亚剂量抗生素诱导β-内酰胺抗性基因水平迁移特征研究
发布时间：2023-06-28 00:27
环境中的亚剂量抗生素诱导促进了环境细菌发生耐药性突变和抗生素抗性基因(ARGs)的水平迁移。这使得环境中耐药性细菌的频繁产生和快速扩散。其中以针对β-内酰胺类抗生素的耐药性扩散最受关注。广谱β-内酰胺酶(ESBL)和肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶(KPC)是细菌抵抗β-内酰胺类抗生素作用效果的重要方式。通过对位于长江中下游的某水源性水库中ESBL编码基因的赋存特性进行研究,课题组发现抗生素和可动遗传元件(MGEs)对ESBL编码基因的分布起到显著的影响:根据方差分解和普氏分析结果,两者与ESBL编码基因的分布具有极显著的相关性,共可解释65.10%的方差。然而共现性网络分析表明以整合子为单位的转化迁移并非ESBL编码基因主要的基因水平迁移方式。ESBL编码基因编码于质粒上,因此推测接合转移是ESBL编码基因发生基因水平迁移的重要途径。课题组利用平板分离法从新加坡主要医院的废水中分离出可能具备ESBL和KPC合成能力的铜绿假单胞菌(P.aeruginosa)菌株和大肠杆菌(E.coli)菌株,随后使用标准16S rDNA测序法验证其菌种;使用Vitek?2再次验证是否其具有...
【文章页数】：101 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
abstract
主要符号对照表
第1章 绪论
1.1 基因水平迁移简介
1.1.1 什么是基因水平迁移
1.1.2 HGT的几种重要机理
1.2 质粒与接合转移
1.2.1 可动遗传元件与基因水平迁移
1.2.2 质粒
1.2.3 接合转移
1.3 基因水平迁移与抗生素抗性基因扩散
1.3.1 抗生素抗性基因及其作用机理
1.3.2 临床环境与抗性基因水平迁移
1.4 影响基因水平迁移的因素
1.4.1 环境胁迫与SOS反应
1.4.2 低质量浓度杀菌剂
1.5 检测接合转移的实验新方法
1.6 研究背景和内容
1.6.1 研究背景
1.6.2 研究内容
1.6.3 技术路线图
第2章 重要抗性基因在典型水源性水库中的赋存特性
2.1 引言
2.2 材料与方法
2.2.1 样本采集
2.2.2 DNA提取与定量
2.2.3 数据整理和统计分析
2.3 结果与分析
2.3.1 ESBL编码基因的赋存特性与时空分布
2.3.2 ESBL编码基因与MGEs的共现性
2.4 讨论
2.4.1 抗生素对ESBL编码基因赋存特性的影响
2.4.2 ESBL编码基因参与基因水平迁移的途径
2.5 本章小结
第3章 耐β-内酰胺细菌的分离与鉴定
3.1 引言
3.2 材料与方法
3.2.1 水样收集
3.2.2 耐药性细菌的收集与分离
3.2.3 细菌DNA的提取及细菌种属鉴定
3.2.4 可合成ESBL和 KPC细菌的抗菌素药敏测试
3.2.5 ESBL和碳青霉烯酶编码基因的定量检验
3.3 结果与讨论
3.3.1 分离菌株对重要抗生素的耐药性
3.3.2 分离菌株耐药性的基因型验证
3.4 本章小结
第4章 单一亚剂量抗生素对接合转移的诱导特性
4.1 引言
4.2 材料与方法
4.2.1 所用的化学药剂
4.2.2 供、受体菌株的预处理
4.2.3 接合转移实验与转移频率计算
4.2.4 统计分析
4.3 结果与分析
4.3.1 无四环素、磺胺甲噁唑和头孢他啶胁迫时的接合转移频率
4.3.2 单一亚剂量抗生素胁迫对接合转移影响
4.4 讨论
4.4.1 供体菌种的选择
4.4.2 临床废水对环境微生物耐药性扩散的危害
4.4.3 对结果准确性的讨论
4.5 本章小结
第5章 多种亚剂量抗生素对接合转移的协同影响
5.1 引言
5.2 材料与方法
5.2.1 所用的化学药剂
5.2.2 诱导抗生素质量浓度配比设计
