急性髓系白血病潜在生物标志物的转录组学分析

发布时间：2022-10-19 16:46

　　研究目的急性髓系白血病（Acute myeloid leukemia,AML）是一种血液系统恶性肿瘤,当前各种治疗虽取得一定进展,仍存在诸多问题。本研究通过临床生物信息学分析方法对AML患者转录组学数据进行分析,以期找到与AML发生、发展和预后相关的生物标志物,从而为AML的基础研究和临床治疗提供指导。研究方法以“acute myeloid leukemia”为关键词,在GEO、TCGA数据库中检索相关数据。从GEO数据库下载符合要求的AML实验数据,通过差异分析、GO功能富集分析、通路富集分析、蛋白质相互作网络构建得到mRNA核心基因;从TCGA数据库下载符合要求的RNA测序数据,从中提取miRNA和lncRNA,并分别进行差异分析。使用miRcode数据库对差异lncRNA与差异miRNA进行比对,得到差异miRNA与差异lncRNA对应关系。再通过miRTarBase、TargetScan、miRDB数据库检索miRNA靶向的mRNA,以3个数据库共有的mRNA作为靶定的mRNA,去重处理后,将GEO数据库分析得到的差异mRNA与miRNA靶定的mRNA的交集作为miRNA最终的... 

【文章页数】：51 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
中文摘要
Abstract
1 引言
    1.1 问题的提出与研究意义
    1.2 国内外相关研究现状
    1.3 研究方法
    1.4 数据来源与处理
    1.5 论文框架
    1.6 论文的创新点
2 mRNA核心基因筛选
    2.1 材料与方法
    2.2 结果
    2.3 小结
3 ceRNA调控网络构建
    3.1 材料与方法
    3.2 结果
    3.3 小结
4 生存分析
    4.1 材料与方法
    4.2 结果
    4.3 小结
5 讨论与结论
    5.1 讨论
    5.2 研究结论
    5.3 建议
    5.4 研究不足与展望
参考文献
致谢
在学期间承担/参与的科研课题与研究成果
个人简历


【参考文献】：
期刊论文
[1]“微移植”治疗急性髓系白血病的研究进展[J]. 王璇,郭树霞.  中国民康医学. 2018(18)
[2]自体造血干细胞移植对急性髓系白血病的治疗进展[J]. 陈永升,黄琴,尹晓林.  中国临床新医学. 2018(07)
[3]浅谈临床生物信息学在临床医学教育中的作用及初步实践[J]. 张皓旻,杨波,郭斌,于睿莉,迟小华,陈红飞,席义博,陈锡勐,贺培凤,卢学春.  转化医学杂志. 2018(03)
[4]miRNA调控血液发育机制的研究进展[J]. 廖晓棠.  生物化工. 2018(01)
[5]白血病融合基因及检测方法研究进展[J]. 肖恒,李守霞.  医学综述. 2015(22)
[6]白血病中融合基因的研究进展[J]. 张阳,郑智博,贾学渊,孙文靖,金焰.  国际遗传学杂志. 2015 (04)
[7]白血病形成中JAK/STAT信号通路的持续激活[J]. 李英华,罗建民.  国际病理科学与临床杂志. 2006(05)
[8]造血干细胞移植治疗白血病的某些进展[J]. 黄文荣,达万明.  内科急危重症杂志. 2005(03)
[9]自体造血干细胞移植治疗急性白血病患者143例疗效分析[J]. 冯四洲,魏嘉璘,邹德惠,王玫,杨栋林,闫章松,王津雨,刘庆国,张桂新,刘春,邱录贵,严文伟,韩明哲.  内科急危重症杂志. 2005(03)
[10]Stat1蛋白在急性髓系细胞白血病患者外周血白细胞中的激活[J]. 刘峰,陈元玉,李冠武,温博贵.  癌变.畸变.突变. 2004(04)

硕士论文
[1]miR-20b及miR-363介导AML预后相关性分析与临床验证[D]. 李敏曦.中国医科大学 2018



本文编号：3693735