CD40 -1CT多态性位点与脑卒中发生的风险预测分析和Chd7基因诱变小鼠模型的差异表达基因验证
发布时间：2022-01-23 12:21
脑卒中是最常见的一种危害极大的急性疾病,指由血管堵塞导致血液无法把氧气供给脑部引起神经组织因缺氧而损伤,或者由脑部血管破裂血细胞流入神经组织引起损伤的一类疾病。截止2017年1月,我国共有大于1100万脑卒中患者,每年新增约240万患者,每年约110万病人因脑卒中致死。脑卒中可分为缺血性脑卒中出血性脑卒中两大类,其中缺血性脑卒中约占80%。家系、双胞胎、动物实验的研究表明,遗传因素是脑卒中发生的重要风险因素。CD40/CD40L在人体免疫反应、炎症反应和凝血过程中发挥重要作用,CD40基因是脑卒中发生的潜在风险因子。CD40-1C>T单核苷酸多态性位点位于CD40基因的Kozak序列,研究表明该位点的变异影响CD40蛋白的表达。本文通过病例-对照实验,选择CD40-1C>T单核苷酸多态性位点在由498例脑卒中患者（338例缺血性脑卒中和160例出血性脑卒中）和498例健康对照组成的中国汉族人口样本中进行关联分析。经过协变量的回归方程校正,发现CD40-1C>T位点与整体脑卒中(Padjusted=0.001,OR=1.41[95%CI=1.15-...
【文章来源】：上海交通大学上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
脑卒中发病的风险因素Figure1-1Riskfatorofstroke
信度高、成本较低，缺点是只适合做少量样本的测的分型技术有 TaqMan 探针法和 HRM（High R线）法。TaqMan 探针法是当前应用最广的高通量 一段首尾分别为荧光基团和淬灭物、包含 SNP 位与淬灭物同处在探针上是，淬灭物使荧光基团不PCR 反应中聚合酶将探针酶切，发光基团脱离发便能识别样本的基因型，SNP 分型需要加入两个TaqMan 分型原理如图 1-3 所示。TaqMan 分型在具有明显的优势，灵敏度高，分型结果稳定、可靠，片价格较高，且探针的定制周期长。方法运用实时定量荧光 PCR（Real-Time PCR）技线，检测 DNA 片段的微小差异。HRM 分型技术、成本低等优点，但是对 120bp 以上长度的片段对 G/C 的区分效果不好，因此应用受到一定的限
图 1-3 CHD7 蛋白结构模式图Figure 1-3 Schematic representation of CHD7 proteinCHD7 蛋白在几种模式生物中都是同源的，包括果蝇、斑马鱼和小鼠。在体内（in vivo）和体外（in vitro）系统研究中，研究者们发现了 CHD 家族蛋白的许多功能，比如结合甲基化组蛋白[47-49]（methylated histone binding）、结合 DNA[50-52]（DNA binding）、转录调控[48, 49, 53-56]、细胞循环调控[48, 57]、细胞凋亡调控[58, 59]、染色质重构[45, 52, 57, 60-62]和胚胎干细胞多能性[63]。CHD 蛋白家族有两个核心结构，一为 N-末端染色质域的串联，这一结构赋予CHD 家族蛋白结合甲基化组蛋白的功能[64]；二为类似于 SNF2 结构域的 ATP 酶/解旋酶结构域，这一结构具有染色质重构活性。CHD 蛋白家族的九个成员都有这两个结构，而根据成员含有的其他结构域的不同，又能把该家族分成三个亚组[65, 66]：（1）CHD1 和 CHD2 ；（2）CHD3、CHD4 和 CHD5；（3）CHD6、CHD7、CHD8和 CHD9。研究者在人类中进行的 Chd7 基因表达分析中发现，在胚胎发育的前 22 天，Chd7 基因的表达无处不在，之后在与 CHARGE 综合症相关的组织中检测到 Chd7
【参考文献】：
期刊论文
[1]CD40/CD40L基因及其多态性与动脉粥样硬化的研究进展[J]. 吴甜,郭韧,张毕奎. 中南大学学报(医学版). 2012(04)
本文编号：3604338
【文章来源】：上海交通大学上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
脑卒中发病的风险因素Figure1-1Riskfatorofstroke
信度高、成本较低，缺点是只适合做少量样本的测的分型技术有 TaqMan 探针法和 HRM（High R线）法。TaqMan 探针法是当前应用最广的高通量 一段首尾分别为荧光基团和淬灭物、包含 SNP 位与淬灭物同处在探针上是，淬灭物使荧光基团不PCR 反应中聚合酶将探针酶切，发光基团脱离发便能识别样本的基因型，SNP 分型需要加入两个TaqMan 分型原理如图 1-3 所示。TaqMan 分型在具有明显的优势，灵敏度高，分型结果稳定、可靠，片价格较高，且探针的定制周期长。方法运用实时定量荧光 PCR（Real-Time PCR）技线，检测 DNA 片段的微小差异。HRM 分型技术、成本低等优点，但是对 120bp 以上长度的片段对 G/C 的区分效果不好，因此应用受到一定的限
图 1-3 CHD7 蛋白结构模式图Figure 1-3 Schematic representation of CHD7 proteinCHD7 蛋白在几种模式生物中都是同源的，包括果蝇、斑马鱼和小鼠。在体内（in vivo）和体外（in vitro）系统研究中，研究者们发现了 CHD 家族蛋白的许多功能，比如结合甲基化组蛋白[47-49]（methylated histone binding）、结合 DNA[50-52]（DNA binding）、转录调控[48, 49, 53-56]、细胞循环调控[48, 57]、细胞凋亡调控[58, 59]、染色质重构[45, 52, 57, 60-62]和胚胎干细胞多能性[63]。CHD 蛋白家族有两个核心结构，一为 N-末端染色质域的串联，这一结构赋予CHD 家族蛋白结合甲基化组蛋白的功能[64]；二为类似于 SNF2 结构域的 ATP 酶/解旋酶结构域，这一结构具有染色质重构活性。CHD 蛋白家族的九个成员都有这两个结构，而根据成员含有的其他结构域的不同，又能把该家族分成三个亚组[65, 66]：（1）CHD1 和 CHD2 ；（2）CHD3、CHD4 和 CHD5；（3）CHD6、CHD7、CHD8和 CHD9。研究者在人类中进行的 Chd7 基因表达分析中发现，在胚胎发育的前 22 天，Chd7 基因的表达无处不在，之后在与 CHARGE 综合症相关的组织中检测到 Chd7
【参考文献】：
期刊论文
[1]CD40/CD40L基因及其多态性与动脉粥样硬化的研究进展[J]. 吴甜,郭韧,张毕奎. 中南大学学报(医学版). 2012(04)
本文编号：3604338
本文链接：https://www.wllwen.com/xiyixuelunwen/3604338.html
最近更新
教材专著