5.2.3 接合转移实验与转移频率计算
5.2.4 统计分析
5.3 结果与分析
5.3.1 多种亚剂量抗生素对铜绿假单胞菌与受体菌株间接合转移的协同影响
5.3.2 多种亚剂量抗生素对大肠杆菌与受体菌株间接合转移的协同影响
5.4 讨论
5.4.1 ESBL编码质粒在亚剂量抗生素胁迫下的接合传递特点
5.4.2 抗生素和抗性基因之间联系的重新思考
5.5 本章小结
第6章 结论与展望
6.1 结论
6.2 展望
参考文献
附录 A ARGs引物序列表
致谢
攻读硕士学位期间已发表或录用的论文
本文编号：3835624
【文章页数】：101 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
abstract
主要符号对照表
第1章 绪论
1.1 基因水平迁移简介
1.1.1 什么是基因水平迁移
1.1.2 HGT的几种重要机理
1.2 质粒与接合转移
1.2.1 可动遗传元件与基因水平迁移
1.2.2 质粒
1.2.3 接合转移
1.3 基因水平迁移与抗生素抗性基因扩散
1.3.1 抗生素抗性基因及其作用机理
1.3.2 临床环境与抗性基因水平迁移
1.4 影响基因水平迁移的因素
1.4.1 环境胁迫与SOS反应
1.4.2 低质量浓度杀菌剂
1.5 检测接合转移的实验新方法
1.6 研究背景和内容
1.6.1 研究背景
1.6.2 研究内容
1.6.3 技术路线图
第2章 重要抗性基因在典型水源性水库中的赋存特性
2.1 引言
2.2 材料与方法
2.2.1 样本采集
2.2.2 DNA提取与定量
2.2.3 数据整理和统计分析
2.3 结果与分析
2.3.1 ESBL编码基因的赋存特性与时空分布
2.3.2 ESBL编码基因与MGEs的共现性
2.4 讨论
2.4.1 抗生素对ESBL编码基因赋存特性的影响
2.4.2 ESBL编码基因参与基因水平迁移的途径
2.5 本章小结
第3章 耐β-内酰胺细菌的分离与鉴定
3.1 引言
3.2 材料与方法
3.2.1 水样收集
3.2.2 耐药性细菌的收集与分离
3.2.3 细菌DNA的提取及细菌种属鉴定
3.2.4 可合成ESBL和 KPC细菌的抗菌素药敏测试
3.2.5 ESBL和碳青霉烯酶编码基因的定量检验
3.3 结果与讨论
3.3.1 分离菌株对重要抗生素的耐药性
3.3.2 分离菌株耐药性的基因型验证
3.4 本章小结
第4章 单一亚剂量抗生素对接合转移的诱导特性
4.1 引言
4.2 材料与方法
4.2.1 所用的化学药剂
4.2.2 供、受体菌株的预处理
4.2.3 接合转移实验与转移频率计算
4.2.4 统计分析
4.3 结果与分析
4.3.1 无四环素、磺胺甲噁唑和头孢他啶胁迫时的接合转移频率
4.3.2 单一亚剂量抗生素胁迫对接合转移影响
4.4 讨论
4.4.1 供体菌种的选择
4.4.2 临床废水对环境微生物耐药性扩散的危害
4.4.3 对结果准确性的讨论
4.5 本章小结
第5章 多种亚剂量抗生素对接合转移的协同影响
5.1 引言
5.2 材料与方法
5.2.1 所用的化学药剂
5.2.2 诱导抗生素质量浓度配比设计
5.2.3 接合转移实验与转移频率计算
5.2.4 统计分析
5.3 结果与分析
5.3.1 多种亚剂量抗生素对铜绿假单胞菌与受体菌株间接合转移的协同影响
5.3.2 多种亚剂量抗生素对大肠杆菌与受体菌株间接合转移的协同影响
5.4 讨论
5.4.1 ESBL编码质粒在亚剂量抗生素胁迫下的接合传递特点
5.4.2 抗生素和抗性基因之间联系的重新思考
5.5 本章小结
第6章 结论与展望
6.1 结论
6.2 展望
参考文献
附录 A ARGs引物序列表
致谢
攻读硕士学位期间已发表或录用的论文
本文编号：3835624
本文链接：https://www.wllwen.com/wenshubaike/qiuzhijiqiao/3835624.html
最近更新
教材专著
