广西乙肝病毒基因型及基因亚型流行病学分布研究
发布时间:2021-01-28 23:08
目的:研究乙肝病毒的基因型以及基因亚型在广西的流行病学分布特征,探究广西不同地区及人群中乙肝病毒基因型和基因亚型的分布特点及发展规律,为广西乙型肝炎人群防治策略的提出、医疗卫生计划和卫生政策的制定提供理论依据,为进一步研究广西地区不同HBV基因型的致病机制和临床治疗特点以及疫苗研发和接种工作提供基础数据,为肝硬化、肝癌等疾病危险因素的发现和高危人群的确定提供线索。方法:本研究采用描述性流行病学研究方法中的现况研究,以广西HBV感染人群为研究对象,分别从广西东、南、西、北、中五个区域的HBV感染人群中选取研究对象,收集被调查者的血清标本,使用荧光定量PCR的方法对血清标本中HBV DNA复制水平进行检测,提取血清中HBV DNA,采用巢式PCR的方法扩增HBV DNA S区,采用直接测序法获取S区序列,最终成功获取HBV DNA S区序列379例。使用NCBI在线病毒分型工具(genotyping tool)进行基因分型。运用ClustalX2.0软件进行核酸序列比对,使用Mega7.0构建基因亚型系统进化树确定基因亚型。使用SPSS20.0统计学软件分析数据。结果:在379例标本中,C...
【文章来源】:广西医科大学广西壮族自治区
【文章页数】:89 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
HBV基因组结构
西乙肝病毒基因型及基因亚型流行病学分布研究 2018 届硕士学位论文mformation ,NCBI ) 提 供 的 在 线 病毒 分 型 工 具 ( genotyping tool :ttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/genotyping/formpage.cgi.)进行 HBV 基分型,如图 1-1,在 Select 选项中选择 Hepatitis B virus,(HBV) ,将测序序结果粘贴至框中,点击左下角 Subtype 键,获得分型结果。
图 1-2 HBV DNA 序列比对Figue1-2 HBV DNA Sequence alignment1.6 统计学方法使用 SPSS20.0 统计学软件分析数据,HBV 基因型及基因亚型在不同地、人群中分布的结果属于计数资料,差异比较采用 Fisher 确切概率法进。HBV DNA 病毒拷贝量属于计量资料,且不服从正态分布,需经 log 对转换处理,以 Log10(HBV DNA)copies/ml 表示,转换后的数据呈正态分布,用均数±标准差描述集中趋势,经方差同质性检验,HBV 各基因型、各因亚型间病毒拷贝量均方差不齐,采用秩和检验比较不同基因型及亚型
【参考文献】:
期刊论文
[1]中国1994—2001年出生人群乙型肝炎疫苗补种前后乙型肝炎血清流行病学特征分析[J]. 王富珍,郑徽,缪宁,孙校金,张国民,梁晓峰,崔富强. 中华预防医学杂志. 2017 (06)
[2]乙型肝炎基因分型的研究进展[J]. 张桂前,高建梅,孙鹥,段勇. 国际检验医学杂志. 2016(15)
[3]Hepatitis B virus genotypes and genome characteristics in China[J]. Hong-Mei Li,Jian-Qiong Wang,Rui Wang,Qian Zhao,Li Li,Jin-Ping Zhang,Tao Shen. World Journal of Gastroenterology. 2015(21)
[4]Genotypes and viral variants in chronic hepatitis B: A review of epidemiology and clinical relevance[J]. Catherine MN Croagh,Paul V Desmond,Sally J Bell. World Journal of Hepatology. 2015(03)
[5]Epidemiology of acute and chronic hepatitis B and delta over the last 5 decades in Italy[J]. Evangelista Sagnelli,Caterina Sagnelli,Mariantonietta Pisaturo,Margherita Macera,Nicola Coppola. World Journal of Gastroenterology. 2014(24)
[6]中国人群乙型肝炎病毒基因分型不同方法和标准的比较[J]. 李可可,刘莹,姚品芳,陈真,王红,李劲. 世界华人消化杂志. 2014(16)
[7]梧州区域乙型肝炎病毒基因型分布及耐药基因自然变异调查[J]. 黄德旺,陆爱英,磨庆福,李军,谢宁,陈康部,蔡永林. 现代消化及介入诊疗. 2014(02)
[8]基于基因序列的乙型肝炎病毒基因分型方法的比较[J]. 邹淑慧,应颖,周艳,熊英,余克花,刘金辉,莫冰. 南昌大学学报(理科版). 2013(02)
