白假丝酵母菌毒力相关的RAPD条带的克隆及其生物信息学分析

发布时间：2020-11-18 16:49

　　 [目的]研究与白假丝念珠菌毒力相关的RAPD电泳条带的基因信息,明确这些条带是否来源于已知的毒力调控基因。[方法]通过对相关的白假丝酵母菌重新进行RAPD-PCR,切胶回收,以回收的DNA作为模板进行大量扩增,构建TA克隆,送测序。将获得的DNA信息登录Gen Bank数据库进行比对,寻找与包含这些条带信息的蛋白质。查阅文献,进行生物信息学分析,明确条带的基因信息与已发现的白假丝酵母菌调控基因之间的关系。[结果]白假丝酵母菌RAPD的450 bp条带为Abp1p(ABP1)蛋白的基因片段。[结论]Abp1p(ABP1)基因的过表达可能与下调磷脂酶表达有关,但具体机制有待进一步研究。
【部分图文】：

采用随机引物P2对5株菌株进行RAPD扩增。根据前期研究结果，450 bp与磷脂酶、蛋白酶具有较高的相关性。该试验中，菌株1、菌株5中扩增出450 bp条带。2.2 切胶回收

经切胶回收的450 bp DNA与T载体连接后，经转化、涂板，挑取白色菌落，进行菌落PCR鉴定。其中菌株5的5-3、5-4为阳性菌落。挑取菌落5-3、5-4，经摇菌后送测序。2.4 测序结果

将上述结果在NCBI网站上使用Blast功能(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)进行比对。该结果与白假丝酵母菌SC5314的Abp1p(ABP1)蛋白编码基因相似度最高(98%)，见图5。因此，可以确定，该基因为白假丝酵母菌ABP1的编码基因。图5 测序比对结果图
【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 郭秀霞;程鹏;杨培培;王海防;刘丽娟;张崇星;王怀位;公茂庆;;淡色库蚊氨肽酶N基因的克隆及生物信息学分析[J];中国人兽共患病学报;2016年03期

2 成军;李克;陆荫英;王琳;刘妍;;丙型肝炎病毒核心蛋白结合蛋白6基因和蛋白的生物信息学分析[J];世界华人消化杂志;2003年04期

3 郭笑;陈冬雪;韩笑;魏景艳;孙晶波;徐广宇;盛瑜;安丽萍;;人谷胱甘肽过氧化物酶的生物信息学分析[J];北华大学学报(自然科学版);2016年06期

4 尹积荣;杨凯;白玉兴;王邦康;;甲状旁腺素的生物信息学分析[J];口腔医学研究;2011年07期

5 谢超;郜尽;袁运生;俞雁;;蛋白质相互作用及互作网络的生物信息学分析[J];上海交通大学学报(医学版);2009年04期

6 郭蓉;;沉默调节因子的生物信息学分析[J];黑龙江畜牧兽医;2017年09期

7 刘震;张国强;卢全伟;赵海燕;王小艳;王聪;彭仁海;;转座子的分类与生物信息学分析[J];农技服务;2016年08期

8 张小辉;朱忠珂;祁艳霞;;中华蜜蜂气味结合蛋白5,9,11,12基因克隆及生物信息学分析[J];黑龙江畜牧兽医;2010年07期

9 张爱静;张爱提;陈俊丽;黄珍粉;张小辉;;中华蜜蜂防御素基因克隆及生物信息学分析[J];特产研究;2011年02期

10 祁震宇,惠国桢,李瑶,顾少华,谢毅;一条脑胶质瘤相关的全长基因的生物信息学分析[J];江苏医药;2005年09期

相关博士学位论文 前10条

1 李子阳;体细胞基因突变高通量测序检测生物信息学分析参考物质的研究[D];北京协和医学院;2019年

2 杨波;高通量数据的生物信息学分析和一致性排序算法研究[D];武汉大学;2014年

3 张亮;重金属镉致肝癌的生物信息学分析及候选基因的功能验证[D];中国农业大学;2018年

4 马永平;含质粒人两歧双歧杆菌的分离、质粒测序和生物信息学分析[D];重庆医科大学;2005年

5 苏志熙;几种哺乳动物表达序列标签（EST）生物信息学分析[D];浙江大学;2006年

6 许波;倭蜂猴粪便微生物多样性研究及功能基因的生物信息学分析[D];云南师范大学;2015年

7 唐欣;软骨发生过程中基因表达谱的测定及生物信息学分析[D];华中科技大学;2007年

8 张高川;诱导多能干细胞和肿瘤干细胞中致瘤基因的生物信息学分析[D];苏州大学;2014年

9 李崇奇;番木瓜及巨桉等四种植物miRNA研究和生物信息学分析[D];海南大学;2014年

10 程虹;一株海洋细菌Gilvimarinus polysaccharolyticus YN3~T多相分类学研究及六株盐环境来源微生物全基因组生物信息学分析[D];浙江大学;2015年

相关硕士学位论文 前10条

1 张洪攀;基于生物信息学分析食管癌关键基因及初步验证[D];川北医学院;2019年

2 李鑫淳;向日葵锈菌金属蛋白酶基因的生物信息学分析及其原核表达[D];内蒙古农业大学;2019年

3 郝文俊;Netrin-1蛋白的结构与功能生物信息学分析[D];中国医科大学;2019年

4 高营;UNC5D蛋白的生物信息学分析[D];中国医科大学;2018年

5 黄颖;BDV-P和BDV-N与宿主相互作用的差异蛋白质鉴定及生物信息学分析[D];重庆医科大学;2018年

6 智倩;一株杆菌产脂肪酶基因的克隆及生物信息学分析[D];大连工业大学;2013年

7 曹峰;小鼠胚胎干细胞核心转录因子调控网络的生物信息学分析[D];西北农林科技大学;2008年

8 江舟;金铁锁糖基转移酶的克隆与生物信息学分析[D];云南中医学院;2016年

9 吴亚运;基于转录组的竹节参皂苷合成相关基因的克隆与生物信息学分析[D];武汉轻工大学;2017年

10 王翊;CEM15基因的生物信息学分析[D];电子科技大学;2005年

本文编号：2888949