识别疾病相关miRNA和gene的方法研究

发布时间：2022-01-26 05:05

　　Micro RNA（mi RNA）是一类内生的小的非编码基因,在转录后调控以及其他重要生物过程中起重要作用。最近,积累的证据表明mi RNA广泛参与各种疾病。因此,识别疾病相关的mi RNA可以帮助我们了解疾病潜在的发病机制并且可以帮助我们识别新的生物标志。然而,由于其广泛参与各种生物过程,识别出哪些mi RNA与哪种疾病相关是非常不易的。识别人类疾病基因（gene）在生物医学研究中是一项重要的工作,除了直接识别个体疾病基因的实验和临床方法外,还有越来越多的方法通过计算方法预测更多的疾病基因。在本文中,我们分别提出两种方法来识别疾病相关的mi RNA和gene,我们首先提出了一种名为mi R_Sub Path的新方法,通过三个步骤来鉴定疾病相关的mi RNA。候选基因来自于功能失调的显著子通路,然后根据mi RNA和基因关联确定候选mi RNA。最后,根据这些候选mi RNA在功能相似性网络中与一些种子mi RNA的功能相似分数来进行排序。实际数据集的结果显示,所提出的mi R_Sub Path方法比先前的方法更强健并且可以鉴定更多的疾病相关的m... 

【文章来源】：温州大学浙江省

【文章页数】：56 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

根据子通路和miRNA功能相似性网络识别疾病相关miRNA的主要工作流程

图 3-1 在基本模型和三个条件模型中检测到的 10 个显著位点Figure 3-1 The ten significant loci detected in the basic model and the threeconditional models图 3-1 中圆点是加性效应，红色，绿色和蓝色分别表示纯加性效应，种族特

候选基因的遗传结构

【参考文献】：
期刊论文
[1]急性心肌梗死和急性脑梗死miRNA疾病标志物的初步筛查[J]. 杜守治,董斌,齐中华.  中国医科大学学报. 2017(08)
[2]miRNA-146a与肺部疾病的研究进展[J]. 李文婷,刘真,贾赤宇.  中华损伤与修复杂志(电子版). 2014(04)
[3]全基因组关联分析对银屑病遗传学研究的启示[J]. 张学军.  浙江大学学报(医学版). 2009(04)
[4]生物信息学:融合生物科学与计算机科技的新学科[J]. 陈颖健.  求是. 2003(07)

博士论文
[1]基于HMM方法的蛋白质局部片段结构属性的预测研究[D]. 余建勇.上海交通大学 2013
[2]基于图和复杂网络理论的蛋白质相互作用数据分析与应用研究[D]. 尤著宏.中国科学技术大学 2010
[3]基因组转录调控元件的特征分析与识别算法研究[D]. 杜耀华.国防科学技术大学 2006



本文编号：3609872