[9]广西地区乙肝病毒基因分型与临床表现及机体免疫功能关系的研究[J]. 钟大妮,李国坚,吴继周,吴健林,宁秋悦,李红玉,刘芳. 中国医学创新. 2013(02)
[10]新疆维吾尔族慢性乙型肝炎患者HBV基因型及亚型分析[J]. 聂晶晶,闫玲,李卓,希尔娜依·阿不都黑力力,金晖,孙奎霞,李杰,庄辉. 中国预防医学杂志. 2010(07)
博士论文
[1]广西肝癌高发区和低发区HBV基因型分布和全基因变异研究[D]. 何雨.广西医科大学 2016
本文编号:3005857
【文章来源】:广西医科大学广西壮族自治区
【文章页数】:89 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
HBV基因组结构
西乙肝病毒基因型及基因亚型流行病学分布研究 2018 届硕士学位论文mformation ,NCBI ) 提 供 的 在 线 病毒 分 型 工 具 ( genotyping tool :ttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/genotyping/formpage.cgi.)进行 HBV 基分型,如图 1-1,在 Select 选项中选择 Hepatitis B virus,(HBV) ,将测序序结果粘贴至框中,点击左下角 Subtype 键,获得分型结果。
图 1-2 HBV DNA 序列比对Figue1-2 HBV DNA Sequence alignment1.6 统计学方法使用 SPSS20.0 统计学软件分析数据,HBV 基因型及基因亚型在不同地、人群中分布的结果属于计数资料,差异比较采用 Fisher 确切概率法进。HBV DNA 病毒拷贝量属于计量资料,且不服从正态分布,需经 log 对转换处理,以 Log10(HBV DNA)copies/ml 表示,转换后的数据呈正态分布,用均数±标准差描述集中趋势,经方差同质性检验,HBV 各基因型、各因亚型间病毒拷贝量均方差不齐,采用秩和检验比较不同基因型及亚型
【参考文献】:
期刊论文
[1]中国1994—2001年出生人群乙型肝炎疫苗补种前后乙型肝炎血清流行病学特征分析[J]. 王富珍,郑徽,缪宁,孙校金,张国民,梁晓峰,崔富强. 中华预防医学杂志. 2017 (06)
[2]乙型肝炎基因分型的研究进展[J]. 张桂前,高建梅,孙鹥,段勇. 国际检验医学杂志. 2016(15)
[3]Hepatitis B virus genotypes and genome characteristics in China[J]. Hong-Mei Li,Jian-Qiong Wang,Rui Wang,Qian Zhao,Li Li,Jin-Ping Zhang,Tao Shen. World Journal of Gastroenterology. 2015(21)
[4]Genotypes and viral variants in chronic hepatitis B: A review of epidemiology and clinical relevance[J]. Catherine MN Croagh,Paul V Desmond,Sally J Bell. World Journal of Hepatology. 2015(03)
[5]Epidemiology of acute and chronic hepatitis B and delta over the last 5 decades in Italy[J]. Evangelista Sagnelli,Caterina Sagnelli,Mariantonietta Pisaturo,Margherita Macera,Nicola Coppola. World Journal of Gastroenterology. 2014(24)
[6]中国人群乙型肝炎病毒基因分型不同方法和标准的比较[J]. 李可可,刘莹,姚品芳,陈真,王红,李劲. 世界华人消化杂志. 2014(16)
[7]梧州区域乙型肝炎病毒基因型分布及耐药基因自然变异调查[J]. 黄德旺,陆爱英,磨庆福,李军,谢宁,陈康部,蔡永林. 现代消化及介入诊疗. 2014(02)
[8]基于基因序列的乙型肝炎病毒基因分型方法的比较[J]. 邹淑慧,应颖,周艳,熊英,余克花,刘金辉,莫冰. 南昌大学学报(理科版). 2013(02)
[9]广西地区乙肝病毒基因分型与临床表现及机体免疫功能关系的研究[J]. 钟大妮,李国坚,吴继周,吴健林,宁秋悦,李红玉,刘芳. 中国医学创新. 2013(02)
[10]新疆维吾尔族慢性乙型肝炎患者HBV基因型及亚型分析[J]. 聂晶晶,闫玲,李卓,希尔娜依·阿不都黑力力,金晖,孙奎霞,李杰,庄辉. 中国预防医学杂志. 2010(07)
博士论文
[1]广西肝癌高发区和低发区HBV基因型分布和全基因变异研究[D]. 何雨.广西医科大学 2016
本文编号:3005857
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