长链非编码RNA的保守性及其在非模式生物长链非编码RNA筛选中的应用

发布时间：2019-09-17 06:22

【摘要】：长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)的保守性表现在一级结构、空间结构、转录位置、剪接模式及组织分布等方面,是目前lncRNA研究的热点和难点。不断深入的lncRNA保守性研究可应用于参考基因组相对匮乏的非模式生物lncRNA的筛选过程,并且极大地提升了非模式生物lncRNA数据库建立的完整性和准确性。借助针对开放阅读框长度、密码子分布与出现频率、功能性结构域等保守信息开发而来的lncRNA筛选工具或流程如CPC、PLAR(pipeline for lncRNA annotation from RNA-seq data)等,已成为目前非模式生物lncRNA的筛选及其参考数据库构建的新策略。本文就lncRNA的保守性及其在非模式生物lncRNA筛选中的应用作一综述,并简要介绍了一种运用其保守性的筛选方法——PLAR。
【作者单位】： 第二军医大学学员旅学2队;第二军医大学学员旅学员8队;山西农业大学动物科技学院;第二军医大学海军医学系海洋生物技术教研室;
【基金】：国家自然科学基金(81470518) 上海市浦江人才项目(16PJ1411000)~~
【分类号】：R3416

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 李越峰;李玉萍;李廷利;徐瑞鑫;严兴科;;果蝇作为睡眠新型模式生物的研究进展[J];时珍国医国药;2012年06期

2 王丹红;;模式生物研究关乎人类健康[J];成才之路;2011年04期

3 来松涛;魏于全;邓洪新;杨寒朔;;模式生物——爪蟾在生物医学上的应用[J];自然科学进展;2006年09期

4 李振华;Deepa Alex;徐燕玲;李铭源;;斑马鱼:新型骨骼研究模式生物[J];中药药理与临床;2010年03期

5 方肇勤;潘志强;卢文丽;刘小美;管冬元;梁超;;大鼠/小鼠是证候研究的主要模式生物[J];中国中医基础医学杂志;2009年05期

6 陈毅飞;翁建霖;莫志贤;;模式生物斑马鱼在药物依赖研究中的应用现状[J];中国药物依赖性杂志;2010年06期

7 沈琮;何琪杨;;小型模式生物在病毒作用机制研究中的应用[J];中国比较医学杂志;2011年02期

8 王广伟;李玉萍;李飞;李廷利;;睡眠研究的新型模式生物——果蝇[J];中华中医药学刊;2009年03期

9 杨丽玲;余林中;;斑马鱼——一种可用于中药抗炎免疫药理研究的模式生物[J];中药药理与临床;2012年02期

10 许大平;张在军;李铭源;;斑马鱼:构建神经退行性疾病模型的新型模式生物[J];四川生理科学杂志;2012年03期

相关会议论文 前2条

1 方芳;余林中;;斑马鱼——一种可用于中药抗焦虑药研究的模式生物[A];第十一届全国中药药理学术大会论文摘要[C];2010年

2 胡成平;;肿瘤动物模型与模式生物[A];中华医学会呼吸病学年会——2011（第十二次全国呼吸病学学术会议）论文汇编[C];2011年

相关硕士学位论文 前2条

1 刘倩;基于转录终点信号或保守性的大肠杆菌sRNA预测研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2011年

2 孙善楠;白细胞介素21结构保守性的理论分析及实验验证[D];华中师范大学;2012年

，

本文编号：2536697