使用高通量测序技术测量人脑皮层中精神疾病候选基因mRNA等位基因表达不平衡

发布时间：2018-06-03 16:47

  本文选题：高通量测序 + 人脑皮层　； 参考：《复旦大学》2011年硕士论文

【摘要】：[目的]发展一种高通量测量人脑皮层等位基因特异mRNA表达不平衡的手段。 [方法]建立剂量敏感基因数据库。抽取总mRNA并逆转录,PCR扩增包含SNP位点的片断,连接识别片断并用Solexa Sequencing技术测序。计算等位基因的表达差异。[结果]共测量了73个和各类精神疾病相关的剂量敏感基因,其中71个取得了理想结果。与原有荧光方法相比,重复性好,测量精度显著提高。[结论]该技术是一种更理想的高通量测量等位基因表达不平衡的手段。疾病相关的剂量敏感基因中出现等位基因表达不平衡的频率较普通基因更高。
[Abstract]:Objective: to develop a high-throughput method for measuring the imbalance of allelic specific mRNA expression in human brain cortex. [methods] A dose-sensitive gene database was established. The total mRNA fragment was amplified by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and the fragment was identified and sequenced by Solexa Sequencing technique. The difference of allele expression was calculated. [results] A total of 73 dose-sensitive genes associated with various mental disorders were measured, of which 71 achieved ideal results. Compared with the original fluorescence method, the method has better repeatability and higher precision. [conclusion] this technique is an ideal method for high-throughput measurement of allelic imbalance. The frequency of unbalanced expression of alleles in disease-related dose sensitive genes was higher than that in common genes.
【学位授予单位】：复旦大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2011
【分类号】：R3416;Q78

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本文编号：1973489