种质资源表型性状相关性分析3.5.1菠菜种质资源17种数量性状相关性分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]菠菜种质遗传多样性和亲缘关系的AFLP分析[J]. 吴娅妮,康俊根,王文科,孟淑春. 园艺学报. 2013(05)
[2]三维点云孔洞修补算法及在植物形态重建中的应用[J]. 岳杰,陆声链,孙智慧,郭新宇,魏学礼. 农机化研究. 2013(05)
[3]努力推动中国的遗传多样性研究[J]. 褚嘉祐,李绍武,张亚平. 遗传. 2012(11)
[4]菠菜性别相关EST-SSR标记的开发及应用[J]. 邓传良,高俊,曹莹,秦瑞云,高武军,卢龙斗. 基因组学与应用生物学. 2012(05)
[5]高温胁迫下菠菜种子萌发特性及耐热性[J]. 沈丹婷,刘晓嵩,唐东梅,黄丹枫. 上海交通大学学报(农业科学版). 2012(04)
[6]基于点云数据的植物叶片曲面重构方法[J]. 孙智慧,陆声链,郭新宇,温维亮. 农业工程学报. 2012(03)
[7]菠菜性别相关的RAPD标记[J]. 秦瑞云,杨金华,贾彦彦,张准超,高武军,卢龙斗,邓传良. 江西农业大学学报. 2009(06)
[8]基于特征点图像序列的多摄像机全局标定[J]. 贾倩倩,王伯雄,史辉,罗秀芝. 清华大学学报(自然科学版). 2009(05)
[9]生物多样性及其保护[J]. 蒋志刚. 科技促进发展. 2009(03)
[10]3个野生香蕉株系的PCR-RFLP分析及其对枯萎病抗性的研究[J]. 陈雅平,陈云凤,黄霞,肖望,黄学林. 园艺学报. 2008(01)
硕士论文
[1]中国樱桃地方种质表型性状遗传多样性分析[D]. 刘胤.四川农业大学 2016
[2]基于单目视觉图像序列的三维重构[D]. 刘会.中国科学技术大学 2016
[3]菠菜品种间品质评价及其叶酸含量测定方法的研究[D]. 齐敏.南京农业大学 2009
[4]虚拟植物可视化关键技术研究[D]. 张颖.重庆大学 2009
[5]不同菠菜品种硝态氮累积差异的生理机制研究[D]. 王海华.西北农林科技大学 2007
[6]菠菜种质资源遗传多样性及耐寒性鉴定[D]. 张南.东北农业大学 2007
[7]基于L系统的植物形态模拟[D]. 孔勇.西安电子科技大学 2007
[8]RAPD、SRAP和ISSR标记在香菇种质资源的应用及其SCAR标记的建立[D]. 应正河.福建农林大学 2006
本文编号：2895733
【文章来源】：上海师范大学上海市
【文章页数】：60 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
基于表型性状数据的菠菜种质资源26种来源地Bray-Curtis遗传距离UPGMA聚类图
第3章结果与分析上海师范大学硕士学位论文38图3.4基于表型性状数据的菠菜种质资源5种来源地Bray-Curtis遗传距离UPGMA聚类图Fig3.4DendrogramofgeographicalgroupsofspinachusingUPGMAbasedonBray-Curtisgeneticdistance3.4.2菠菜种质资源表型性状主成分分析使用Past4.01软件以国内外菠菜种质资源为一个混合群体的主成分数据进行665份菠菜种质资源协方差矩阵主成分聚类分析作图（表3.9，图3.5），结果表明第一成分的贡献率为99.99%，第二成分的贡献率为0.01%，两者总共占比100%。同时也探测到国内外种质资源的两大基因库并未产生明显分化。第1主最主要特征正向向量由投影面积决定；第2主成分特征正向向量主要为投影周长，其特征向量值为0.99。由贡献率特征值的大小可知投影面积即叶片大小是造成菠菜种质资源多样性差异的主要因素，应被视为在菠菜育种中指导亲本选择与种质评价的重要表型指标。
上海师范大学硕士学位论文第3章结果与分析39表3.9基于665份国内外菠菜种质资源性状间协方差矩阵绘制的主成分分析（PCA）图Table3.9Principalcomponentanalysisof665spinachgermplasmaccessionsbasedonvariance-covariancematrix性状PC1PC2可溶性草酸4E-08-3E-06总草酸2E-09-4E-06蛋白质-3E-08-3E-05维生素C6E-08-7E-06硝态氮-1E-062E-04投影面积1E+00-7E-04投影周长7E-041E+00圆度6E-085E-06紧凑性-4E-054E-03凸包顶点数3E-052E-03叶长5E-063E-04叶宽5E-063E-04株高3E-06-9E-05株幅2E-05-2E-04单株重3E-05-1E-04叶形-3E-08-4E-05贡献率%99.990.01图3.5基于665份国内外菠菜种质资源性状间协方差矩阵绘制的主成分分析（PCA）图Fig3.5Principalcomponentanalysisof665spinachgermplasmaccessionsbasedonvariance-covariancematrix3.5菠菜种质资源表型性状相关性分析3.5.1菠菜种质资源17种数量性状相关性分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]菠菜种质遗传多样性和亲缘关系的AFLP分析[J]. 吴娅妮,康俊根,王文科,孟淑春. 园艺学报. 2013(05)
[2]三维点云孔洞修补算法及在植物形态重建中的应用[J]. 岳杰,陆声链,孙智慧,郭新宇,魏学礼. 农机化研究. 2013(05)
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[4]菠菜性别相关EST-SSR标记的开发及应用[J]. 邓传良,高俊,曹莹,秦瑞云,高武军,卢龙斗. 基因组学与应用生物学. 2012(05)
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[6]基于点云数据的植物叶片曲面重构方法[J]. 孙智慧,陆声链,郭新宇,温维亮. 农业工程学报. 2012(03)
[7]菠菜性别相关的RAPD标记[J]. 秦瑞云,杨金华,贾彦彦,张准超,高武军,卢龙斗,邓传良. 江西农业大学学报. 2009(06)
[8]基于特征点图像序列的多摄像机全局标定[J]. 贾倩倩,王伯雄,史辉,罗秀芝. 清华大学学报(自然科学版). 2009(05)
[9]生物多样性及其保护[J]. 蒋志刚. 科技促进发展. 2009(03)
[10]3个野生香蕉株系的PCR-RFLP分析及其对枯萎病抗性的研究[J]. 陈雅平,陈云凤,黄霞,肖望,黄学林. 园艺学报. 2008(01)
硕士论文
[1]中国樱桃地方种质表型性状遗传多样性分析[D]. 刘胤.四川农业大学 2016
[2]基于单目视觉图像序列的三维重构[D]. 刘会.中国科学技术大学 2016
[3]菠菜品种间品质评价及其叶酸含量测定方法的研究[D]. 齐敏.南京农业大学 2009
[4]虚拟植物可视化关键技术研究[D]. 张颖.重庆大学 2009
[5]不同菠菜品种硝态氮累积差异的生理机制研究[D]. 王海华.西北农林科技大学 2007
[6]菠菜种质资源遗传多样性及耐寒性鉴定[D]. 张南.东北农业大学 2007
[7]基于L系统的植物形态模拟[D]. 孔勇.西安电子科技大学 2007
[8]RAPD、SRAP和ISSR标记在香菇种质资源的应用及其SCAR标记的建立[D]. 应正河.福建农林大学 2006
本文编号：2895733
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