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广东省中山市库蠓形态与分子鉴定

发布时间:2021-12-30 14:40
  目的采用形态与分子的鉴定方法对在中山市不同生境采集的库蠓进行鉴定,明确中山市库蠓的种类。方法 2018年4月至2019年3月在中山市采集库蠓样本,采用不损伤外部形态的方法提取基因组DNA,用线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COI)基因和线粒体DNA细胞色素b(Cytb)基因特异引物进行PCR扩增和序列测定,用DNAMAN V6和Mega 6.1软件进行构建N-J树。然后将库蠓虫体压片,在体视显微镜下进行形态学鉴定。结果共采集到的104只库蠓,鉴定结果为原野库蠓Culicoides homotomus、苏岛库蠓Culicoides sumatrae、异域库蠓Culicoides peregrinus、琉球库蠓Culicoides actoni、残肢库蠓Culicoides imicola、连斑库蠓Culicoides jacobsoni、抚须库蠓Culicoides palpifer、荒川库蠓Culicoides arakawai、环斑库蠓Culicoides circumscriptus、尖喙库蠓Culicoides oxystoma、霍飞库蠓Culicoides huffi、似同库蠓C... 

【文章来源】:中国人兽共患病学报. 2019,35(11)北大核心CSCD

【文章页数】:8 页

【部分图文】:

广东省中山市库蠓形态与分子鉴定


12种库蠓一侧翅图

模型图,库蠓,模型


将本研究12种库蠓的全部Cytb序列与GenBank数据库中的序列进行同源比对,荒川库蠓、残肢库蠓Cytb序列相似度皆大于98%,说明该2种库蠓的形态鉴定结果与GenBank数据库中的Cytb基因序列比对结果一致。其余10种库蠓原野库蠓、苏岛库蠓、异域库蠓、琉球库蠓、残肢库蠓、连斑库蠓、抚须库蠓、荒川库蠓、环斑库蠓、尖喙库蠓、霍飞库蠓、似同库蠓在GenBank中均未收录有Cytb基因序列。2.3.3 Cytb聚类分析

模型图,模型,库蠓,种类


基于Cytb聚类分析表明(图3),不同种类蠓间无交叉,且相同种类蠓的不同个体均聚在同一分支下,支持率均达到99%,说明Cytb基因在不同蠓种间有明显差异,可以用于鉴定和区分蠓种。库蠓属与蠛蠓属、铗蠓属、裸蠓属、阿蠓属混在不同支序内,但因支持度低(<10%),无法说明其亲缘关系,说明Cytb不适合进行系统进化关系分析,对上述4属并入库蠓属的现象,与本研究COI聚类分析的研究结果一致。抚须库蠓、霍飞库蠓、荒川库蠓、环斑库蠓雌虫Cytb基因序列与雄虫序列聚在同一分支下且相似度98%以上,说明同一种的雌雄库蠓之间Cytb基因的差异小于种间的差异,可以用于雌虫的种类鉴定。3 讨 论

【参考文献】:
期刊论文
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[10]线粒体DNA基因序列在昆虫分子系统学研究中的应用[J]. 王德明,林杨.  广东农业科学. 2010(06)



本文编号:3558405

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