白花泡桐二四倍体的蛋白质组差异分析

发布时间：2021-09-01 22:09

　　为研究二倍体白花泡桐在四倍体形成过程中蛋白质的变化,利用同位素标记相对定量和绝对定量（iTRAQ）以及液相串联质谱技术,分析了四倍体泡桐及其二倍体亲本叶片中的蛋白质表达变化,并通过与转录组的关联,筛选与四倍体形成相关的蛋白质。研究结果共鉴定到696个蛋白质,其中,有75个差异表达,对这些差异蛋白质进行基因本体论（GO）功能分析,其主要富集在液泡、胞浆和非生物刺激响应等40个基因本论条目中。对这些差异蛋白质进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析表明,其主要参与35个代谢通路,包括光合作用、植物病原相互作用和次生代谢产物的生物合成等。通过蛋白质组和转录组关联分析,筛选到9个与倍性相关的差异蛋白质,基中4个注释到KEGG代谢通路,分别是镁螯合酶H亚基、V型H+转运ATPase亚基A、果糖二磷酸醛缩酶和细胞色素C氧化酶亚基5b。 

【文章来源】：森林与环境学报. 2020,40(06)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

总蛋白质的鉴定与分析

为进一步了解四倍体优良特性相关的特异蛋白质，对B2和B4两样本鉴定到的总蛋白质进行差异分析。结果共鉴定到75个差异表达的蛋白质，其中，39个上调，36个下调。GO富集分析结果显示，显著性富集的GO条目有40个:细胞组分主要条目有胞浆、液泡、核糖体[图2(a)];生物进程主要条目有非生物刺激响应、前体代谢物和能量的产生、渗透胁迫响应[图2(b)];分子功能主要条目有铜离子结合、果糖二磷酸醛缩酶活性、醛裂合酶活性[图2(c)]。KEGG通路富集分析参与了35条代谢通路，主要包括代谢途径(29,48.33%)、糖酵解/糖异生(7,11.67%)、次生代谢产物的生物合成(17,28.33%)、光合生物的碳固定(8,13.33%)和氧化磷酸化(5,8.33%)等(表3)。2.3 蛋白质组与转录组关联分析

为了验证测序结果的可靠性,在B2和B4文库中随机挑选m.13192(谷胱甘肽S-转移酶)、m.29938(L-抗坏血酸氧化酶)、m.24953(果糖二磷酸醛缩酶)、m.40032(铜氧化酶)、m.32969(玉米黄质环氧酶)、m.39316(蛋白二硫键异构酶A1)、m.9824(2-磷酸乙醇酸磷酸酶1)、m.16063(羧亚甲基丁烯酸酶)等8个差异蛋白质进行qRT-PCR验证(图3)。B2表达量归一化为1,18 S rRNA作为内参。结果显示:4个基因在蛋白质水平和转录水平均上调,4个基因在蛋白质水平上调而在转录水平下调,这种结果可能是由于基因转录、蛋白质翻译后加工和修饰,或者mRNA和蛋白质的降解等因素造成的。3 讨论与结论

【参考文献】：
期刊论文
[1]四倍体泡桐对干旱胁迫的生理响应研究[J]. 张晓申,刘荣宁,范国强,赵振利,邓敏捷.  河南农业大学学报. 2013(05)
[2]不同种四倍体泡桐光合特性的研究[J]. 张晓申,翟晓巧,赵振利,邓敏捷,范国强.  河南农业大学学报. 2013(04)
[3]植物抗坏血酸氧化酶的研究进展[J]. 郭燕,朱杰,许自成,张水成.  中国农学通报. 2008(03)
[4]白花泡桐同源四倍体的诱导[J]. 范国强,曹艳春,赵振利,杨志清.  林业科学. 2007(04)

博士论文
[1]甘蔗应答黑穗病菌侵染的转录组与蛋白组研究及抗性相关基因挖掘[D]. 苏亚春.福建农林大学 2014



本文编号：3377775