ncRNA层面病毒入侵宿主机制的研究

发布时间：2018-11-21 10:53

【摘要】：目的从非编码RNA(ncRNA)的层面解析病毒入侵、病毒与宿主之间相互作用的机制。方法基于病毒相关蛋白质/ncRNA互作网络,计算网络中节点的度和介数,并采用威尔森秩和检验来比较与背景网络度和介数的显著差异情况。结果病毒相关的人类蛋白质和ncRNA在各自相应的网络和细胞死亡网络中为hub节点和bottleneck节点。那些既被病毒蛋白质又被病毒ncRNA靶向作用的人类蛋白质有着更高的度和介数,并且显著地富集在细胞死亡进程上。结论人类蛋白质和ncRNA都对病毒入侵起着重要的作用,病毒入侵宿主会影响人类宿主细胞中重要的蛋白质和ncRNA。
[Abstract]:Aim to analyze the mechanism of virus invasion and virus-host interaction at the level of non-coding RNA (ncRNA). Methods based on the virus-associated protein / ncRNA interaction network, the degree and the number of the nodes in the network were calculated, and the significant differences between the network and the background network were compared by Wilson's rank sum test. Results the virus related human protein and ncRNA were hub nodes and bottleneck nodes in their respective networks and cell death networks. Those human proteins targeted by both viral proteins and viral ncRNA have higher degrees and mediums and are significantly enriched in the process of cell death. Conclusion both human protein and ncRNA play an important role in virus invasion. Virus invading host may affect the important proteins and ncRNA. in human host cells.
【作者单位】： 哈尔滨医科大学基础医学院网络中心;哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院;
【分类号】：R373

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本文编号：2346760