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西北荒漠区野生黑果枸杞种质资源遗传多样性分析

发布时间:2022-01-01 18:57
  目的:分析不同来源野生黑果枸杞遗传差异和亲缘关系,为黑果枸杞资源鉴定和有效利用提供科学依据。方法:采用SSR分子标记对西北四省区22份野生枸杞种质材料进行鉴定,利用POPGENE 1.32和NTSYS-pc 2.10生物信息学软件对数据进行处理,分析黑果枸杞种质遗传多样性,计算遗传相似系数,绘制聚类图。结果:筛选出多态性SSR引物37对,在22个样品中共检测到233个基因位点,其中多态性位点213个,多态性比率(Polymorphism ratio,P)达91.4%。材料间遗传相似系数(Genetic similarity,GS)在0.483 1~0.936 4之间,平均有效等位基因数(Effective number of alleles,Ne)为1.331 4,多样性指数(Nei’s gene diversity,H)为0.210 6,Shannon信息指数(Shannon’s information index,I)为0.338 4。聚类分析(Unweighted pair group of arithmetic means,UPGMA)显示,在相似系数为0.61和0.77处,可... 

【文章来源】:中国野生植物资源. 2020,39(11)CSCD

【文章页数】:8 页

【部分图文】:

西北荒漠区野生黑果枸杞种质资源遗传多样性分析


引物对CAN130829、TOM180、SSR22对22份枸杞材料的PCR扩增结果

枸杞,聚类分析,样本


本研究采用SSR分子标记技术对来自甘肃、青海、宁夏、新疆不同省区的22个枸杞材料进行遗传多样性分析,筛选出37对SSR引物共检测到233个等位变异,其中多态性位点213个,平均每个引物扩增条带数为6.3条,多态性位点比率为91.4%,遗传相似系数在0.483 1~0.936 4之间,平均GS值为0.628 6,在分子水平上证明了不同省区供试黑果枸杞之间差异较大,遗传多样性较为丰富。通过遗传距离测算明确了供试材料间亲缘关系的远近,以大武口十分沟和阿克塞多巴沟的黑果枸杞遗传相似系数最大(0.936 4),可能是由于地区之间相互引种引起枸杞遗传背景相似;而表型性状非常相似的宁杞1号和宁杞2号借助分子标记可以有效区分开来,充分证明了SSR标记技术可以从分子水平上有效鉴别枸杞种质间的遗传差异。本研究筛选出的37对SSR引物,将为枸杞品种鉴定和今后枸杞遗传育种研究提供技术支撑。

【参考文献】:
期刊论文
[1]基于SSR标记的不同优势等级云南松遗传多样性分析[J]. 蔡年辉,许玉兰,王亚楠,陈诗,汪梦婷,李根前.  植物研究. 2019(01)
[2]利用SSR标记构建枸杞品种分子身份证[J]. 尹跃,赵建华,安巍,李彦龙,何军,曹有龙.  生物技术通报. 2018(09)
[3]枸杞品种SSR荧光指纹图谱构建及遗传关系分析[J]. 尹跃,安巍,赵建华,李彦龙,樊云芳,曹有龙.  西北林学院学报. 2017(01)
[4]黑果枸杞抗逆性及栽培育种研究进展[J]. 刘丽萍,张东智,张冲,陈金焕.  生物技术通报. 2016(10)
[5]新疆枸杞种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建[J]. 查美琴,赵玉玲,李疆,朱瑜,罗淑萍,胡月.  植物遗传资源学报. 2016(06)
[6]黑果枸杞色素研究进展[J]. 金玲,娄涛涛,陈天强,张旭.  亚太传统医药. 2016(05)
[7]十七份中美枸杞材料的SSR遗传多样性[J]. 胡秉芬,张宝琳,蔡国军,王三英,仲玲玲,武蕾.  北方园艺. 2016(01)
[8]柴达木地区野生黑果枸杞种群遗传多样性的AFLP分析[J]. 王锦楠,陈进福,陈武生,周新洋,许东,李际红,亓晓.  植物生态学报. 2015(10)
[9]利用SSR技术对十七份枸杞材料进行遗传多样性分析及标准指纹图谱构建[J]. 邵千顺,高磊,南雄雄,徐美隆,李永华,王锦秀.  北方园艺. 2015(12)
[10]黑果枸杞资源分布及其经济价值[J]. 韩丽娟,叶英,索有瑞.  中国野生植物资源. 2014(06)

硕士论文
[1]枸杞品种(系)分子鉴定及亲缘关系分析[D]. 尹跃.福建农林大学 2013
[2]黑果枸杞果实多糖的制备与抗疲劳、降血糖生物功效的研究[D]. 陈晓琴.新疆师范大学 2007



本文编号:3562643

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