陆地棉SPL基因家族的全基因组鉴定及表达分析

发布时间：2022-12-06 23:54

　　利用生物信息学方法对陆地棉SPL基因家族进行了全基因组鉴定,共鉴定到30个家族成员,对它们的理化性质、亚细胞定位和二级结构进行了预测分析,并构建了陆地棉SPL基因的系统进化树。研究表明:陆地棉中SPL基因编码氨基酸的数量为141～1081,平均为527.9,相对分子质量介于16.11～119.59 kDa,等电点为5.25～9.88;二级结构主要元件为无规则卷曲,系统发育分析发现其分为6个亚群,结合基因结构和保守基序发现SPL基因高度保守;组织表达模式表明,有9个基因在各组织中的表达量很高,其中GhirD08G004350在花瓣中高表达。探讨了SPL基因家族在主要栽培种陆地棉中的进化及功能,为SPL基因克隆及后续重要的生物学功能研究提供借鉴与参考。</sub> 

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 SPL基因的鉴定
    1.2 陆地棉SPL基因家族成员的特性、基因结构与染色体定位分析
    1.3 多序列比对与系统进化树的构建
    1.4 陆地棉SPL家族基因的表达模式分析
2 结果与分析
    2.1 SPL家族成员的鉴定和理化分析
    2.2 SPL的系统进化分析
    2.3 SPL基因家族的结构
    2.4 SPL基因在染色体上的定位
    2.5 SPL的二级结构分析
    2.6 SPL基因的表达模式分析
3 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]菠萝SPL基因家族全基因组鉴定及其在开花诱导中的表达分析[J]. 潘晓璐,张秀梅,许婷婷,侯世贵,张红娜.  分子植物育种. 2020(20)
[2]SPL调控因子在植物生长调控的研究进展[J]. 陈婉冰,周波.  分子植物育种. 2020(05)
[3]SPL转录因子调控植物花发育及其分子机制研究进展[J]. 田晶,赵雪媛,谢隆聖,权晋谊,姚连梅,王国东,郑要强,刘雪梅.  南京林业大学学报(自然科学版). 2018(03)
[4]毛竹SBP转录因子基因的全基因组鉴定和表达分析[J]. 孙化雨,杨意宏,娄永峰,李利超,赵韩生,王思宁,高志民.  基因组学与应用生物学. 2017(10)
[5]玉米中SBP-box基因家族的生物信息学分析[J]. 王维维,单玲玲,芮道晨.  基因组学与应用生物学. 2017(01)



本文编号：3711855