细粒棘球绦虫Eg18抗原表位预测

发布时间：2018-04-18 00:25

  本文选题：细粒棘球绦虫 + 抗原　； 参考：《中国公共卫生》2017年05期

【摘要】：目的通过生物信息学技术预测细粒棘球绦虫Eg18抗原B、T细胞表位,为细粒棘球绦虫筛选具有保护性抗原表位的抗原提供理论基础。方法使用Expasy系统预测理化性质;二、三级结构的预测使用在线预测网站Predict Protein;通过在线软件ABCpred、LEPS结合二级结构、亲水性指数、表面可及性指数、柔韧性指数对B细胞表位进行预测;应用SYFPEITHI及IEDB软件预测MHC-Ⅰ类HLA-A0201限制性T细胞表位。结果 Eg18抗原二级结构中α-螺旋结构占氨基酸残基总数的98.1%,无规则卷曲占1.9%,无β-折叠结构;选出具有优势的30~41、55~71、110~126、136~144四个可能为Eg18蛋白B细胞表位的氨基酸序列区域;17~27、32~41、61~72、96~105四个较有可能形成T抗原表位的氨基酸序列区域。结论通过生物信息学预测Eg18抗原可能有4个B细胞表位且为构象表位,有4个T抗原表位,可为进一步了解Eg18抗原提供参考。
[Abstract]:Objective to predict the T cell epitopes of Eg18 antigen of Echinococcus granulosus by bioinformatics, and to provide a theoretical basis for the screening of antigens with protective epitopes of Echinococcus granulosus (Echinococcus granulosus).Methods the physicochemical properties were predicted by Expasy system, the Predict protein was used to predict the tertiary structure, the secondary structure, hydrophilic index, surface accessibility index and flexibility index were used to predict the B cell epitopes.MHC- 鈪，

本文编号：1765989